白蚁和共生细菌由来木质纤维素降解酶基因的异源表达

白蚁和共生细菌由来木质纤维素降解酶基因的异源表达

论文摘要

木质纤维素是地球上最丰富的可再生生物质。天然的木质纤维素材料含有纤维素、半纤维素和木质素等,纤维素在木质纤维素中为最简单的成分,半纤维素和木质素包裹在纤维素的外面,形成了一种天然屏障,这层天然屏障在保护植物的同时,使得人工进行生物降解转化的效率很低,无法适应大规模工业化的要求。自然界中存在一些降解木质纤维素材料的生物系统,白蚁也为一种,白蚁和共生细菌由来木质纤维素酶具有较高的酶活和良好的耐碱性。本文以白蚁和共生细菌为对象,探究了几种木质纤维素酶的协同作用,同时对实验室前期分离得到的厌氧菌Dysgonomonas macrotermitis开展了相关研究,该属为黄翅大白蚁(Macrotermes barneyi)肠道第二优势菌群,具有纤维素活性,为了得到酶学性质较好的木质纤维素酶,进而加快其在工业领域的应用,我们进行了如下研究:M barneyi后肠D.macrotermiD.木聚糖酶的异源表达。通过基因组测序、blast比对分析和分子生物学方法,找到5个木聚糖酶基因,并在E.coli JM109中克隆表达,发现只有DysxynB(orf-00078)和DysxynE(orf-03642)具有木聚糖酶活,蛋白分子量为40kDa和33kDa,分别属于GH10、GH11家族。通过酶学活性分析,酶比活分别为:259.5 U/mg和151.2 U/mg,最适温度和pH均为45℃和7.0,有较强的耐碱性,在pH5.0-9.0环境下处理仍能保持50%以上的酶活。通过TLC分析,发现DysxynB和DysxynE均不具有β-木糖苷酶的活性。M barneyi后肠D.macrotermitis β-1,4-内切葡聚糖酶的异源表达。通过基因组测序、blast 比对分析和分子生物学方法,找到6个β-1,4-内切葡聚糖酶。并在E.coll JM109中克隆表达,只有DysengE(orf-01678)具有EG酶活,其分子量为20 kDa,属于GH5家族。通过酶学活性分析,该EG酶的酶比活为0.58 U/mg,最适温度和pH分别为40℃和8.0,耐碱性强,在pH4.5-9.0之间仍能保持90%以上的活力。对其进行生物信息学分析,发现是目前为数不多的白蚁肠道共生菌来源的GH5家族EG酶。同时,本文采用多质粒(pETDuet-1和pRSFDuet-1)策略,在大肠杆菌中共表达白蚁及其肠道微生物来源的β-葡萄糖苷酶、内切β-1,4-葡聚糖酶、漆酶和木聚糖酶共4种木质纤维素酶,经过SDS-PAGE分析得到与理论值一致的蛋白条带,且均具有酶活性。以磷酸处理的微晶纤维素(PASC)为底物,测定了共表达酶粗酶液与单独表达酶混合液的协同作用因子,从还原糖的产量上经计算共表达的粗酶液比单独表达酶的混合液对PASC的降解协同作用提高44%;以滤纸和磷酸处理的玉米芯为底物,测定降解协同作用,分别提高34%和20%。结果表明,共表达酶的降解效率要高于混合的单组分酶液降解效率的总和。M Barneyi后肠类芽孢杆菌来源的木聚糖酶在毕赤酵母中的分泌表达。木聚糖酶有较广的工业应用范围,酵母细胞有较强的分泌能力和后加工能力,分泌表达能够降低生产成本。本文使用pPICZα-A质粒对木聚糖酶Xy1Mb1,进行了分泌表达。在GS115中表达的XylMb1,其蛋白分子量的大小比理论值(20kDa)偏大,为35kDa。总之,本文克隆表达了D.macrotermitis来源的木聚糖酶和EG酶,对其酶学性质分析研究;同时对白蚁和共生菌来源的木质纤维素酶进行了共表达,并测定了其对一些天然底物的降解协同作用。同时为了加快木质纤维素酶在工业领域的应用,在毕赤酵母系统中实现了木聚糖酶Xy1Mb1的分泌表达。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 缩略语表
  • 第一章 绪论
  •   1.1 白蚁
  •     1.1.1 白蚁及共生菌
  •     1.1.2 黄翅大白蚁
  •     1.1.3 Dysgonomonas
  •   1.2 木聚糖酶
  •     1.2.1 木聚糖酶概述
  •     1.2.2 木聚糖酶的应用
  •     1.2.3 白蚁肠道共生细菌木聚糖酶的研究进展
  •   1.3 β-1,4-内切葡聚糖酶
  •     1.3.1 β-1,4-内切葡聚糖酶概述
  •     1.3.2 白蚁肠道共生菌来源β-1,4-内切葡聚糖酶的研究进展
  •   1.4 木质纤维素酶的协同作用
  •     1.4.1 木质纤维素酶系组成
  •     1.4.2 木质纤维素酶共表达作用以及协同作用的研究
