导读:本文包含了结合位点论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:位点,环糊精,转录,因子,蛋白质,标记,通道。
结合位点论文文献综述
Yu-huan,LUO,Xia-fei,YU,Cheng,MA,Fan,YANG,Wei,YANG[1]（2019）在《S2–S3 loop中钙离子结合位点对人类及海葵来源TRPM2通道门控过程的影响研究（英文）》一文中研究指出目的:揭示S2–S3 loop的钙离子结合位点对M2型瞬时受体电位通道(TRPM2)门控过程的影响。创新点:首次探究了人类TRPM2通道(hT RPM2)和海葵TRPM2通道(nvT RPM2)S2–S3 loop的钙离子结合位点内四个氨基酸残基不同突变对通道激活及失活过程的影响,明确了钙离子结合位点对通道门控的作用。方法:运用分子突变和电生理检测的方法,系统探究关键位点不同突变对hT RPM2和nvT RPM2激活及失活过程的影响,并采用生物素化及免疫印迹的方法,检测突变对通道表达上膜的影响。结论:(1)钙离子不能单独激活nvTRPM2通道;(2)hT RPM2和nvT RPM2的四个关键氨基酸对钙离子依赖的门控调节作用类似;(3)在钙离子结合位点的四个关键氨基酸中,两个电负性氨基酸影响通道激活门控,两个电中性氨基酸影响通道失活门控。(本文来源于《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》期刊2019年12期）
智东明,方涵,陶虎,邓汉卿,王媛媛[2]（2019）在《水稻RNA结合蛋白C3H12与RNA结合位点的鉴定》一文中研究指出CCCH型锌指蛋白质C3H12是进化上保守的RNA结合蛋白质,它含有5个串联的CCCH锌指结构域ZnF_(1-5),形成2个紧密的锌指簇ZnF_(1-3)和ZnF_(4-5)。早期的研究发现,C3H12可能通过与mRNA结合的方式在转录后水平调控基因的表达。然而,与C3H12结合的mRNA类型和他们的结合模式,并未通过实验得到证明。本文表达纯化了一系列C3H12截短及全长蛋白质,并合成了一些潜在RNA底物ARE9、ARE19及对照Random21。通过等温滴定量热法(isothermal titration calorimetry, ITC)确定了C3H12与富含腺嘌呤尿嘧啶单元(AU-rich element, ARE) mRNA底物的结合,并揭示了互作核心区域和热力学性质。通过荧光光谱分析和微型热泳动(microscale thermophoresis, MST)技术对ITC的结果进一步佐证。结果表明:(1) C3H12与ARE底物的相互作用是焓驱动的能量有利的(ΔG<0)特异性结合,结合比为1:1。(2) C3H12与ARE19的亲和力较ARE9更高(约2倍)。(3) C3H12中ZnF_(1-3)在与ARE类底物的结合活性中发挥主导作用。(4) C3H12结构中的141个氨基酸残基的接头不直接参与和ARE底物的相互作用。本研究揭示的CCCH型锌指蛋白质C3H12与ARE底物结合模式,将为进一步在分子结构水平阐明C3H12与ARE底物结合的机制奠定基础。(本文来源于《中国生物化学与分子生物学报》期刊2019年11期）
王展,关奇,张晓坚[3]（2019）在《微管蛋白秋水仙碱结合位点抑制剂Combretastatin A-4类似物的研究进展》一文中研究指出目的综述微管蛋白秋水仙碱结合位点抑制剂Combretastatin A-4(CA-4)类似物的研究进展。方法依据近期国内外公开发表的49篇文献,将CA-4类似物的研究进展分类、归纳并总结。结果微管蛋白秋水仙碱结合位点抑制剂(colchicine binding site inhibitors,CBSI)具有增殖抑制和血管破坏双重活性,近年来备受抗肿瘤药物研究人员的关注。CA-4类似物的抗肿瘤活性突出且结构简单,是CBSI中的重要组成部分。本文对CA-4类似物的结构特点及其构效关系进行了归纳总结。结论利用CA-4类似物的构效关系归纳总结进行开发新药已成为研究热点。(本文来源于《沈阳药科大学学报》期刊2019年09期）
