导读:本文包含了非编码小论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:细菌,非编码小RNA,基因表达
非编码小论文文献综述
李宝华,戈海泽,刘树业[1]（2019）在《环境胁迫下细菌非编码小RNA对基因表达的调控》一文中研究指出细菌非编码小RNA(sRNA)是长度约为50～500个核苷酸的RNA分子。其编码基因位于基因间区域,在细菌基因组中可被转录但不被翻译为蛋白质,随着生物信息学和RNA测序技术的发展,sRNA功能受到广泛关注。在不断变化的环境中,细菌遇到各种各样生存压力,sRNA通过感应环境变化调节相应基因的表达。在细菌适应环境的过程中发挥了重要作用。本文对环境胁迫下细菌sRNA的表达变化和其对基因的表达调控进行综述,揭示sRNA细菌基因转录后调控、生物适应性进化等生命过程的重要意义。(本文来源于《黑龙江医学》期刊2019年06期）
周海珍[2]（2019）在《杀鱼爱德华氏菌非编码小RNA sR082和sR012的功能研究》一文中研究指出杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)是海水养殖鱼类的重要病原菌,由杀鱼爱德华氏菌引发的爱德华氏菌病给我国水产养殖业造成了巨大的经济损失。细菌非编码小RNA是近些年来发现的一种调控因子,在转录后水平调节基因表达,参与调控环境应答、群体感应(quorum sensing)、生物膜形成、运动性和致病性等生物学过程。目前对于杀鱼爱德华氏菌的感染机制,尤其是非编码小RNA(sRNA)调控的毒力机制仍有待研究。本研究通过对不同生长环境下(正常LB培养,酸性胁迫,缺铁胁迫和氧化胁迫)培养的杀鱼爱德华氏菌提取总RNA进行高通量测序,总共发现有148个sRNA表达,其中19个是已经注释过的sRNA,其它129个未曾报道。相比正常LB培养组,共有103个sRNA在3种胁迫环境下有显着差异表达。根据测序结果,分别选取在酸性条件和氧化条件下具有显着差异表达的sRNA(命名为sR082和sR012)进行深入研究。首先,用qRT-PCR法分析了sR082和sR012在不同生长时期和不同环境胁迫压力下的表达量,结果表明,sR082在细菌生长早期和低pH条件下高表达;sR012在细菌生长对数期高表达。为了研究sR012和sR082生物学功能,利用同源重组法分别构建了sR082和sR012敲除株TXΔsR082和TXΔsR012,比较敲除株和野生株在低pH压力和氧化压力条件下的生长情况。发现TXΔsR082在pH 5条件下生长能力显着降低;TXΔsR012在氧化压力条件下生长能力显着降低。这些结果表明sR082与sR012分别与细菌适应酸性和氧化胁迫能力有关。为分析sR082与sR012对细菌感染宿主的影响,本研究分别比较了TXΔsR082,TXΔsR012与野生株TXD1感染牙鲆细胞、组织和个体能力的差异。结果表明,与TXD1相比,TXΔsR082和TXΔsR012感染牙鲆FG细胞能力、胞内复制能力、组织侵染能力以及致死能力均显着下降。这些结果表明,sR082和sR012在杀鱼爱德华氏菌耐受宿主胞内酸性和氧化环境及感染等方面发挥重要作用。为进一步了解sR012在杀鱼爱德华氏菌中的调控作用,利用TargetRNA2软件对sR012进行靶基因预测,并用qRT-PCR验证靶基因的转录水平。发现共有4个靶基因(ETAE-0114,ETAE-2575,ETAE-3156和ETAE-0911)在TXD1和TXΔsR012中有差异表达,这些结果表明sR012可能通过调控这4个靶基因适应宿主胞内氧化环境从而影响杀鱼爱德华氏菌的毒力。(本文来源于《中国科学院大学(中国科学院海洋研究所)》期刊2019-06-01）
