导读:本文包含了随机扩增多态性技术论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:多态性,技术,链式反应,分枝,杆菌,病毒,结核。
随机扩增多态性技术论文文献综述
王羽,董文龙,张喜庆,马红霞,高云航[1]（2017）在《随机扩增多态性DNA技术对绿色气球菌的相关性分析》一文中研究指出随着分子生物学的发展,16S、23S rRNA以及16S~23S rRNA已应用于菌种鉴定。16S~23S rRNA的基因间隔区相对于前两者有较高的变异性,弥补了16S和23S rRNA保守性强,分化程度不够的缺点。本研究对7株绿色气球菌和两株屎肠球菌扩增16S~23S rRNA基因间隔序列。通过随机扩增多态性DNA技术分析绿色气球菌DNA,评价不同菌株间的克隆相关性及耐药性。(本文来源于《中国兽药杂志》期刊2017年12期）
刘雪,邢益平,严玉娟,韩亚萍,严友德[2]（2017）在《随机扩增多态性技术联合荧光定量高敏检测叁种疱疹病毒方法的建立》一文中研究指出目的:建立一种随机扩增多态性技术(RAPD)联合荧光定量聚合酶链式反应(q PCR)高敏定量检测单纯疱疹病毒(HSV)、人类巨细胞病毒(HCMV)、水痘带状疱疹病毒(VZV)的新方法。方法:根据文献筛选出数十条随机引物,分别对叁种疱疹病毒进行随机扩增,产物经2%琼脂糖凝胶电泳,选取稳定清晰条带进行分离、纯化及克隆测序,应用blast-nr比对genebank现有病毒序列,选取高于99%匹配度的基因序列作为目的片段,并在其内部用primer3.0设计特异性内引物。经过引物筛选及条件优化后建立RAPD联合q PCR检测新方法,分别检测叁种疱疹病毒。结果:经过筛选,确定了HSV、HCMV、VZV扩增灵敏性及特异性最好一组引物,建立的RAPD-q PCR可分别检测出1:10~6 HSV、1:10~5 HCMV和1:10~5 VZVDNA,而单一q PCR仅能检测1:10~3 HSV、1:10~2HCMV和1:103 VZVDNA。RAPD-q PCR相比于单一q PCR灵敏性提高100-1000倍,RAPD-q PCR扩增大于1:10~5病毒DNA得到的CT值均小于22.96±0.81,与10~2 copies/μL的标准线相距远,易于区分阴性和阳性。此外,用乙型肝炎病毒及疱疹病毒互为对照未见非特异扩增,特异性好。结论:随机扩增多态性技术联合荧光定量是一种检测叁种病毒高度灵敏及特异的检测方法。(本文来源于《现代生物医学进展》期刊2017年21期）
严玉娟,邢益平,施旭东,严友德,艾月梅[3]（2016）在《随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立》一文中研究指出目的结合随机扩增多态性技术(RAPD)和荧光定量聚合酶链式反应技术(qPCR)的优势,建立快速、准确地检测结核分枝杆菌的新方法。方法根据国内外文献设计随机引物,以结核分枝杆菌标准菌株H37Rv为模板进行RAPD,产物进行琼脂糖凝胶电泳,选取条带进行割胶纯化测序,在美国国家生物技术信息中心(NCBI)的基本局部比对搜索工具(BLAST)程序上进行同源性检索,结果和结核分枝杆菌匹配率都达到99%。设计特异性内引物和探针,以RAPD产物为模板进行qPCR,并优化反应条件。分别以10倍梯度稀释的一系列浓度的H37Rv和其他阴性对照菌为模板,进行qPCR和RAPD-qPCR,分析其灵敏性和特异性。结果 qPCR能够检测到30pg/μl的结核分枝杆菌,而RAPD-qPCR灵敏性提高到3fg/μl。而且RAPD-qPCR检测30pg/μl至30fg/μl的结核分枝杆菌核酸时,扩增得到的Ct值都较小[(6.58±0.19)~(14.95±0.36)],结果稳定,易于判断。qPCR和RAPD-qPCR检测其他临床常见的细菌均呈现阴性。结论 RAPD-qPCR是一种快速、准确地检测出结核分枝杆菌的新方法。(本文来源于《江苏医药》期刊2016年11期）
