高温噬菌体裂解酶TSPpgh的抑菌作用研究

高温噬菌体裂解酶TSPpgh的抑菌作用研究

论文摘要

M23家族蛋白酶具有内肽酶和酰胺酶活性,能降解细菌细胞壁肽聚糖,作为新型的蛋白类抗生素倍受关注。部分噬菌体裂解酶属M23家族蛋白酶,能高效地裂解多重耐药性细菌,使其有望应用于取代传统的抗生素治疗。本文在已获得腾冲热海栖热菌噬菌体TSP4基因组的基础上,分析此噬菌体裂解酶基因的基本特征,对裂解酶基因进行克隆表达,同时探索利用高温酶热稳定性高的特点,建立基于菌体热裂解的重组裂解酶快速纯化方法,并通过抑菌活性和AFM观察评价纯化后裂解酶的活性。最后将裂解酶用可溶性淀粉吸附制备成酶制剂,定期评价酶制剂的酶活变化。为了探索裂解酶的裂解机理,本文分别利用革兰氏阴性菌大肠杆菌、革兰氏阳性菌金黄色葡萄球菌的肽聚糖,与裂解酶进行反应,研究其对肽聚糖的吸附特征,通过液质联用分析裂解酶水解肽聚糖的位点,并进一步通过对裂解酶基因的定点突变,验证裂解酶的活性位点及特征。为了探索裂解酶的抑菌效果,本文通过致死率分析及电镜观察,评价裂解酶对大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌和多重耐药肺炎克雷伯氏菌的抑菌效果。并通过在小鼠身上制造了皮肤伤口,定殖耐药金黄色葡萄球菌随后用TSPpgh对局部进行治疗,探索裂解酶在治疗多重耐药金黄色葡萄球菌在外伤感染中的作用。结果表明,栖热菌噬菌体TSP4裂解酶TSPpgh属于M23肽酶家族,推测motif HXXXD和HXH为TSPpgh的活性位点,并进行了突变验证。将裂解酶基因TSPpgh克隆表达后,得到分子量19 KDa的重组蛋白。通过对诱导表达后的发酵液升温至55℃并维持20分钟,能使细胞破裂并变性沉淀去除掉绝大多数表达菌株大肠杆菌的蛋白,从而实现裂解酶的快速纯化,结合高密度发酵技术,发酵液中裂解酶浓度可达2 mg/mL。裂解酶对金黄色葡萄球菌ATCC 6538的杀菌效率最高,可达90%。通过AFM观察表明,TSPpgh裂解了大肠杆菌BL21(含TSPpgh质粒)和金黄色葡萄球菌的细胞壁,制备的酶制剂在20℃保存一年其酶活能保持75%。裂解酶TSPpgh能够吸附和水解革兰氏阴性菌和阳性菌的肽聚糖,并且能够水解弹性蛋白。通过液质联用分析TSPpgh水解肽聚糖的位点表明,TSPpgh还能够水解糖苷键Glcp-β-1’-6’-Glcp-β-1’-1’,具有糖苷酶的活性。抑菌实验表明,TSPpgh在37℃、酶浓度为68μg/mL的浓度下,裂解酶TSPpgh对金黄色葡萄球菌、沙门氏菌CMCC(B)50094和大肠杆菌CMCC(B)44102菌株的致死率达90%,对多重耐药肺炎克雷伯氏菌的致死率高达80%以上,部分致死率可达100%;通过SEM观察表明,裂解酶TSPpgh通过裂解作用而实现其杀菌功能。本研究在小鼠身上制造了皮肤伤口,定殖耐药金黄色葡萄球菌2612-1606BL1486,随后用TSPpgh对局部进行治疗。在为期9天的治疗期间,TSPpgh和卡那霉素均快速的促进了伤口愈合。验证了裂解酶TSPpgh在治疗多重耐药金黄色葡萄球菌在外伤感染中的作用。本文建立了高温裂解酶的高效表达和快速纯化方法,结合此裂解酶较广泛的细菌裂解谱、较高的裂解酶活性以及热稳定性,使其具有较好的生产应用前景,其对多重耐药菌良好的杀灭效果,有助于其作为新型的酶抗生素应用于医药研发。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 前言
  •   1.1 研究背景
  •     1.1.1 栖热噬菌体
  •     1.1.2 噬菌体裂解酶
  •     1.1.3 M23 家族蛋白酶
  •     1.1.4 裂解酶TSPpgh
  •     1.1.5 耐药性细菌
  •       1.1.5.1 广泛耐药伤寒沙门氏菌(Salmonella typhi)
