吕建霞[1]2004年在《化学计量学新算法在实际生化体系中的定量构效关系研究》文中认为定量构效关系研究是化学计量学的重要分支。本论文主要是基于应用本实验室提出并发展的几个新的化学计量学算法，对一些实际的生化体系进行了定量构效关系分析。 建立定量构效关系模型第一步是计算大量的分子描述符，下一步则是从这些描述符中选取与所研究对象最相关的描述符，即变量选择。本论文采用本实验室最近引入化学计量学的粒子群优化算法(particle swarm optimization，PSO)来进行变量选择，选出的变量用多元线性回归方法建模。基于这样的方法对环氧酶抑制剂的活性和选择性以及芳香族化合物的毒性进行了定量构效关系分析。结果发现粒子群优化算法用于变量选择可得到与遗传算法相媲美的结果。 神经网络是一个优异的非线性建模工具，但其突出的缺点就是潜在的预收敛到局部最优点或过拟合导致的错误预报模式；为了改善神经网络的性能，引入了混沌的概念来辅助遗传算法训练神经网络(Chaotic Genetic Artificial Neural Network，CGANN)。基于这个方法，对偏端霉素类衍生物的生物活性进行了建模，并同传统的偏最小二乘方法进行了比较。结果发现，CGANN在训练能力和预测能力上都明显优于PLS，充分说明CGANN作为强大的非线性关系处理工具有独特的优势。另外，杂交的粒子群优化算法也可以用来训练神经网络(Hybrid Particle Swarm Optimization Neural Network，HPSONN)。用这个方法对血小板衍化生长因子受体磷酸化作用的抑制剂进行了定量构效关系分析，发现该方法得到的结果比多元线性回归方法也有很大的改善。 通过对建模所用变量的分析，能够得到一些药物与生物大分子作用的信息，对以后的药物合成有一定的指导作用。
吕庆章[2]2003年在《基于混沌的化学计量学新算法研究及基于量子化学计算的构效关系研究》文中指出定量构效关系(QSAR)研究是化学计量学的重要分支。神经网络是一个优异的非线性建模工具，但其突出的缺点就是潜在的预收敛到局部最优点或过拟合导致的错误预报模式；遗传算法用于优化过程其目的是为了避免陷入局部最优点，但事实上由于在传统遗传算法的进化过程中只有少数最好的成员被保留下来用于产生子代成员，经过一定代数的进化后群体成员的多样性就会显着下降，也很可能过早收敛到局部最优点。为了克服这些缺点，混沌动力学模型被引入到了化学计量学算法的研究之中。混沌映射自身固有的对初始状态的敏感性，形似随机实有确定轨道永不回头的绝对遍历运行机制，为更好的化学计量学方法研究带来了曙光。混沌动力学数学模型可以直接用作搜索算法训练神经网络，但这一方法还有待研究。混沌动力学模型用于遗传算法的突变操作，可以使传统遗传算法群体成员多样性逐渐消失的现象得到解决，它克服了传统GA中可能的近亲繁衍情况，这正是传统GA过早收敛导致局部最优的原因。该策略不仅很大程度上克服了传统遗传方法可能的局部最优问题，而且混沌的不可捉摸的行为特征也使得该算法有效地克服了神经网络训练的过拟合问题。该方法的有效性在基于物理化学和量子化学参数的四面体卤化物的振动频率预测、基于物理化学参数的八面体六卤化物的振动频率预测、基于物理化学参数的氟相分配系数预测、以及基于量子化学密度泛函计算的氯氟碳化合物代替品的大气寿命预测中都得到了体现。尤其是在对大气寿命的预测上，由于数据结构不好，传统遗传算法很容易产生过拟合现象，但混沌突变的遗传算法很好地避免了该现象的发生。 基于“优生”这一新概念提出了一个新的优势进化算法，该方法能够快速收敛，它采取的全局撒网快速收敛的策略很好地解决了遗传算法在局部最优点附近的游荡式行为所造成的时间浪费，之所以它有如此的特征可能和它潜在的方向选择性有关。结合混沌来初始化优势进化算法的群体成员，还设计了基于混沌初始化群体成员的循环优势进化方法，该方法在混沌保证每次优势进化绝对不同的初始群体成员的情况下，不仅具有了优势进化的快速收敛优点而且有混沌映射保证群体成员的高度多样性，从而可以快速探测很多局部最优点，大大提高了找到全局最优点的机会，用它训练神经网络预测四卤化物振动频率研究充分体现了该策略的优越性。该方法可以应用到很多的优化问题之中，有很高的借鉴价值。 基于量子化学模拟计算，对四苯基铁卟啉及其7个卤素取代衍生物在催化氧摘要(ABSTRACT)化烷烃反应中的催化活性作为QSAR研究。分析了这些分子的电子结构特点及与催化活性的关系。详细讨论了氧分子在这些分子表面的活化模拟过程。发现较低的HOMO能级和铁原子上较大电子密度有利于铁叶琳具有较高的催化活性。四个苯基平面保持与叶琳的马鞍面交叉也有利于具有高催化活性。 量子化学参数的运用能够提高QSAR研究的效果并且为QSAR研究提供了又一个手段。量子化学分子模拟可以使QSAR研究提高到一个新的理论高度，同时量子化学模拟也能在QSAR的基础上做出更有针对性、更深层次的研究。两者结合的魅力在前面提到的研究体系中得到了充分的体现。
参考文献：
[1]. 化学计量学新算法在实际生化体系中的定量构效关系研究[D]. 吕建霞. 湖南大学. 2004
[2]. 基于混沌的化学计量学新算法研究及基于量子化学计算的构效关系研究[D]. 吕庆章. 湖南大学. 2003