严玉娟[4]（2016）在《随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立与评估》一文中研究指出背景:结核病(Tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌引起的一种慢性呼吸道传染病,严重危害人类的健康,曾夺去了数亿人的生命。近年来,随着人口流动的增加,HIV感染的流行,多耐药位点的出现,结核病的流行又出现回升。因此,早期、快速、准确地诊断结核分枝杆菌的感染对于疾病的治疗和控制传播具有重要的意义。传统的涂片染色镜检敏感性较低,培养法耗时较长,操作繁琐。免疫学检测受到受试者免疫状态的影响,容易出现假阳性和假阴性。分子生物学检测方法如荧光定量PCR、巢式PCR、环介导的等温扩增技术及Xpert MTB/RIF技术大大提高了结核病的诊断效率,但是对于涂片阴性的结核病、肺外结核、小儿结核以及和HIV共感染的结核病,诊断的敏感性不够理想。目的:鉴于实验室诊断结核性疾病的局限性,本研究设计一种更简便、快速,灵敏性更高、特异性更强的方法用于辅助诊断结核性疾病。方法:以结核分枝杆菌标准菌株H37Rv为模板,根据国内外文献设计随机引物,进行RAPD,产物进行琼脂糖凝胶电泳,选取条带进行割胶纯化测序,在NCBI上进行BLAST同源性检索,结果和结核分枝杆菌匹配率都达到99%。设计特异性内引物和探针,以RAPD产物为模板进行荧光定量PCR,并优化反应条件。分别以10倍倍比梯度稀释的H37Rv和其他阴性对照菌为模板,进行qPCR和RAPD-qPCR,分析其灵敏性和特异性,建立了 RAPD-qPCR的方法来检测结核分枝杆菌。进一步优化反应条件,采集150个结核性临床标本和26个非结核性临床标本(包括痰液、支气管肺泡灌洗液、胸水),分别用结核分枝杆菌核酸检测试剂盒(PCR-荧光法)和RAPD-qPCR方法检测,评估两种方法检出率的差别。结果:qPCR能够检测到30 pg/μl的结核分枝杆菌,而RAPD-qPCR灵敏性提高到3 fg/μl。而且RAPD-qPCR检测30 pg/μl至30 fg/μl的结核分枝杆菌核酸时,扩增得到的Ct值都较小,为(6.58±0.19)～(14.95±0.36),结果稳定,易于判断。qPCR和RAPD-qPCR检测其他临床常见的细菌均呈现阴性,特异性达到了100%。RAPD-qPCR对150个结核性标本检出率达到27.33%,结核分枝杆菌核酸检测试剂盒(PCR-荧光法)检出率为22.67%,差异具有统计学意义。两种方法检测26个非结核性临床标本结果均呈现阴性,两种方法特异性都达到100%。结论:该方法对于临床结核分枝杆菌感染具有较高的检出率,优于传统的结核分枝杆菌核酸检测试剂盒(PCR-荧光法),特异性也达到100%,能够用于临床结核分枝杆菌感染的分子生物学检测。(本文来源于《南京医科大学》期刊2016-04-01）
刘湘丹,高昱,张亚利,蔡嘉洛,童巧珍[5]（2015）在《随机扩增多态性DNA技术对湘产蛇莓种质资源的遗传多样性分析》一文中研究指出目的:研究湘产蛇莓种质资源的遗传多样性。方法:建立不同地理分布的蛇莓种质资源随机扩增多态性DNA(RAPD)反应体系,RAPD-聚合酶链反应(PCR)法检测湘产24组蛇莓样本(21个野生品,3个栽培品),琼脂糖凝胶电泳分析结果,计算等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、多态性位点百分比(PPB)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon’s信息指数(I)。结果:筛选出多态性引物14条,共扩增出90条电泳谱带,其中多态带为81条,Na为1.900 0,Ne为1.540 1,PPB为90.0%,H为0.312 8,I为0.467 5。结论:湘产蛇莓各区域样本间遗传多样性丰富,人工栽培品与野生品之间存在遗传背景上的差异,聚类结果与地理分布表现出明显相关性。(本文来源于《中国药房》期刊2015年19期）