卞玉莹,王成,张春妮[3]（2019）在《精浆非编码小RNA与男性不育最新研究进展》一文中研究指出男性不育发病率逐年升高,但目前仍缺乏无创的精准检测指标,且特发性不育患者发病机制尚不完全明确。最新研究发现,人精浆及精浆外泌体中存在多种类型非编码小RNA(sncRNA),可作为男性不育的新型非侵入性生物标志物。本文就近年来关于精浆sncRNA与男性不育关系研究进展作一综述,以期为男性不育分子标志物的筛选及分子机制研究提供新的思路和方向。(本文来源于《中华男科学杂志》期刊2019年05期）
陈斌杰[4]（2019）在《肠炎沙门菌非编码小RNA RyhB调控毒力相关靶基因的筛选、鉴定和功能研究》一文中研究指出沙门菌是一种重要的食源性病原菌,绝大部分血清型对人和动物具有致病性,可引起多种不同临床表现的沙门菌病。研究沙门菌感染宿主的致病机制对预防和控制沙门菌病具有重要现实意义。细菌非编码小RNA(Small non-coding RNA,sRNA)是一类基因组中被转录但不编码蛋白质的RNA分子,通过感应外界环境变化,在转录后水平快速调节基因表达。RyhB是存在于沙门菌、大肠杆菌等多种细菌中的一种sRNA。沙门菌编码两种RyhB同源物:RyhB-1和RyhB-2,二者可参与铁代谢、能量代谢、硝酸盐代谢、氧化应激、耐酸性、耐药性等多种生命代谢过程的调控,但RyhB对毒力相关靶标基因的调控研究较少。本研究通过构建体外模拟肠道环境(Simulated Intestinal Environmentin vitro,SIE)模型,探究肠炎沙门菌在模拟肠道环境时RyhB的转录情况,筛选该条件下RyhB调控的毒力相关靶标基因,并对其调控机制及对宿主致病性作用进行深入研究。具体研究内容如下:1.低铁、无氧和模拟肠道环境对RyhB-1和RyhB-2转录的影响缺氧和铁匮乏是肠炎沙门菌及其它肠道菌感染宿主时必须面对的环境压力。为研究低铁、无氧和模拟肠道环境对RyhB转录的影响以及两种RyhB同源物之间的转录关系,本研究检测了肠炎沙门菌SE50336野生株、ryhB-1缺失株、ryhB-2缺失株、ryhB-1/ryhB-2双缺失株在低铁、无氧、模拟肠道环境下的生长情况,以及RyhB-1和RyhB-2的表达量。结果发现,与LB培养基中有氧培养条件下相比,低铁、无氧条件和模拟肠道环境培养条件下,所有沙门菌菌株生长缓慢;相同培养条件下,ryhB单缺失或双缺失均影响细菌生长。低铁、无氧和模拟肠道环境均可诱导RyhB-1和RyhB-2的高转录,尤其是模拟肠道环境下,二者表达量与常规培养条件相比分别升高70、60倍,表明RyhB-1和RyhB-2在沙门菌适应以上不良环境中发挥重要作用;单一ryhB缺失可导致另一RyhB 同源物表达量增加,推测两种RyhB同源物之间存在表达互补作用。2.模拟肠道环境下RyhB调控靶标基因的筛选为研究肠炎沙门菌自然感染宿主时RyhB的调控作用,通过转录组测序技术分析比较了模拟肠道环境条件下肠炎沙门菌野生株、ryhB-1缺失株、ryhB-2缺失株、ryhB-1/ryhB-2双缺失株的转录组变化,以筛选模拟肠道环境条件下RyhB调控的靶标基因。转录组测序结果显示,与野生株相比,ryhB-1、ryhB-2单缺失和双缺失株中分别有496、250、553个差异表达基因(Different Expression Genes,DEGs),其中受RyhB-1和RyhB-2共同调控的靶基因有363个,受RyhB-1单独调控的靶基因有188个,受RyhB-2单独调控的靶基因有110个。挑选了 14个差异表达基因,利用荧光定量PCR技术验证转录组测序结果的正确性。结果发现,荧光定量PCR检测基因的表达量与转录组测序结果趋势一致,表明转录分析数据可信度高,可继续下一步分析。GO分析结果显示,差异表达基因的分子功能主要富集到辅因子转运活性、亚铁血红素转运和ATP酶活性上,而生物过程和细胞组成主要富集到辅因子转运、亚铁血红素转运、蛋白质复合物生物合成与组装等功能上。KEGG分析结果显示,DEGs富集较多的通路包括硝酸盐代谢通路、双组份系统、信号转导和细菌侵袭上皮细胞等毒力相关基因。