中国大鲵卵巢发育基因Rspo1和β-catenin的克隆与差异表达分析

中国大鲵卵巢发育基因Rspo1和β-catenin的克隆与差异表达分析

论文摘要

Rspo1(R-spondin1)和β-catenin所参与的Rspo1/Wnt/β-catenin信号通路是Wnt介导的经典信号通路之一,在雌性性别决定和分化中扮演着重要角色。近年来,Rspo1和β-catenin基因在生殖系统中的作用越来越受到重视,尤其是在脊椎动物早期性别决定和分化中。本研究扩增获得中国大鲵Rspo1和β-catenin基因cDNA全长序列,并进行了序列分析,同时选取了NCBI上公布的多个物种的Rspo1和β-catenin基因的核苷酸编码序列及氨基酸序列构建了系统发育树。最后通过荧光定量实验探究中国大鲵Rspo1和β-catenin基因在中国大鲵幼年及成年的雌雄组织中的表达情况,并综合分析了其他性腺发育相关基因FoxL2、Cyp19a、Dmrt1、Sox9在不同发育阶段卵巢中的相对表达水平,探讨Rspo1和β-catenin基因在中国大鲵卵巢发育过程中的作用。得到以下结果:1.中国大鲵Rspo1 cDNA序列全长902bp,编码261aa,其编码蛋白具有一个N端信号肽,2个furin-like结构域(FU1和FU2),一个凝血酶敏感蛋白1型结构域(TSP1)。中国大鲵Rspo1编码蛋白存在信号肽和核定位信号区(NLS),我们推测其与其他动物Rspo1编码蛋白信号肽相似,存在于内质网和高尔基体中,并处于经典分泌途径中。同样中国大鲵Rspo1蛋白中存在一个保守的N-糖基化位点,说明其参与了经典Wnt/β-catenin信号通路的调控。2.中国大鲵β-catenin cDNA序列全长2343bp,编码780aa,其编码蛋白序列含有12个Armadillo(arm)重复区结构域,与其他脊椎动物的12arm对比发现高度相似,只有个别氨基酸序列不同。哺乳动物β-catenin中的重要磷酸化位点中,除了Y3其余磷酸化位点在中国大鲵中都存在,推测这些磷酸化位点在哺乳动物中具有的功能同样也在中国大鲵β-catenin蛋白中存在。3.通过基因进化比较分析发现:中国大鲵Rspo1基因核苷酸编码序列与两栖类形成一个分支并在分支的最外围,而蛋白质序列与爬行类和鸟类聚为一个大群并处在最外围;中国大鲵β-catenin核苷酸编码序列并未与两栖类形成一簇而与爬行类和鸟类形成一个分枝并位于分枝的最外围,其蛋白质序列与两栖类聚为一簇并处于最外围。4.中国大鲵Rspo1和β-catenin在中国大鲵性腺发育早期调控卵巢的发育和分化。中国大鲵Rspo1和β-catenin在其他组织中均有表达,并且具有明显的时空特异性与雌雄差异性。5.结合中国大鲵卵巢发育相关因子Rspo1和β-catenin和雄性性别决定信号通路特异因子Sox9、Dmrt1以及雌性性别决定信号通路特异因子FoxL2、Cyp19a在中国大鲵不同发育阶段卵巢中的表达量,初步提出了Rspo1和β-catenin在中国大鲵性腺发育中所参与的遗传模式图,为揭示两栖动物特别是隐鳃鲵科卵巢分化和发育的遗传模式提供了基础的理论依据。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 文献综述
  •   1.1 Rspo1和β-catenin的由来和结构
  •   1.2 Rspo1和β-catenin介导的信号通路
  •   1.3 Rspo1和β-catenin在脊椎动物性别决定与分化研究进展
  •   1.4 Rspo1和β-catenin其他功能研究进展
  •   1.5 本研究的目的及研究意义
  • 2 材料和方法
  •   2.1 实验样品采集
  •   2.2 试剂及主要试剂的配制
  •     2.2.1 本研究所用的试剂及菌种
  •     2.2.2 主要试剂的配制
  •   2.3 实验仪器设备
  •   2.4 模板制备
  •     2.4.1 动物的采集与处理
  •     2.4.2 各组织总RNA的提取
  •     2.4.3 普通反转录
  •     2.4.4 3'-RACE模板的制备
  •     2.4.5 5'-RACE模板的制备
  •   2.5 引物设计
  •   2.6 Rspo1基因全长序列和β-catenin基因部分片段获得
  •     2.6.1 PCR扩增
  •     2.6.2 PCR产物的回收
  •     2.6.3 连接
  •     2.6.4 转化
  •     2.6.5 摇床培养,筛选及送测
  •   2.7 β-catenin基因的3’RACE扩增
  •   2.8 β-catenin基因的5’RACE扩增
  •   2.9 序列分析和进化分析
  •   2.10 实时荧光定量PCR
  •     2.10.1 荧光定量PCR引物的设计
  •     2.10.2 最适退火温度的选择
  •     2.10.3 各组织中Rspo1和β-catenin基因的表达检测
  •     2.10.4 不同发育时期卵巢组织中Rspo1和β-catenin及其他性腺相关基因的表达检测
  •     2.10.5 数据分析
  • 3 结果
  •   3.1 中国大鲵总RNA提取结果
  •   3.2 PCR扩增结果
  •     3.2.1 Rspo1 基因全长和β-catenin基因保守片段的获得
  •     3.2.2 β-catenin的RACE扩增
  •   3.3 Rspo1和β-catenin基因核苷酸序列分析
  •   3.4 Rspo1和β-catenin基因蛋白质序列分析
  •     3.4.1 Rspo1和β-catenin基因编码蛋白质序列基本性质
  •     3.4.2 Rspo1和β-catenin基因序列相似性分析
  •     3.4.3 Rspo1 基因编码蛋白序列比对分析
  •     3.4.4 β-catenin基因编码蛋白序列比对分析
  •     3.4.5 Rspo1 基因序列系统进化树构建
  •     3.4.6 β-catenin基因序列系统进化树构建
  •   3.5 Rspo1和β-catenin基因及其他性腺发育相关基因在大鲵中的表达分析
  •     3.5.1 Rspo1 基因在雌雄大鲵各组织的差异表达
  •     3.5.2 β-catenin基因在雌雄大鲵各组织的差异表达
  •     3.5.3 Rspo1和β-catenin基因在大鲵不同发育阶段卵巢中的差异表达
  •     3.5.4 其他性腺发育基因在大鲵不同发育阶段卵巢中的差异表达
  • 4 讨论
  •   4.1 中国大鲵Rspo1 基因序列和结构特征分析
  •   4.2 中国大鲵β-catenin基因序列和结构特征分析
  •   4.3 中国大鲵Rspo1 系统进化分析
  •   4.4 中国大鲵β-catenin系统进化分析
  •   4.5 中国大鲵Rspo1 基因组织表达分析
  •   4.6 中国大鲵β-catenin基因组织表达分析
  •   4.7 Rspo1和β-catenin基因及其他性腺发育相关基因在中国大鲵不同发育阶段卵巢中的表达分析
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 张婉清

    导师: 王勤

    关键词: 中国大鲵,卵巢发育相关基因,基因,表达

    来源: 四川农业大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 四川农业大学

    分类号: Q953

    DOI: 10.27345/d.cnki.gsnyu.2019.000770

    总页数: 67

    文件大小: 3779k

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