杨志俊,胡云[6]（2014）在《随机扩增多态DNA技术在鼠类种属来源判定中的应用研究》一文中研究指出目的研究如何运用随机扩增多态DNA(RAPD)技术判定鼠类种属及来源。方法取鼠尾组织制备DNA基因组,并进行RAPD扩增,以强带差异来区分鼠类遗传多态性。结果建立了褐家鼠DNA快速制备方法,并获得基因图谱。根据120条引物各自表现出的不同多态性,合成一组褐家鼠的通用引物,定名为P1(5′-TCG GCG GTT C-3′)、P2(5′-GAGAGC CGT C-3′)、P3(5′-ATG GCA TCT C-3′)和P4(5′-CTT GGC ACG A-3′),结果显示,该组引物对褐家鼠在目的片段(925 bp)处均有良好的扩增。结论分析个体DNA序列同源程度判断遗传距离大小,可鉴别鼠的来源是否为输入性鼠类,对追溯某种鼠类扩散途径和历史以及预警鼠传疾病提供科学依据。(本文来源于《中国媒介生物学及控制杂志》期刊2014年06期）
Fabiola,MORENO-OLIVAS,Vincent,U.GANT,Jr.,Kyle,L.JOHNSON,Jose,R.PERALTA-VIDEA,Jorge,L.GARDEA-TORRESDEY[7]（2014）在《随机扩增多态性DNA技术研究发现二氧化钛纳米颗粒对西葫芦具有基因毒性(英文)》一文中研究指出研究目的:二氧化钛(TiO2)纳米颗粒已经广泛应用于化妆品、防晒霜、涂料和牙膏等。这些纳米颗粒性质非常稳定,能在废水和生物固体中转移和分散。现有研究表明,TiO2纳米颗粒对动物正常生理活动具有毒性等负面作用。但是,它们对植物是否具有毒性特别是是否会产生植物基因毒性至今尚不清楚。因此,本文使用随机扩增多态性DNA技术研究TiO2纳米颗粒是否对西葫芦具有基因毒性,为TiO2纳米颗粒排放进入环境后的潜在植物毒性风险评价提供依据。创新要点:首次发现了TiO2纳米颗粒对西葫芦具有基因毒性。重要结论:采用随机扩增多态性DNA技术,发现TiO2纳米颗粒污染处理的西葫芦样品与未处理样品的基因组DNA图谱相比,不仅在谱带强度有明显差异,而且存在谱带消失和新谱带产生现象,表明TiO2纳米颗粒对西葫芦具有基因毒性。(本文来源于《Journal of Zhejiang University-Science A(Applied Physics & Engineering)》期刊2014年08期）
纪宝玉,裴莉昕,陈随清,董诚明,冯卫生[8]（2014）在《野葛种质资源的随机扩增多态性DNA技术分析》一文中研究指出目的:建立野葛RAPD分子标记技术并对野葛种质资源遗传背景进行探讨。方法:结合葛根素的测定,应用RAPD技术对11个产地野葛进行遗传多样性分析。结果:葛根素含量在3.26%~7.10%,8条引物共扩增出45条带,其中37条呈多态性,发现RAPD多态位点为82.22%,证明在野葛种质资源中存在较丰富的遗传多样性。结论:我国野葛具有明显的遗传分化,这些遗传分化是野葛种质资源筛选的关键。(本文来源于《中国实验方剂学杂志》期刊2014年16期）
