论文摘要
【背景】植物乳杆菌（Lactobacillus plantarum）广泛存在于植物、乳制品、肉制品、哺乳动物和昆虫的肠道等多种生态环境中。【目的】探究不同分离源L. plantarum基因组与其所在环境是否存在潜在的联系。【方法】利用比较基因组学对126株分离自植物、乳制品、肉制品、果蝇及哺乳动物肠道和口腔等部位的L. plantarum菌株基因组进行系统发育分析和功能基因组分析,解析不同分离源菌株间的亲缘关系和进化历程。【结果】果蝇分离株的基因组大小显著高于植物、哺乳动物肠道、肉制品和乳制品分离株（P<0.05）,植物和哺乳动物肠道、口腔等部位与肉制品分离株的基因组大小和编码基因数量无显著差异（P>0.05）。基于单拷贝基因串联和核心基因系统发育树分析均发现,果蝇分离株和乳制品分离株分别集中聚集分布在某一分支中,其余分离源均匀分布在各个分支中。附属基因分析结果与系统发育树分析结果一致。功能基因注释结果发现,果蝇分离株的环境特异性基因参与低聚果糖和几丁质代谢,乳制品分离株的环境特异性基因参与mazEF毒素-抗毒素系统和CRISPR系统。【结论】植物乳杆菌分离株为适应较为独特的果蝇和乳制品生境而发生了适应性进化。本研究为植物乳杆菌适应性进化提供了新见解,同时为解析菌株的进化历程提供了理论基础。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 刘亚华,李伟程,余中节,赵飞燕,赵洁,孙志宏,张和平
关键词: 植物乳杆菌,分离源,群体基因组
来源: 微生物学通报 2019年12期
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学
单位: 内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室
基金: 国家自然科学基金(31430066),国家现代农业产业(奶牛)技术体系建设(CARS-36)~~
分类号: Q93
DOI: 10.13344/j.microbiol.china.190132
页码: 3388-3401
总页数: 14
文件大小: 1473K
下载量: 289
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