  •       1.1.5.2 耐药性金黄色葡萄球菌(Multi-drug resistant Staphylococcusaureus)
  •       1.1.5.3 广泛耐药肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)
  •     1.1.6 细菌肽聚糖
  •       1.1.6.1 革兰氏阴性菌的肽聚糖
  •       1.1.6.2 革兰氏阳性菌的肽聚糖
  •     1.1.7 裂解酶对肽聚糖的降解机制
  •   1.2 研究内容
  • 第二章 TSPpgh的快速纯化、肽聚糖的吸附与降解、活性位点验证以及酶学性质探索
  •   2.1 TSPpgh的快速纯化
  •     2.1.1 菌株和质粒
  •     2.1.2 利用热裂解快速纯化重组裂解酶TSPpgh
  •       2.1.2.1 优化热裂解温度以及热裂解与超声破碎对TSPpgh释放的影响
  •       2.1.2.2 利用热裂解快速纯化重组裂解酶TSPpgh的放大实验
  •     2.1.3 快速纯化的TSPpgh酶活验证
  •       2.1.3.1 快速纯化的TSPpgh对细菌细胞的破坏作用
  •       2.1.3.2 快速纯化的TSPpgh对细菌裂解效果的AFM观察
  •     2.1.4 TSPpgh酶制剂的制备与保质期跟踪
  •   2.2 TSPpgh对肽聚糖的吸附与降解
  •     2.2.1 肽聚糖的制备
  •     2.2.2 TSPpgh对不同浓度肽聚糖吸附作用的检测
  •     2.2.3 不同反应时间对吸附作用的影响
  •     2.2.4 不同肽聚糖底物吸附效率的检测
  •   2.3 TSPpgh的活性位点验证
  •     2.3.1 序列比对
  •     2.3.2 TSPpgh突变方案设计
  •       2.3.2.1 突变试剂盒
  •       2.3.2.2 突变引物设计
  •       2.3.2.3 突变反应
  •       2.3.2.4 Dpn I消化
  •       2.3.2.5 突变质粒化学转化至E.coli DH5α感受态细胞
  •       2.3.2.6 菌落PCR鉴定阳性克隆
  •       2.3.2.7 突变质粒转化至E.coli BL21
  •       2.3.2.8 突变体重组蛋白的表达与纯化
  •       2.3.2.9 突变体的酶活验证
  •   2.4 TSPpgh的酶学性质探索
  •     2.4.1 裂解酶TSPpgh的最适作用温度
  •     2.4.2 裂解酶TSPpgh的最适pH
  •     2.4.3 不同金属离子对TSPpgh的影响
  •     2.4.4 糖苷键水解活性
  •   2.5 结果
  •     2.5.1
  •       2.5.1.1 优化热裂解温度
  •       2.5.1.2 热裂解与超声破碎对大肠杆菌细胞分裂及TSPpgh释放的影响分析
  •       2.5.1.3 利用热裂解快速纯化重组裂解酶TSPpgh的放大实验
  •       2.5.1.4 快速纯化的TSPpgh对细菌细胞的破坏作用及AFM观察
  •       2.5.1.5 TSPpgh酶制剂的制备与保质期跟踪结果
  •     2.5.2
  •       2.5.2.1 TSPpgh对不同浓度肽聚糖吸附作用的检测
  •       2.5.2.2 不同反应时间对肽聚糖吸附作用的影响
  •       2.5.2.3 不同肽聚糖底物吸附效率的检测
  •     2.5.3
  •       2.5.3.1 突变体的转化、挑克隆鉴定
  •       2.5.3.2 突变体TSP-1-11 与突变体TSP-2 重组蛋白的表达
  •       2.5.3.3 突变体TSP-1-11 与突变体TSP-24 重组蛋白的纯化