胡能兵,何克勤,张子学,林平,隋益虎[9]（2012）在《甜叶菊随机扩增多态性DNA技术优化及亲缘关系研究》一文中研究指出以甜叶菊为试材,对影响其随机扩增多态性DNA标记反应体系的7个因子进行优化,同时对来自国内外的12个品种进行亲缘关系分析。结果表明,20μL的优化体系包括:双蒸水13.6μL,10×Buffer(含15mmol/LMgCl2)溶液3μL,2.5mmol/L的dNTPS1.2μL,10μmol/L的引物1μL,20ng的模板DNA1μL,1UTaq聚合酶;热循环程序为:94℃预变性4min,94℃变性30s,35℃退火30s,72℃延伸1min,40个循环,最后72℃延伸7min。聚类图结果表明,品种间的遗传距离变异范围为0.12～0.88,在遗传距离为0.37时,8个引物可将12个品种分为四大类,来自日本的2个品种与国内品种关系较远。(本文来源于《食品工业科技》期刊2012年05期）
陈婷[10]（2011）在《随机扩增多态性DNA技术鉴定单核细胞增生李斯特菌的研究》一文中研究指出食源性致病菌是引起各类食物安全事件的重要诱因之一,世界各国由于食源性致病菌污染饮食,而爆发的食品安全事件时有发生,特别是近些年来由单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)引起的食物中毒事件急剧增长,已在日常生活中随处可见,特别是在肉制品和奶制品中,因单增李斯特菌污染食物而致人患病的事件已严重影响人类的正常生活。该菌之所以在现代生活中能广泛存在我们的饮食中,一方面由于该菌耐低温,且在低温条件下生长良好；另一方面因为现代人越来越多饮食速食食品和冷藏食品,这些习惯为单增李斯特菌的生长和传播提供良好的条件,因此,目前急需建立一种快捷、高效、操作简便的检测辨别技术确定单增李斯特菌,为我们的饮食安全树立一道安全屏障。RAPD检测技术起源于20世纪90年代,其方法由于利用随机引物对样品DNA进行扩增,事先不需要知道被测样品的基因序列,且扩增的多态性条带可用于样品间亲缘关系的分析,故被研究学者广泛应用于各个领域,从而形成一项比较成熟的技术。本论文旨在通过对自主设计的10条随机引物进行RAPD-PCR扩增,依据扩增图谱带型多样性、清晰度和重复性等方面的分析,筛选出对李斯特菌属属内菌株有特异性的引物,以及对单增李斯特菌分离株有特异性的引物,从分子分型方向对单增李斯特菌分离株进行同源性分析,鉴别出各分离株与单增李斯特菌标准株CMCC54004间的亲缘相互关系,并依据特异性引物扩增获得特异性条带以区别除单增李斯特菌之外的属外其它菌株,以期建立快速检测农副产品中单增李斯特菌的目的。通过试验,获得一下结论：(1)采用四种DNA提取方法提取单增李斯特菌样品DNA,通过对DNA提取方法的优化,筛选出可获得高质量、高重复性模板DNA的提取方法——基因组DNA试剂盒提取法；(2)通过对RAPD-PCR反应体系中DNA浓度、聚合酶浓度、引物浓度、dNTP Mixture浓度和Mg2+浓度5个实验因子进行单因素实验和正交实验分析,确定最优的反应体系为：总体积为20μL,其中各成分浓度为200μM dNTP Mixture、20pmol引物浓度、5 mM Mg2+浓度、2 U Taq DNA聚合酶浓度、50 ng模板DNA浓度；(3)依据筛选出的最优反应程序,对10条随机引物特异性筛选,确定通过引物AM 09 (5'-TGGTGACCGT-3')可特异性区分单增李斯特菌各分离株,利用组合引物AM 07+AM 09可特异性区分李斯特菌属内6种标准株,且利用引物AM 09扩增单增李斯特菌CMCC 54004获得473 bp特异性带型,可区分除单增李斯特菌之外的菌株,因此这条特异性带型结合引物AM 09可用于食物中单增李斯特菌污染情况的调查研究,对单增李斯特菌分离株的分型研究也很有用处；(4)依据能否扩增473 bp特异性条带,通过人工模拟污染实验以及对纯菌液RAPD检测技术检出限的确定,结果表明牛奶和牛肉增菌3 h后可检测出特异性带型,检出限分别为1.79×105 cfu/mL和2.48×105 cfu/mL,黄瓜中的检出限为1.98 X 105cfu/mL,需增菌6 h。因此从模拟实验中证实本试验设计的方案可用于实际应用中的样品检测。(本文来源于《华中农业大学》期刊2011-06-01）
