阿尔兹海默病细胞模型中差异表达lncRNA筛选分析

论文摘要

目的:通过基因测序筛查阿尔兹海默病模型SH-SY5Y细胞中长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）的差异表达,发现与AD发病相关的lncRNA,分析其生物学功能。方法:通过Illumina X10基因测序技术检测3组AD模型SH-SY5Y细胞及正常SH-SY5Y细胞中差异表达lncRNA情况,利用GO和KEGG富集分析进一步分析lncRNA的功能,确定AD模型SH-SY5Y细胞及正常SH-SY5Y细胞的差异表达谱,Real-time PCR验证部分差异表达lncRNA。结果:差异表达lncRNA共100个,其中40个lncRNA表达上调,60个lncRNA表达下调;GO和KEGG通路分析表明这些差异表达基因主要参与到MAPK信号通路、p53信号通路、细胞周期等信号通路。Real-time PCR验证结果显示7个差异表达的lncRNA上调或下调趋势与测序结果一致。结论:与正常SH-SY5Y细胞相比,AD模型SH-SY5Y细胞中lncRNA的表达水平明显改变,这些lncRNA可能通过某些信号通路参与AD的发生发展,这对进一步寻找诊断和治疗AD的新靶点具有重要意义。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张园青,赵志英,魏谢泽,张明

关键词: 阿尔兹海默病,测序技术,差异表达

来源: 包头医学院学报 2019年12期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 精神病学

单位: 包头医学院

基金: 国家自然科学基金项目(№.81560195),内蒙古自然科学基金项目(№.2019MS08059)

分类号: R749.16

DOI: 10.16833/j.cnki.jbmc.2019.12.018

页码: 42-44

总页数: 3

文件大小: 497K

下载量: 60

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标签：阿尔兹海默病论文;  测序技术论文;  差异表达论文;