导读:本文包含了线性表位论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:蛋白,细胞,抗原,病毒,线性表,球蛋白,狂犬病。
线性表位论文文献综述
羊红光,成彬[1]（2019）在《MLEP:一种B细胞线性表位预测方法》一文中研究指出为了更快更准地确定B细胞线性表位,提出了一种新的预测方法——MLEP(Prediction of epitope based on MCFS and LSTM,MLEP)算法。采用5种性质氨基酸理化性质作为学习特征,利用多聚类特征选择算法进行特征选择,用降维后的数据作为输入,用长短期记忆网络进行训练,获得预测性能好的模型,对多聚类特征选择算法及MLEP算法的性能进行评价。对非冗余LBtope数据集进行多组实验,结果表明,使用多聚类特征选择算法降维到25时获取性能最优模型,多聚类特征选择算法比主成分分析法获得的模型准确率更高,基于MLEP算法获得的模型准确率达到94.81%。因此,MLEP算法能更好地预测B细胞线性表位,对于表位预测研究具有一定的参考价值。(本文来源于《河北工业科技》期刊2019年05期）
侯逸琳[2]（2019）在《基于支持向量机的B细胞线性表位预测模型》一文中研究指出B细胞表位预测在蛋白抗体制备、疫苗设计中都具有重要的应用。基于支持向量机方法设计了一个B细胞线性表位预测模型,运用了多群集特征选择算法进行特征选择,有效提高了预测准确率。(本文来源于《河北省科学院学报》期刊2019年02期）
刘英杰,李凤平,董世娟,王瑞阳,于瑞嵩[3]（2019）在《猪流行性腹泻病毒流行株S蛋白高变区B细胞线性表位肽的鉴定》一文中研究指出【背景】对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)经典毒株与流行毒株S蛋白氨基酸序列比对显示,变异位点主要集中在S蛋白的N端。【目的】鉴定PEDV流行毒株S蛋白高变区(S10A,1-496 aa)的B细胞线性表位肽,特别是流行毒株特异性B细胞表位肽。【方法】以SDS-PAGE割胶纯化大肠杆菌表达的PEDV流行株SD2014 S蛋白高变区片段(S10ASD2014),免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体;在E. coli中谷胱甘肽巯基转移酶(Glutathione S-transferase,GST)融合表达覆盖S10ASD2014序列全长且彼此重迭8个氨基酸残基的系列16肽。以制备的抗S10ASD2014多抗为一抗,通过Western blot筛选系列16肽中的阳性反应性16肽,鉴定S10ASD2014上的B细胞线性表位肽;利用抗PEDV经典毒株(CV777)S蛋白高变区片段(S10ACV777)多抗血清鉴定S10ASD2014上的保守性B细胞线性表位肽。【结果】重组表达的S10ASD2014相对分子质量约为72 kD;纯化的S10ASD2014表位肽能被PEDV阳性血清识别。制备的抗S10ASD2014多抗可以识别PEDV DR13弱毒株。利用抗S10ASD2014血清和抗S10ACV777血清从61个GST融合表达的16肽中鉴定到28个阳性反应16肽,其中13个为2种血清共同识别16肽。对24株PEDV不同亚群代表毒株的对应区域进行同源性分析表明2个阳性16肽为保守性表位肽。【结论】确定了PEDV流行株SD2014 S蛋白高变区的B细胞线性表位肽,B细胞线性表位肽,特别是流行毒株特异性表位肽的确定有助于了解S蛋白的结构与功能,为建立以表位为基础的PEDV感染检测方法打下良好基础。(本文来源于《微生物学通报》期刊2019年07期）
