微泡菌ALW1几丁质酶Chi18A的克隆及信息学分析

论文摘要

以微泡菌（Microbulbifer sp.）ALW1的基因组为模板,利用几丁质酶基因的特异性引物进行PCR扩增,然后将产物插入到pMD18-T载体后进行DNA序列测定,并对目的基因编码的蛋白质序列进行信息学分析。结果显示,克隆的目的基因大小为1644 bp,预测编码含有547个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白质序列与其他菌株来源的几丁质酶序列具有70%左右的相似性,表明预测目的基因编码几丁质酶。该蛋白质具有2个几丁质结合结构域和1个GH18家族酶的催化结构域,属于糖苷水解酶（glycoside hydrolase,GH）家族18,命名为几丁质酶Chi18A。模拟的三维结构显示,Chi18A含有（βα）8桶状结构。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李鹤宾,梁梅芳,陈仲巍,姜泽东,倪辉,朱艳冰

关键词: 微泡菌,几丁质酶,克隆,信息学分析

来源: 集美大学学报(自然科学版) 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 厦门医学院药学系,集美大学食品与生物工程学院

基金: 福建省自然科学基金项目(2016J01162)

分类号: Q78

DOI: 10.19715/j.jmuzr.2019.03.04

页码: 179-185

总页数: 7

文件大小: 7441K

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