3.RyhB-1和RyhB-2对毒力相关靶基因的调控作用机制研究转录组测序结果发现,模拟肠道环境条件下,RyhB-1和RyhB-2可上调编码Ⅲ型分泌系统效应蛋白sipA和sopE基因的表达,抑制参与沙门菌在巨噬细胞内存活和复制的ssaI和sseA基因的表达。为进一步研究RyhB-1和RyhB-2对以上靶基因的调控机制,本研究通过生物信息学预测RyhB与上述靶基因的结合位点,利用双质粒荧光报告系统证明调控机制(激活或抑制)。结果显示,RyhB-1和RyhB-2可直接与sipA mRNA的5' UTR相互作用,使位于sipA mRNA 5' UTR上原本闭合的核糖体结合位点(Ribosome Bind Site,RBS)暴露出来,促进翻译进程;RyhB-1和RyhB-2亦可直接与ssaI mRNA形成不完全互补配对,抑制ssaI翻译。而RyhB-1和RyhB-2对sopE和sseA基因起间接调控作用。4.RyhB-1和RyhB-2调控沙门菌侵袭和胞内存活与复制为进一步探究模拟肠道环境下RyhB对宿主致病性调控作用,通过MEAT(Murine Ex vivo Anaerobic Tissue,MEAT model)模型证明ryhB缺失后,肠炎沙门菌对小鼠肠道上皮细胞侵袭能力减弱,推测在自然感染宿主后,RyhB-1和RyhB-2被诱导转录,通过与sipA mRNA 5' UTR相互作用,激活后者翻译,影响肠炎沙门菌对上皮细胞侵袭能力。巨噬细胞内存活试验表明,ryhB缺失导致肠炎沙门菌在巨噬细胞中存活能力减弱,但复制能力增强,推测RyhB-1和RyhB-2通过直接抑制参与肠炎沙门菌在巨噬细胞内存活与复制的效应蛋白SsaI表达,调控肠炎沙门菌在巨噬细胞内存活与复制。(本文来源于《扬州大学》期刊2019-05-01）
陈斌杰,王亨,陈艳飞,潘夏雨,袁天梅[5]（2019）在《沙门菌非编码小RNA RyhB研究进展》一文中研究指出非编码小RNA(small non-coding RNA,sRNA)是一类基因组中被转录但不翻译成蛋白质的RNA分子,可在转录后水平调控基因表达。与蛋白质介导的调控系统不同,当细菌遇到不利的生长环境时,sRNA介导的调控可对环境变化做出快速应答。沙门菌RyhB-1和RyhB-2是两种相似性较高的sRNA,通过碱基互补配对方式,在调控因子作用下共同或单独调控靶基因表达。铁匮乏时,RyhB-1和RyhB-2可促进沙门菌摄取铁元素、限制胞内非必需含铁蛋白生成以及加快铁硫蛋白的储存,是沙门菌在转录后水平调控铁稳态的主要元件。此外,当沙门菌遭遇氧化应激、缺氧或酸性环境等不利环境胁迫时,RyhB可分别控制活性氧自由基的生成、平衡硝酸盐等无机物稳态、调节细菌运动性以及沙门菌毒力等应对环境变化。本文就沙门菌RyhB生理特征及其调控机制和功能进行阐述,以期为后续沙门菌RyhB的研究提供指导信息。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年01期）
张萍,李晨曦,郝晓冉,朱旭东[6]（2018）在《新型隐球酵母非编码小RNAs的研究进展》一文中研究指出新型隐球酵母是一种担子菌病原真菌,主要感染免疫功能缺陷的人群,例如HIV-1感染病人,最终会引起致命隐球菌性脑膜炎。非编码小RNAs一般指长度为20–30nt的小RNAs,具有调节功能。新型隐球酵母能够产生大量的小RNAs,但是其生成(biogenesis)过程以及生物学功能尚未完全阐述。本文就新型隐球酵母中小RNAs的特征和产生、以及在新型隐球酵母中的生物学作用和机制进行综述。(本文来源于《菌物学报》期刊2018年10期）