胡志和,王丽娟,薛璐,刘平,贾莹[4]（2019）在《超高压结合胰蛋白酶消减虾原肌球蛋白致敏性及其抗原线性表位残留》一文中研究指出比较常压下酶水解与超高压下酶水解虾原肌球蛋白(tropomyosin,TM)的致敏性差异及线性表位的残留,探讨超高压下酶水解TM增强致敏性消减效果的原因。采用间接酶联免疫吸附测定法检测TM致敏性,傅里叶变换红外光谱和荧光光谱法检测TM二级和叁级结构;以致敏性(OD_(492 nm))为指标,确定常压和超高压下酶水解TM的条件;采用质谱法检测水解片段的氨基酸序列。结果表明,在40℃、200 MPa下,保压时间30 min有利于胰蛋白酶活力的提高;压力在100～600 MPa内,TM致敏性随压力升高而降低,其致敏性与二级结构中β-转角的相对含量及叁级结构的变化有关;在常压下(40℃、酶添加量3 000 U/g、水解30 min),TM水解产物的致敏性消减率为89%,水解产物中含8～16个氨基酸残基的片段数量占76.8%,且线性表位的消减率为60.0%～66.7%;在超高压下(40℃、酶添加量3 000 U/g、200 MPa下水解30 min),TM水解产物的致敏性消减率为98%,水解产物中含8～16个氨基酸残基的片段数量占93.3%,且线性表位的消减率为88.9%～90.0%。因此,超高压可以促进酶水解TM,有利于线性表位的消除,从而降低水解产物的致敏性。(本文来源于《食品科学》期刊2019年21期）
高柳莺,祝苗,戎浩,董长征[5]（2019）在《人肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型B细胞线性表位的生物信息学预测》一文中研究指出发展了人肠道病毒B细胞线性表位(简称线性表位)的生物信息学预测算法,系统性地预测和比较了人肠道病毒71型(Enterovirus71,EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxsackievirusA16,CVA16)的线性表位.结果显示:EV71和CVA16结构蛋白(Viral Protein, VP)上都有16个线性表位,2种肠道病毒的线性表位的位置高度一致,但氨基酸序列保守性较低,大多数表位都存在至少3个氨基酸残基的差异,提示2种病毒的线性表位具有血清型特异性,这很可能是两者不能交叉反应的原因.线性表位主要分布在β链之间的环上和C-末端,分别有13个(81.3%)和2个(12.5%)表位.与文献报道相比较,16个线性表位中,分别有6个(37.5%) EV71和12个(75%) CVA16的表位已被实验验证.特别是实验研究重点关注的VP1,6个预测表位中,分别有4个(66.7%) EV71的预测表位和5个(83.3%)CVA16的预测表位已被实验所验证.说明算法具有较高的预测可靠度.线性表位的实验研究主要集中在VP1,预测结果提示VP2和VP3也能形成表位,应该加以重视.生物信息学算法通过预测和筛选潜在的线性表位,能够大大降低实验负荷,为包括EV71和CVA16在内的人肠道病毒的研究提供有力支持.对肠道病毒线性表位的预测,有助于更好地监测和预警手足口病疫情,辅助疫苗的研发和准备.(本文来源于《宁波大学学报(理工版)》期刊2019年02期）
赵微,田志军,王倩,倪宏波,彭金美[6]（2018）在《猪伪狂犬病病毒HeN1株gB蛋白单克隆抗体的制备及B细胞线性表位鉴定》一文中研究指出为制备抗猪伪狂犬病病毒(PRV)gB蛋白的单克隆抗体(MAb),本研究将PRV HeN1株全病毒免疫BALB/c小鼠,取免疫后小鼠的脾细胞与骨髓瘤细胞SP2/0融合,用间接免疫荧光方法筛选,获得了一株稳定分泌抗PRV g B蛋白的杂交瘤细胞株1E7。Western blot结果显示,MAb 1E7与PRV全病毒和真核表达的g B蛋白均能够反应。阻断ELISA试验显示MAb 1E7与PRV的结合可以被猪阳性血清阻断。抗体亚类鉴定显示MAb 1E7的重链为Ig G2b亚类,轻链为kappa链。利用大肠杆菌原核表达系统,表达一系列截短的g B蛋白,最终确定1E7识别的抗原表位是~(81)SAEESLE~(87)。序列分析和western blot结果表明该表位在各PRV病毒株间相对保守。该MAb的制备为建立具有广泛适用性检测PRV野毒感染和疫苗免疫效果评价的阻断ELISA方法奠定了基础。(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2018年09期）