刘蔚,姚敏,康郁,王美,解盼[4]（2019）在《GWAS结合共表达网络分析挖掘影响油菜种子硫苷积累的作用位点》一文中研究指出降低菜籽油中硫苷(glucosinolate, GSL)的含量对菜籽油品质改良具有重要意义。本研究以203份中国半冬性油菜(Brassica napus)自交系为材料,利用芸薹属60K SNP芯片对油菜种子硫苷含量进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),共检测到20个与硫苷含量显着关联的SNP位点,分别位于A02、A03、A09、C03、C08、C09染色体上。对这些显着关联的SNP位点侧翼序列进行连锁不平衡分析,检测到C03染色体上的单体型区域(57830409～58283210 bp; r2=0.96)与硫苷含量显着关联。在这个单体型区域检测到了一个拟南芥(Arabidopsis thaliana)的直系同源基因支链氨基转移酶4 (branched-chain aminotransferase 4, BCAT4),涉及硫苷的合成。同时,利用50个重测序材料对这个单体型区域进行了进一步的区域关联分析,揭示BnBCAT4-C03 (BnaC03g68450D)基因区域单体型结构变异影响了硫苷的积累。结合基因共表达网络分析结果,表明BnBCAT4-C03与其他硫苷合成的重要基因形成了分子网络,调节硫苷的合成与积累。本研究结果有助于开发单体型功能标记,为极端低硫代品种选育提供理论指导。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年10期）
逯晓波,曲鹏,赵月皎[5]（2019）在《DNA双链断裂修复基因miRNA结合位点SNPs与甲状腺乳头状癌发生风险的关联性研究》一文中研究指出目的甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)是内分泌腺中十分普遍的恶性肿瘤之一,寻找意义明确的易感性生物标志对于PTC的早期发现及精准预防尤为重要。甲状腺乳头状癌的发生发展是环境与遗传交互作用的后果,环境致癌因子所导致的DNA损伤是其发生发展的起始动力。由电离辐射引起的染色体DNA双链断裂在众多类型的DNA损伤中是最值得重视的致死性损害,其可能成为PTC发生发展的重要原因之一。同源重组和非同源末端连接是修复DNA双链断裂的两种主要机制。本研究通过生物信息学技术选取DNA双链断裂修复(DSBR)系统的关键酶基因,包括HR修复途径的RAD51、RAD51B、BRCA1、BRCA2以及NHEJ修复途径的XRCC4、XRCC5等作为候选靶基因,根据人群中MAF值筛选出位于这些靶基因3'UTR区的SNP。通过PTC病例-对照研究证明该SNP位点以及可能与其结合的miRNA与PTC发病风险的关联,体外实验验证候选miRNA对其靶基因的调控及miRNA结合位点SNP不同基因型对这种调控的影响。本研究旨在找寻意义确切的与PTC相关的易感性生物学标志,为PTC的早期诊断及精准治疗提供新的分子靶点及理论依据。方法①登录GeneCards网站根据关键词"Homologous recombination"、"Non-homologous End Joining"进行搜索,在结果中挑选与这两种DNA修复通路相关的基因。使用UCSC网站基因组浏览器查找基因3'UTR区中的SNP并利用MAF值筛选SNP。使用Targetscan、PolymiRTs等网站预测可能结合在所筛选SNP位点上的miRNA.②使用Taqman水解探针法对206例PTC病例及206例健康对照的靶基因的候选SNP位点进行基因检测并分析这些SNP基因多态与PTC发病风险之间的关联。