涂健,祁克宗,张煜,王慧敏[7]（2018）在《非编码小RNA(RyhB)调控APEC的下游靶蛋白及致病性的功能研究》一文中研究指出研究目的:禽致病性大肠杆菌(Avian Pathogenic Escherichia coli,APEC)能引起禽类局部或全身性的急慢性感染,因其复杂的致病性,给养禽业的发展带来了严重危害,更为重要的是,APEC与人尿道致病性大肠杆菌(UPEC)高度的基因同源性,提示APEC存在公共卫生学风险,对其致病性的研究意义重大。非编码小分子RNA(s RNA)已证明是诸多致病菌调控网络的关键组成部分,其调控模式已经成为细菌调控网络中的重(本文来源于《中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第二十四次学术研讨会、中国病理生理学会动物病理生理学专业委员会第二十叁次学术研讨会、中国实验动物学会实验病理学专业委员会第叁次学术研讨会、中国兽医病理学家第叁次学术研讨会论文集》期刊2018-07-27）
何宇婷,陈茶,黄彬[8]（2018）在《环境胁迫下细菌非编码小RNA对基因表达的调控》一文中研究指出细菌非编码小RNA(sRNA)是长度约为50~500个核苷酸的RNA分子,其编码基因位于基因间区域,在细菌基因组中可被转录但不被翻译为蛋白质。随着生物信息学和RNA测序技术的发展,sRNA功能受到广泛关注。在不断变化的环境中,细菌遇到各种各样的生存压力,sRNA通过感应环境变化调节相应基因的表达,在细菌适应环境的过程中发挥了重要作用。本文对环境胁迫下细菌sRNA的表达变化和其对基因的表达调控进行综述,揭示sRNA对细菌基因转录后调控、生物适应性进化等生命过程的重要意义。(本文来源于《分子诊断与治疗杂志》期刊2018年02期）
严光文,徐晓阳,刘大伟,雷霜霜,田一男[9]（2018）在《非编码小RNA BSR1955在布鲁菌胞内生存和毒力中的作用》一文中研究指出首先采用RT-PCR鉴定布鲁菌16M在模拟胞内条件下BSR1955的转录,利用TargetRNA2预测BSR1955的靶基因;然后采用融合PCR构建BSR1955缺失株;将BSR1955插入pBBR1-MCS4质粒并电转入16M构建过表达株16M-BSR1955;分析缺失株和过表达株在模拟胞内环境和小鼠体内的存活能力。BSR1955在布鲁菌16M中存在转录且在不同刺激条件下转录水平不同;共预测出BSR1955的靶基因45个;BSR1955缺失或过表达影响布鲁菌16M在体外的生长能力,缺失BSR1955后在高盐、高渗环境中生存能力提高,第28和45天在小鼠脾脏内的细菌数量显着增加,表明BSR1955影响了布鲁菌的毒力。非编码小RNABSR1955影响布鲁菌16M在胞内的生存能力。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2018年03期）
江妍霞,胥倩,陈国安[10]（2017）在《新型非编码小RNA-piRNA在恶性血液病发病中的作用研究进展》一文中研究指出Piwi相互作用RNA(Piwi-interacting RNA,piRNA)是一类新发现的非编码小RNA,长度为24~33nt,通过特异性与Piwi蛋白结合而发挥生物学作用。以往认为piRNA在生殖干细胞分化、胚胎发育、维持生殖系DNA完整、执行表观遗传学调控和物种的性别决定等方面起重要作用,但近年研究发现piRNA也参与恶性肿瘤的发生、发展、转移及预后过程。目前,有关piRNA与恶性血液病,如白血病、多发性骨髓瘤关系的研究日益增多。本文就piRNA与恶性血液病关系的研究进展作一综述。(本文来源于《中华实用诊断与治疗杂志》期刊2017年12期）