张峥嵘,张玉晴,许如苏,许晓升[7]（2018）在《副溶血性弧菌外膜蛋白K的B细胞线性表位预测》一文中研究指出目的预测副溶血性弧菌外膜蛋白K(OmpK)的B细胞线性表位。方法 NCBI下载已登录的OmpK的基因序列,对其进行生物信息学分析,应用DNAStar protean软件综合分析OmpK蛋白的二级结构、柔性、表面可能性、亲水性和抗原指数等多种参数,预测其B细胞线性表位。结果 OmpK蛋白的优势B细胞线性表位位于肽链的第7-13、25-36、63-69、140-147、182-188、234-239区段。结论预测得到OmpK蛋白的6个优势B细胞线性表位,为进而克隆表达串联表位蛋白,研制副溶血性弧菌多表位疫苗奠定基础。(本文来源于《中国微生态学杂志》期刊2018年07期）
赵微[8]（2018）在《猪伪狂犬病病毒HeN1株gB蛋白单克隆抗体制备及B细胞线性表位鉴定》一文中研究指出伪狂犬病(Pseudorabies)是由伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)引起的各种家畜及野生动物以发热、奇痒及脑脊髓炎为特征的急性传染病。该病自1947年传入我国,通过疫苗免疫疫情基本呈稳定状态。2011年以后,以HeN1株为代表的变异株在全国多个地区爆发流行,原有疫苗不能对猪群提供完全保护,这对伪狂犬病的监控及病原结构的研究提出了新的要求。猪伪狂犬病毒gB糖蛋白具有很好得保守性,通过检测gB蛋白可以反映猪群的抗体水平。本实验目的是制备抗PRV gB蛋白的单克隆抗体并鉴定其抗原表位。以超离纯化的PRV HeN1株全病毒为抗原免疫6周龄BALB/c小鼠,取免疫后血清抗体呈阳性的小鼠脾细胞与骨髓瘤细胞SP2/0融合,用免疫荧光的方法(IFA)筛选阳性杂交瘤细胞,经过4次亚克隆获得一株稳定分泌抗PRV gB蛋白单克隆抗体的杂交瘤细胞株1E7。Western blot结果表明,1E7细胞分泌的单克隆抗体与PRV全病毒和真核表达的gB蛋白均能反应。抗体亚类鉴定1E7细胞分泌的单抗重链属于IgG2b亚类,轻链为kappa链。ELISA试验显示1E7细胞分泌的单抗与PRV的结合可以被猪阳性血清阻断。杂交瘤细胞培养上清和制备的腹水中抗体的IFA效价分别为1:160和1:12800。利用大肠杆菌原核表达系统,表达一系列gB截短蛋白,最终确定1E7细胞分泌的单抗识别的抗原表位是S~(81)AEESLE~(87),且此表位在各PRV毒株间相对保守。本单克隆抗体的成功制备为PRV抗体检测方法的建立及gB蛋白的结构和功能研究提供了实验材料。(本文来源于《黑龙江八一农垦大学》期刊2018-06-01）
丛艳君,李晔,刘家琦,陈澍,于晓凤[9]（2018）在《牛乳α-乳白蛋白免疫球蛋白G线性表位的关键氨基酸识别》一文中研究指出α-乳白蛋白是牛乳中的主要过敏原,开展α-乳白蛋白表位定位及氨基酸特性研究可深入了解过敏原的致敏机理,有助于更好地认识免疫球蛋白G(immunoglobulin G,Ig G)在乳过敏反应中的作用,为制备低过敏乳制品提供理论指导。本研究采用丙氨酸免疫表位扫描技术识别α-乳白蛋白的关键氨基酸,即用牛乳过敏患者血清中Ig G识别α-乳白蛋白系列合成的多肽,筛选作用表位,然后用丙氨酸依次取代作用表位的氨基酸合成新的多肽,以牛乳过敏患者血清池为抗体识别关键氨基酸。结果表明:α-乳白蛋白Ig G作用表位的氨基酸序列定位为aa6~20、aa21~35、aa36~50和aa86~100;关键氨基酸为第9位的苯丙氨酸、第15位的亮氨酸、第24位的脯氨酸、第26位的色氨酸和第32位的组氨酸。(本文来源于《食品科学》期刊2018年07期）