③验证候选靶基因SNP不同基因型对miRNA与靶基因结合度的影响通过双荧光素酶报告基因法验证。细胞转染miRNA模拟物至人甲状腺上皮Nthyroi3-1细胞系后,real-time PCR检测miRNA对靶基因m RNA表达的影响,Western Blot检测miRNA对靶基因蛋白表达的影响。结果①通过生物信息学技术选取DSBR系统关键酶基因RAD51、BRCA1、BRCA2、XRCC4、XRCC5等作为本研究的候选基因。②BRCA2 rs15869位点的基因多态性与PTC易感性相关,其CC基因型携带者比AA基因型携带者患PTC的风险高(OR=2.595,95%CI:1.091-6.171);CC基因型女性携带者比AA基因型女性携带者患PTC的风险高(OR=2.756,95%CI:1.024-7.414);在年龄小于50岁的人群中,CC基因型携带者比AA基因型携带者患PTC的风险高(OR=4.440,95%CI:1.177-16.444)。③生物信息学预测miR-627-3p可能结合在BRCA2基因rs15869位点并改变其mRNA的二级结构。双荧光素酶报告基因法验证rs15869多态可以影响miR-627-3p在BRCA2 3′UTR的绑定能力。通过体外转染miR-627-3p模拟物后对BRCA2mRNA及蛋白水平的检测,结果表明miR-627-3p的过表达降低BRCA2 mRNA和蛋白表达水平。结论 BRCA2 rs15869位点与PTC易感相关,其CC基因型可增加其发生风险。BRCA2基因rs15869位点不同基因型与miR-627-3p结合能力的差异改变其表达水平,从而影响PTC的发病风险。(本文来源于《中国毒理学会第九次全国毒理学大会论文集》期刊2019-09-17）
宁丽华,王建晖,时丕彪,伍楚善,董志诚[6]（2019）在《基于DAP-Seq方法鉴定玉米胚乳特异表达转录因子O2在全基因组水平上的结合位点》一文中研究指出Opaque2(O2)是一个调控玉米胚乳发育的重要转录因子.为了揭示O2的转录调控网络,利用DAP-Seq技术挖掘其在全基因组范围上结合位点共检测到11385个位点.通过结合已报道RNA-Seq数据,本研究DAP-Seq共检测到317个O2直接结合并调控的靶基因,其中包括97个已报道ChIP-Seq检测靶基因以及220个DAP-Seq特异检测的靶基因.而基序(motif)富集分析显示, DAP-Seq检测O2结合317靶标基因与220个特异结合靶标基因所富集的基序均与已报道O2结合motif相同.另外, GO富集分析显示,与ChIP-Seq一致的O2靶基因主要参与zein蛋白合成及氨基酸代谢途径,而特异检测的O2靶标基因,除参与上述途径外,还主要参与糖代谢途径以及多个胁迫响应相关途径.本研究利用DAP-Seq技术进一步揭示了O2在胚乳发育过程发挥调控作用,该结果是对前人研究结果的验证和补充.(本文来源于《科学通报》期刊2019年24期）
田纪春,邓志英,陈建省[7]（2019）在《与小麦常规育种全过程结合位点分子标记辅助选择方法》一文中研究指出"与小麦常规育种全过程结合的多位点分子标记辅助选择方法"是作者根据40年常规育种和20年分子育种经验,发明的一种实用高效的小麦育种新技术,2016年获国家发明专利(ZL201410289103.4),2018年获中国专利银奖和泰安市发明专利一等奖。该发明专利的核心技术为"常规育种全程标记选择"、"多位点分子标记选择"和"根据组合类型确定标记选择顺序"3个方面。"常规育种全程标记选择"即从种质资源鉴定、亲本选择、分离世代世代选育到形成品种的常规育全程,均利用分子标记跟踪选择,而且不同世代标记选择的性状和重点不同,例如,在用分子育种元件配制组合的基础上,早期世代主要标记选择抗病等早期稳定性状,中间世代主要标记选择产量等后期稳定性状。"