香蕉MaMPK1基因的克隆与表达模式

香蕉MaMPK1基因的克隆与表达模式

论文摘要

为研究香蕉MAPK1的序列特征及其在不同激素处理、逆境胁迫下的表达趋势,以‘天宝蕉’为材料,采用RTPCR技术克隆MaMPK1并对其进行生物信息学分析和不同处理下的表达模式分析.结果显示该基因编码区长为1182bp,可编码393个氨基酸.其编码蛋白具有STKc_TEY_MAPK结构域,属于MAPK基因家族TEY亚型A亚家族,是不稳定的脂溶性亲水酸性蛋白,无信号肽和跨膜结构,有多个磷酸化位点.亚细胞定位预测结果显示MaMPK1主要定位于细胞核.蛋白互作预测结果显示该蛋白与HSFA4A存在互作,暗示其可能在香蕉抗热反应过程中发挥作用.启动子顺式作用元件预测结果显示MaMPK1启动子包含多种激素和逆境胁迫相关作用元件.定量分析结果显示MaMPK1的表达受SA、45℃、低温和盐胁迫抑制,受茉莉酸甲酯(MeJA)和枯萎病菌侵染诱导上调,在脱落酸(ABA)处理后期极显著上调表达.本研究表明MaMPK1广泛参与香蕉逆境胁迫应答.(图9表1参35)

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 MaMPK1 gDNA和cDNA克隆验证
  •     1.2.2 生物信息学分析
  •     1.2.3 进化树构建
  •     1.2.4 启动子作用元件分析
  •     1.2.5 实时荧光定量表达分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 MaMPK1基因gDNA和cDNA克隆验证及生物信息学
  •   2.2 MaMPK1系统进化关系
  •   2.3 MaMPK1启动子区顺式作用元件
  •   2.4 MaMPK1在不同组织部位和处理下的表达模式
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孙雪丽,刘范,田娜,Bodjrenou Mahoudjro David,项蕾蕾,程春振

    关键词: 香蕉,基因克隆,生物信息学分析,表达模式

    来源: 应用与环境生物学报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑,农业科技

    专业: 生物学,园艺

    单位: 福建农林大学园艺学院园艺植物生物工程研究所

    基金: 国家自然科学基金项目(31601713),福建农林大学“校杰出青年科研人才”计划项目(xjq201721),福建省中青年教师教育科研项目(JAT160166),福建省高原学科建设经费(102,71201801101),国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-32-11)资助~~

    分类号: S668.1;Q943.2

    DOI: 10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.10027

    页码: 985-992

    总页数: 8

    文件大小: 4818K

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