孙赵洋[10]（2017）在《大豆抗原蛋白β-conglycinin线性表位与不同种属动物过敏血清结合能力的比较》一文中研究指出近年来通过对大豆抗营养物质的不断深入研究,发现日粮中抗营养物质β-conglycinin会引发多种幼龄动物产生过敏反应,而且不同种属动物的过敏程度也不同。有研究表明β-conglycininβ亚基线性表位与兔、仔猪、狗、鲈鱼过敏血清结合能力有显著差异,但对于β-conglycininα亚基线性表位与不同种属动物过敏血清结合能力差异比较的研究较少。本论文利用生物信息学方法,综合已发表文献选取四段比较具代表性氨基酸序列,合成四段表位肽,通过ELISA和点杂交的方法研究比较不同种属动物过敏血清与表位肽结合程度,进而研究大豆抗原蛋白β-conglycinin线性表位与其不同种属物产生抗原表位差异比较。试验Ⅰ:生物信息学预测β-conglycinin抗原表位的研究本试验运用DNAstar,the BepiPred 1.0两种生物信息学软件,根据蛋白质的一些理化性质如抗原指数、柔韧性、亲水性、表面可及性等预测β-conglycininα和β亚基的线性表位,并综合已发表文献筛选出四段比较具有代表性的氨基酸序列。试验Ⅱ:β-conglycinin与不同种属动物过敏血清结合能力差异比较本试验依据抗原与抗体特异性反应的原理,将合成的短肽作为抗原,兔、仔猪、犊牛的致敏血清作为抗体,通过Elisa和点杂交方法比较四段表位肽与兔、仔猪、犊牛过敏血清结合能力差异,从而对比β-conglycinin线性表位与不同种属动物过敏血清结合能力差异的研究,结果表明:同一种动物与四段不相同合成肽段结合敏感程度有显着差异(P<0.05),兔过敏血清与肽段β1结合能力最强,仔猪过敏血清与α1肽段结合能力最强,犊牛过敏血清与肽段β2肽段结合能力最强;不同种属动物与同一肽段结合敏感程度有显着差异(P<0.05),肽段α1与犊牛血清结合能力最强,肽段α2与仔猪、犊牛过敏血清结合能力相对较强,肽段β1与叁种动物过敏血清反应无明显差异,肽段β2与犊牛血清结合能力最强。综上所述:生物信息学相关软件可以比较快速准确地预测出抗原表位所在区域,ELISA和点杂交方法证明β-conglycinin的四段表位肽与叁种不同种属动物过敏血清的结合能力有显着差别,本研究为揭示不同种属动物对大豆抗原蛋白致敏差异的相关机制奠定理论基础,也为优化抗原蛋白检测方法提供技术支持。(本文来源于《吉林农业大学》期刊2017-05-01）
线性表位论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
B细胞表位预测在蛋白抗体制备、疫苗设计中都具有重要的应用。基于支持向量机方法设计了一个B细胞线性表位预测模型,运用了多群集特征选择算法进行特征选择,有效提高了预测准确率。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
线性表位论文参考文献
[1].羊红光,成彬.MLEP:一种B细胞线性表位预测方法[J].河北工业科技.2019
[2].侯逸琳.基于支持向量机的B细胞线性表位预测模型[J].河北省科学院学报.2019
[3].刘英杰,李凤平,董世娟,王瑞阳,于瑞嵩.猪流行性腹泻病毒流行株S蛋白高变区B细胞线性表位肽的鉴定[J].微生物学通报.2019
[4].胡志和,王丽娟,薛璐,刘平,贾莹.超高压结合胰蛋白酶消减虾原肌球蛋白致敏性及其抗原线性表位残留[J].食品科学.2019
[5].高柳莺,祝苗,戎浩,董长征.人肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型B细胞线性表位的生物信息学预测[J].宁波大学学报(理工版).2019
[6].赵微,田志军,王倩,倪宏波,彭金美.猪伪狂犬病病毒HeN1株gB蛋白单克隆抗体的制备及B细胞线性表位鉴定[J].中国预防兽医学报.2018
[7].张峥嵘,张玉晴,许如苏,许晓升.副溶血性弧菌外膜蛋白K的B细胞线性表位预测[J].中国微生态学杂志.2018
[8].赵微.猪伪狂犬病病毒HeN1株gB蛋白单克隆抗体制备及B细胞线性表位鉴定[D].黑龙江八一农垦大学.2018
[9].丛艳君,李晔,刘家琦,陈澍,于晓凤.牛乳α-乳白蛋白免疫球蛋白G线性表位的关键氨基酸识别[J].食品科学.2018
[10].孙赵洋.大豆抗原蛋白β-conglycinin线性表位与不同种属动物过敏血清结合能力的比较[D].吉林农业大学.2017
论文知识图