多位点分子标记选择"包括多个标记位点选择同一目标性状(例:3个标记位点对抗白粉病进行选择)和多个标记选择多个目标性状(例:用13个标记位点对7个性状进行同时选择),以此将控制多个QTL/基因有利等位基因聚合在一个新品种中。"根据组合类型确定标记选择顺序",即重点组合群体:先基因型标记后表现型选择,两者结合选优淘劣。一般组合群体:先表现型选择后基因型标记,只对优良株系进行标记鉴定。核心技术的发明和实施,提高了分子标记育种的"可行性"和"有效性"、"实用性"和"高效性",实现了"常规育种"和"分子标记育种"的真正结合。本发明为专利使用者提供的不仅只是方法,而且包括育种元件、含有的QTL/基因、跟踪标记及其作用大小等,任何育种企业均可据育种目标,选择育种元件配制组合,使用标记聚合有利基因,培育理想型新品种。发明人使用该专利技术育成了多基因聚合的抗病、高产新品种山农20,2017年获国家科技进步二等奖。近5年又育成4个审定品种,其中山农102是抗赤霉病品种,山农111和山农糯麦1号分别是强筋和糯质等绿色优质品种。江苏大华、滨州泰裕、泰安丰田等省内外6家种业使用专利技术,育成的华麦118,裕田麦119和泰田麦118等5个新品种近年已获省和国家审定。因此,该专利技术应用价值很大,社会经济效益显着。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11）
张娟娟,梅芬,李瑞玮,左荣霞,郑永钦[8]（2019）在《ALOX5基因启动子SP-1结合位点多态性与急性髓系白血病易感性的关系》一文中研究指出目的探讨花生四烯5-脂氧合酶基因(arachidonate 5-lipoxygenase gene, ALOX5)基因启动子SP-1结合位点的多态性与成人急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)的相关性。方法采用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析236例成人AML(实验组)和179例健康体检者(对照组)中ALOX5基因启动子SP-1结合位点的多态性,经PCR产物直接测序法进行验证,利用DNAStar软件对测序结果进行分析。结果检测到ALOX5基因启动子SP-1结合位点有6种基因型,包括4/4、4/5、4/6、5/5、5/6和6/6。在实验组和对照组中,基因型4/4的分布频率为20.30%和10.10%(OR=1.976,95%CI:1.050～3.719,χ~2=4.539,P<0.05);基因型4/6的分布频率为10.60%和26.80%(OR=0.386,95%CI:0.215～0.692,χ~2=10.513,P<0.05);等位基因6的分布频率为26.90%和30.20%(OR=0.736,95%CI:0.528～1.025,χ~2=3.291,P<0.05);SP-1位点的其余基因型、等位基因在实验组和对照组中分布频率差异无统计学意义(P>0.05),其可能不是成人AML发病风险的预警指标。结论 ALOX5基因启动子区SP-1结合位点的基因型4/6,等位基因6可能与AML发病风险降低有关,而携带基因型4/4人群可能易患AML。(本文来源于《临床与实验病理学杂志》期刊2019年06期）
陈娟,黄爱龙[9]（2019）在《泛素结合酶UBE2L3功能位点维持cccDNA稳定性并促进HBV复制的机制研究》一文中研究指出【据《Hepatology》2019年3月报道】题:泛素结合酶UBE2L3功能位点维持cccD NA稳定性并促进HBV复制的机制研究(作者Zhou L等)尽管以往研究通过全基因关联分析(GWAS)发现多个HBV易感性基因,但是缺乏对这些基因或位点的生物学意义和临床价值的深入研究,并多集中于成人乙型肝炎队列研究。重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室Zhou等建立了上千人的HBV高危暴露儿童队列和HBV慢性感染儿童的病例样本库;并在儿童队列中鉴定了一(本文来源于《临床肝胆病杂志》期刊2019年06期）