  •       2.5.3.4 突变体TSP-1-11 与突变TSP-24 酶活验证
  •     2.5.4
  •       2.5.4.1 裂解酶TSPpgh的最适作用温度
  •       2.5.4.2 裂解酶TSPpgh的最适pH
  •       2.5.4.3 不同金属离子的裂解酶TSPpgh的影响
  •       2.5.4.4 糖苷键水解活性
  • 第三章 TSPpgh抑菌活性测定
  •   3.1 TSPpgh对典型革兰氏阳性、阴性菌株的致死活性分析
  •     3.1.1 菌株
  •     3.1.2 菌株的培养
  •     3.1.3 反应时间对TSPpgh抑菌效率的影响
  •     3.1.4 反应浓度对TSPpgh抑菌效率的影响
  •     3.1.5 TSPpgh与卡那霉素抑菌效率比较
  •     3.1.6 TSPpgh抑菌效果的SEM观察
  •     3.1.7 TSPpgh最小抑菌浓度(MIC)的测定
  •   3.2 TSPpgh对肺炎克雷伯菌的致死活性分析
  •     3.2.1 菌株及培养
  •     3.2.2 TSPpgh对肺炎克雷伯菌的抑菌效率验证
  •     3.2.3 反应时间和浓度对TSPpgh作用肺炎克雷伯菌效率的影响
  •       3.2.3.1 反应时间对TSPpgh作用肺炎克雷伯菌效率的影响
  •       3.2.3.2 反应浓度对TSPpgh作用肺炎克雷伯菌效率的影响
  •   3.3 TSPpgh治疗小鼠伤口感染实验验证
  •   3.4 结果和讨论
  •     3.4.1
  •       3.4.1.1 反应时间对TSPpgh抑菌效率的影响
  •       3.4.1.2 反应浓度对TSPpgh抑菌效率的影响
  •       3.4.1.3 TSPpgh与卡那霉素抑菌效率比较
  •       3.4.1.4 TSPpgh抑菌效果SEM观察结果
  •       3.4.1.5 TSPpgh最小抑菌浓度(MIC)的测定
  •     3.4.2
  •       3.4.2.1 TSPpgh对肺炎克雷伯菌的抑菌效率验证
  •       3.4.2.2 反应时间和浓度对TSPpgh作用肺炎克雷伯菌效率的影响
  •     3.4.2.2.1 反应时间对TSPpgh作用肺炎克雷伯菌效率的影响
  •     3.4.2.2.2 反应浓度对TSPpgh作用肺炎克雷伯菌效率的影响
  •     3.4.3 TSPpgh治疗小鼠伤口实验结果
  • 第四章 总结与展望
  •   4.1 总结
  •     4.1.1 裂解酶的应用
  •     4.1.2 与常温裂解酶相比,裂解酶TSPpgh拥有的优势
  •   4.2 展望
  • 致谢
  • 参考文献
  • 附录 A攻读学位其间发表论文目录
  • 附录 B培养基及药品配制
  • 附录 C微生物菌株编号
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 嵇歆彧

    导师: 林连兵

    关键词: 噬菌体,裂解酶,多重耐药性细菌,杀菌活性,肽聚糖降解

    来源: 昆明理工大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 昆明理工大学

    基金: 国家自然科学基金项目:“高温噬菌体M23家族蛋白酶对肽聚糖降解的机制研究”(31760042)

    分类号: Q55

    DOI: 10.27200/d.cnki.gkmlu.2019.001193

    总页数: 88

    文件大小: 4548K

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