非编码小论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)是海水养殖鱼类的重要病原菌,由杀鱼爱德华氏菌引发的爱德华氏菌病给我国水产养殖业造成了巨大的经济损失。细菌非编码小RNA是近些年来发现的一种调控因子,在转录后水平调节基因表达,参与调控环境应答、群体感应(quorum sensing)、生物膜形成、运动性和致病性等生物学过程。目前对于杀鱼爱德华氏菌的感染机制,尤其是非编码小RNA(sRNA)调控的毒力机制仍有待研究。本研究通过对不同生长环境下(正常LB培养,酸性胁迫,缺铁胁迫和氧化胁迫)培养的杀鱼爱德华氏菌提取总RNA进行高通量测序,总共发现有148个sRNA表达,其中19个是已经注释过的sRNA,其它129个未曾报道。相比正常LB培养组,共有103个sRNA在3种胁迫环境下有显着差异表达。根据测序结果,分别选取在酸性条件和氧化条件下具有显着差异表达的sRNA(命名为sR082和sR012)进行深入研究。首先,用qRT-PCR法分析了sR082和sR012在不同生长时期和不同环境胁迫压力下的表达量,结果表明,sR082在细菌生长早期和低pH条件下高表达;sR012在细菌生长对数期高表达。为了研究sR012和sR082生物学功能,利用同源重组法分别构建了sR082和sR012敲除株TXΔsR082和TXΔsR012,比较敲除株和野生株在低pH压力和氧化压力条件下的生长情况。发现TXΔsR082在pH 5条件下生长能力显着降低;TXΔsR012在氧化压力条件下生长能力显着降低。这些结果表明sR082与sR012分别与细菌适应酸性和氧化胁迫能力有关。为分析sR082与sR012对细菌感染宿主的影响,本研究分别比较了TXΔsR082,TXΔsR012与野生株TXD1感染牙鲆细胞、组织和个体能力的差异。结果表明,与TXD1相比,TXΔsR082和TXΔsR012感染牙鲆FG细胞能力、胞内复制能力、组织侵染能力以及致死能力均显着下降。这些结果表明,sR082和sR012在杀鱼爱德华氏菌耐受宿主胞内酸性和氧化环境及感染等方面发挥重要作用。为进一步了解sR012在杀鱼爱德华氏菌中的调控作用,利用TargetRNA2软件对sR012进行靶基因预测,并用qRT-PCR验证靶基因的转录水平。发现共有4个靶基因(ETAE-0114,ETAE-2575,ETAE-3156和ETAE-0911)在TXD1和TXΔsR012中有差异表达,这些结果表明sR012可能通过调控这4个靶基因适应宿主胞内氧化环境从而影响杀鱼爱德华氏菌的毒力。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
非编码小论文参考文献
[1].李宝华,戈海泽,刘树业.环境胁迫下细菌非编码小RNA对基因表达的调控[J].黑龙江医学.2019
[2].周海珍.杀鱼爱德华氏菌非编码小RNAsR082和sR012的功能研究[D].中国科学院大学(中国科学院海洋研究所).2019
[3].卞玉莹,王成,张春妮.精浆非编码小RNA与男性不育最新研究进展[J].中华男科学杂志.2019
[4].陈斌杰.肠炎沙门菌非编码小RNARyhB调控毒力相关靶基因的筛选、鉴定和功能研究[D].扬州大学.2019
[5].陈斌杰,王亨,陈艳飞,潘夏雨,袁天梅.沙门菌非编码小RNARyhB研究进展[J].畜牧兽医学报.2019
[6].张萍,李晨曦,郝晓冉,朱旭东.新型隐球酵母非编码小RNAs的研究进展[J].菌物学报.2018
[7].涂健,祁克宗,张煜,王慧敏.非编码小RNA(RyhB)调控APEC的下游靶蛋白及致病性的功能研究[C].中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第二十四次学术研讨会、中国病理生理学会动物病理生理学专业委员会第二十叁次学术研讨会、中国实验动物学会实验病理学专业委员会第叁次学术研讨会、中国兽医病理学家第叁次学术研讨会论文集.2018
[8].何宇婷,陈茶,黄彬.环境胁迫下细菌非编码小RNA对基因表达的调控[J].分子诊断与治疗杂志.2018
[9].严光文,徐晓阳,刘大伟,雷霜霜,田一男.非编码小RNABSR1955在布鲁菌胞内生存和毒力中的作用[J].中国兽医学报.2018
[10].江妍霞,胥倩,陈国安.新型非编码小RNA-piRNA在恶性血液病发病中的作用研究进展[J].中华实用诊断与治疗杂志.2017