陈双娣[10]（2019）在《麦芽糖基结合位点2区域对环糊精葡萄糖基转移酶产物抑制的影响研究》一文中研究指出环糊精具有包合许多疏水性化合物而改善它们使用性能的作用,在各个领域具有广泛应用。工业上,环糊精的制备一般通过环糊精葡萄糖基转移酶(CGT酶)作用于淀粉制备而成,但随着产物的积累,会出现明显的产物抑制现象,是造成环糊精产量较低的一个重要因素,因此,如何降低环糊精生产过程中的产物抑制成为一个亟待解决的问题。本研究选取2种具有不同产物抑制类型的CGT酶(α-CGT酶来源于Paenibacillus macerans JFB05-01,β-CGT酶来源于Bacillus circulans STB01)为研究对象,通过生物信息学手段从酶一级结构入手,深入分析酶结构与产物抑制的关系。然后,通过单突变、双突变及片段替换对麦芽糖基结合位点2(MBS2)区域进行分子改造,以研究MBS2区域对CGT酶产物抑制的影响,并对相关机理进行了分析,同时期望得到产物抑制降低、具有工业应用价值的理想突变体。主要研究结果如下:(1)对CGT酶进行生物信息学分析,从一级结构入手,深入分析造成CGT酶产物抑制的原因,明确与CGT酶产物抑制相关的区域及氨基酸残基。根据α-CGT酶和β-CGT酶的产物抑制差异以及MBS2区域的特殊性,选定MBS2区域为研究目标,并选取该区域的600位点和603位点及整体进行结构分析,为后续突变体的构建提供指导。(2)选取MBS2区域的600位点,分别设计了4个α-CGT酶单突变体(Y600L、Y600E、Y600I和Y600R)和4个β-CGT酶单突变体(L600Y、L600E、L600I和L600R)进行比较研究。结果发现,α-CGT酶600位点突变既不改变α-CGT酶的产物抑制类型,仍为竞争性抑制,也不改变其产物抑制强弱;而β-CGT酶600位点突变体的产物抑制类型虽未发生改变,仍为线性混合型抑制,但其产物抑制强弱受到明显影响。可以推断,环糊精对α-CGT酶产生的竞争性抑制与其非活性区域MBS2的600位点没有相关性,而环糊精对β-CGT酶产生的线性混合型抑制尤其是非竞争性抑制与600位点有一定的关联性。机理分析显示,β-CGT酶600位点突变后,600位点处的氨基酸与环糊精之间的疏水相互作用减弱,进而导致产物抑制的降低。(3)选取MBS2区域的603位点,分别设计了6个α-CGT酶单突变体(N603E、N603D、N603K、N603H、N603R和N603I)和6个β-CGT酶单突变体(N603E、N603D、N603K、N603H、N603R和N603I)进行比较研究。结果发现,603位点单突变对α-CGT酶和β-CGT酶的影响同600位点类似,但其中,2种酶的N603E和N603D竞争性抑制均发生明显变化。可以推断,MBS2区域的603位点也与β-CGT酶的非竞争性抑制密切相关,而2种酶N603E和N603D的竞争性抑制强度变化可能与另一个竞争区域(MBS1)有关。机理分析显示,野生型β-CGT酶603位点处的Asn通过水介导的氢键与环糊精相结合,当突变成带负电荷的Glu、Asp或者疏水性的Ile时,氢键被破坏,产物抑制降低,而突变成Lys、His和Arg后,侧链氨基的存在仍导致氢键的存在,甚至更强,产物抑制更严重。(4)在前面基础上,对β-CGT酶设计了2个双突变体(N603D/L600R和N603D/L600E)和片段替换突变体(MBS2-Bc DF9R)进行进一步研究。结果发现,N603D/L600R和N603D/L600E以及MBS2-Bc DF9R均具有更好的产物抑制降低效果。当以5%麦芽糊精(DE=4)为底物进行环糊精生产时,在相同酶蛋白添加量下,双突变体N603D/L600R和N603D/L600E的主产物β-环糊精比野生型分别高出43.7%和27.9%,具有潜在的工业应用价值。(本文来源于《江南大学》期刊2019-06-01）