随机扩增多态性技术论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:建立一种随机扩增多态性技术(RAPD)联合荧光定量聚合酶链式反应(q PCR)高敏定量检测单纯疱疹病毒(HSV)、人类巨细胞病毒(HCMV)、水痘带状疱疹病毒(VZV)的新方法。方法:根据文献筛选出数十条随机引物,分别对叁种疱疹病毒进行随机扩增,产物经2%琼脂糖凝胶电泳,选取稳定清晰条带进行分离、纯化及克隆测序,应用blast-nr比对genebank现有病毒序列,选取高于99%匹配度的基因序列作为目的片段,并在其内部用primer3.0设计特异性内引物。经过引物筛选及条件优化后建立RAPD联合q PCR检测新方法,分别检测叁种疱疹病毒。结果:经过筛选,确定了HSV、HCMV、VZV扩增灵敏性及特异性最好一组引物,建立的RAPD-q PCR可分别检测出1:10~6 HSV、1:10~5 HCMV和1:10~5 VZVDNA,而单一q PCR仅能检测1:10~3 HSV、1:10~2HCMV和1:103 VZVDNA。RAPD-q PCR相比于单一q PCR灵敏性提高100-1000倍,RAPD-q PCR扩增大于1:10~5病毒DNA得到的CT值均小于22.96±0.81,与10~2 copies/μL的标准线相距远,易于区分阴性和阳性。此外,用乙型肝炎病毒及疱疹病毒互为对照未见非特异扩增,特异性好。结论:随机扩增多态性技术联合荧光定量是一种检测叁种病毒高度灵敏及特异的检测方法。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
随机扩增多态性技术论文参考文献
[1].王羽,董文龙,张喜庆,马红霞,高云航.随机扩增多态性DNA技术对绿色气球菌的相关性分析[J].中国兽药杂志.2017
[2].刘雪,邢益平,严玉娟,韩亚萍,严友德.随机扩增多态性技术联合荧光定量高敏检测叁种疱疹病毒方法的建立[J].现代生物医学进展.2017
[3].严玉娟,邢益平,施旭东,严友德,艾月梅.随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立[J].江苏医药.2016
[4].严玉娟.随机扩增多态性技术联合荧光定量PCR检测结核分枝杆菌方法的建立与评估[D].南京医科大学.2016
[5].刘湘丹,高昱,张亚利,蔡嘉洛,童巧珍.随机扩增多态性DNA技术对湘产蛇莓种质资源的遗传多样性分析[J].中国药房.2015
[6].杨志俊,胡云.随机扩增多态DNA技术在鼠类种属来源判定中的应用研究[J].中国媒介生物学及控制杂志.2014
[7].Fabiola,MORENO-OLIVAS,Vincent,U.GANT,Jr.,Kyle,L.JOHNSON,Jose,R.PERALTA-VIDEA,Jorge,L.GARDEA-TORRESDEY.随机扩增多态性DNA技术研究发现二氧化钛纳米颗粒对西葫芦具有基因毒性(英文)[J].JournalofZhejiangUniversity-ScienceA(AppliedPhysics&Engineering).2014
[8].纪宝玉,裴莉昕,陈随清,董诚明,冯卫生.野葛种质资源的随机扩增多态性DNA技术分析[J].中国实验方剂学杂志.2014
[9].胡能兵,何克勤,张子学,林平,隋益虎.甜叶菊随机扩增多态性DNA技术优化及亲缘关系研究[J].食品工业科技.2012
[10].陈婷.随机扩增多态性DNA技术鉴定单核细胞增生李斯特菌的研究[D].华中农业大学.2011
论文知识图
