小反刍兽疫病毒四川简阳株N基因的系统进化分析

小反刍兽疫病毒四川简阳株N基因的系统进化分析

论文摘要

为了调查小反刍兽疫病毒四川简阳株(SCJY株)的分子遗传特征,我们对四川简阳发病羊鼻拭子中的小反刍兽疫病毒N基因进行了遗传进化分析。通过RT-PCR、克隆测序获得SCJY株N基因序列,使用DNASTAR软件将其与GenBank中的15条参考株序列进行同源性比对,使用MEGA6软件进行系统进化分析。结果显示:SCJY株N基因序列全长1578nt,与参考株的核苷酸同源性为88.9%~100%,氨基酸同源性为92.8%~100%,与2013~2014年小反刍兽疫中国流行毒株高度同源;系统进化分析将16个毒株N基因划分为4个谱系,SCJY株属于Ⅳ系。

论文目录

  • 1 材料
  •   1.1 主要试剂
  •   1.2 PPRV阳性材料
  •   1.3 引物
  • 2 方法
  •   2.1 PPRV SCJY株N基因的扩增和序列测定
  •     2.1.1 核酸提取
  •     2.1.2 RT-PCR扩增和序列测定
  •   2.2 PPRV基因组序列分析
  • 3 结果
  •   3.1 PPRV SCJY株N基因的扩增及测序结果
  •   3.2 PPRV SCJY株N基因的同源性分析结果
  •   3.3 PPRVSCJY株N基因的系统进化分析结果
  • 4 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张毅,张东,陈斌,蔡冬冬,裴超信,李春

    关键词: 小反刍兽疫病毒,核衣壳蛋白基因,四川简阳株,系统进化分析

    来源: 四川畜牧兽医 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 四川省动物疫病预防控制中心

    分类号: S852.65

    页码: 31-33+35

    总页数: 4

    文件大小: 1661K

    下载量: 66

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