结合位点论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
CCCH型锌指蛋白质C3H12是进化上保守的RNA结合蛋白质,它含有5个串联的CCCH锌指结构域ZnF_(1-5),形成2个紧密的锌指簇ZnF_(1-3)和ZnF_(4-5)。早期的研究发现,C3H12可能通过与mRNA结合的方式在转录后水平调控基因的表达。然而,与C3H12结合的mRNA类型和他们的结合模式,并未通过实验得到证明。本文表达纯化了一系列C3H12截短及全长蛋白质,并合成了一些潜在RNA底物ARE9、ARE19及对照Random21。通过等温滴定量热法(isothermal titration calorimetry, ITC)确定了C3H12与富含腺嘌呤尿嘧啶单元(AU-rich element, ARE) mRNA底物的结合,并揭示了互作核心区域和热力学性质。通过荧光光谱分析和微型热泳动(microscale thermophoresis, MST)技术对ITC的结果进一步佐证。结果表明:(1) C3H12与ARE底物的相互作用是焓驱动的能量有利的(ΔG<0)特异性结合,结合比为1:1。(2) C3H12与ARE19的亲和力较ARE9更高(约2倍)。(3) C3H12中ZnF_(1-3)在与ARE类底物的结合活性中发挥主导作用。(4) C3H12结构中的141个氨基酸残基的接头不直接参与和ARE底物的相互作用。本研究揭示的CCCH型锌指蛋白质C3H12与ARE底物结合模式,将为进一步在分子结构水平阐明C3H12与ARE底物结合的机制奠定基础。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
结合位点论文参考文献
[1].Yu-huan,LUO,Xia-fei,YU,Cheng,MA,Fan,YANG,Wei,YANG.S2–S3loop中钙离子结合位点对人类及海葵来源TRPM2通道门控过程的影响研究（英文）[J].JournalofZhejiangUniversity-ScienceB(Biomedicine&Biotechnology).2019
[2].智东明,方涵,陶虎,邓汉卿,王媛媛.水稻RNA结合蛋白C3H12与RNA结合位点的鉴定[J].中国生物化学与分子生物学报.2019
[3].王展,关奇,张晓坚.微管蛋白秋水仙碱结合位点抑制剂CombretastatinA-4类似物的研究进展[J].沈阳药科大学学报.2019
[4].刘蔚,姚敏,康郁,王美,解盼.GWAS结合共表达网络分析挖掘影响油菜种子硫苷积累的作用位点[J].农业生物技术学报.2019
[5].逯晓波,曲鹏,赵月皎.DNA双链断裂修复基因miRNA结合位点SNPs与甲状腺乳头状癌发生风险的关联性研究[C].中国毒理学会第九次全国毒理学大会论文集.2019
[6].宁丽华,王建晖,时丕彪,伍楚善,董志诚.基于DAP-Seq方法鉴定玉米胚乳特异表达转录因子O2在全基因组水平上的结合位点[J].科学通报.2019
[7].田纪春,邓志英,陈建省.与小麦常规育种全过程结合位点分子标记辅助选择方法[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019
[8].张娟娟,梅芬,李瑞玮,左荣霞,郑永钦.ALOX5基因启动子SP-1结合位点多态性与急性髓系白血病易感性的关系[J].临床与实验病理学杂志.2019
[9].陈娟,黄爱龙.泛素结合酶UBE2L3功能位点维持cccDNA稳定性并促进HBV复制的机制研究[J].临床肝胆病杂志.2019
[10].陈双娣.麦芽糖基结合位点2区域对环糊精葡萄糖基转移酶产物抑制的影响研究[D].江南大学.2019
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