玉米转录因子NF-YB基因家族的生物信息学分析

论文摘要

为揭示玉米NF-YB基因家族的功能,本研究利用生物信息学手段,鉴定了玉米NF-YB基因家族,并系统的分析了该基因家族各蛋白的理化性质、基因的染色体定位、保守结构域、基因结构、系统进化、磷酸化位点、启动子和基因组织表达。结果表明:玉米基因组中含有21个NF-YB基因,所编码的蛋白质均位于细胞核,且不含有跨膜结构。这些基因不均匀地分布于玉米的9条染色体上,均含有高度保守的结构域CBFDNFYBHMF,系统进化分析将其分为3类。磷酸化位点分析表明,玉米NF-YB家族存在着大量的磷酸化位点。启动子分析表明,基因家族启动子区域均含有大量的逆境胁迫应答顺式作用元件。组织表达分析发现,至少有18个基因可以进行表达,其中有5个基因表现出组织特异性,不同基因在不同组织、不同时期的表达具有时序性。玉米NF-YB基因家族核心结构域的保守性、基因功能的分化、启动子序列中的大量逆境相关元件、基因表达的差异性,可能都是玉米更好调控自身生长发育和适应逆境的结果。研究结果为进一步解析玉米NF-YB基因家族的功能提供参考。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 徐志军,刘洋,徐磊,安东升

关键词: 基因家族,理化性质,基因结构,启动子,表达分析

来源: 分子植物育种 2019年12期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 中国热带农业科学院湛江实验站,广东省旱作节水农业工程技术研发中心

基金: 广东省自然科学基金项目(2016A030307007),中国热带农业科学院科技创新团队专项资金项目(163010-2017002)共同资助

分类号: Q943.2;S513

DOI: 10.13271/j.mpb.017.003807

页码: 3807-3816

总页数: 10

文件大小: 550K

下载量: 320

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