  •   1.5 本文的立题依据和研究内容
  •     1.5.1 立题依据
  •     1.5.2 研究内容
  • 第二章 D.macrotermitis木聚糖酶基因的克隆与表达
  •   2.1 引言
  •   2.2 实验材料、试剂及仪器
  •     2.2.1 实验材料
  •     2.2.2 实验试剂与仪器设备
  •   2.3 实验方法与步骤
  •     2.3.1 基因组分析
  •     2.3.2 进化树分析
  •     2.3.3 分子克隆与载体的构建
  •     2.3.4 平板验证酶活力
  •     2.3.5 诱导表达及纯化
  •     2.3.6 酶学性质测定方法
  •   2.4 实验结果
  •     2.4.1 生物信息学分析Dysxyns
  •     2.4.2 在大肠杆菌中表达Dysxyns
  •     2.4.3 酶学性质分析
  •   2.5 小结与讨论
  • 第三章 D.macrotermitis β-1,4-内切葡聚糖酶基因的克隆与表达
  •   3.1 引言
  •   3.2 实验材料、试剂及仪器
  •     3.2.1 实验材料
  •     3.2.2 实验试剂与仪器
  •   3.3 实验方法与步骤
  •     3.3.1 基因组分析
  •     3.3.2 进化树分析以及同源建模分析
  •     3.3.3 分子克隆与载体的构建
  •     3.3.4 平板验证酶活力
  •     3.3.5 诱导表达及纯化
  •     3.3.6 酶学性质测定方法
  •   3.4 实验结果
  •     3.4.1 生物信息学分析Dysengs
  •     3.4.2 在大肠杆菌JM109中表达Dysengs
  •     3.4.3 酶学性质分析
  •   3.5 小结与讨论
  • 第四章 白蚁及其共生菌来源四种木质纤维素酶基因的共表达
  •   4.1 引言
  •   4.2 实验材料、试剂与仪器
  •     4.2.1 菌株与质粒
  •     4.2.2 实验材料、仪器
  •   4.3 实验方法与步骤
  •     4.3.1 构建表达载体获得重组子
  •     4.3.2 Co-BGEG、Co-CotAXyl和Co-BECX在E.coli中的表达
  •     4.3.3 标准曲线的测定
  •     4.3.4 酶活力测定方法
  •     4.3.5 底物处理
  •     4.3.6 白蚁及肠道微生物来源木质纤维素酶的协同作用研究
  •   4.4 实验结果
  •     4.4.1 表达载体的构建
  •     4.4.2 Co-BGEG、Co-CotAXyl和Co-BECX在E.coli中的表达
  •     4.4.3 标准曲线的测定
  •     4.4.4 白蚁及其肠道微生物来源的木质纤维素酶的协同作用
  •   4.5 小结与讨论
  • 第五章 白蚁类芽孢杆菌由来XylMb1基因在毕赤酵母中表达
  •   5.1 引言
  •   5.2 实验材料、试剂及仪器
  •     5.2.1 实验材料
  •     5.2.2 实验试剂与仪器
  •   5.3 实验方法与步骤
  •     5.3.1 pPICZαA-Mb1xy1在P.pastoris GS115中的表达
  •     5.3.2 重组蛋白XylMb1的活性测定
  •     5.3.3 重组蛋白Xy1Mb1糖基化修饰分析
  •   5.4 实验结果
  •     5.4.1 pPICZαA-XylMb1在P.pastoris GS115中的表达
  •     5.4.2 pPICZαA-XylMb1在P.pastoris GS115的酶活验证
  •     5.4.3 重组蛋白XylMb1糖基化修饰分析
  •   5.5 小结与讨论
  • 第六章 总结与展望
  • 参考文献
  • 附录
  •   附录一 相关试剂
  •   附录二 所用仪器
  •   附录三 所用相关培养基
  •   附录四 所用相关溶液
  •   附录五 制备毕赤酵母感受态细胞
  • 致谢
  • 攻读硕士学位期间发表的学术论文
  • 附件
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 杜娇

    导师: 倪金凤

    关键词: 黄翅大白蚁,木质纤维素酶,共表达,协同作用

    来源: 山东大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 山东大学

    分类号: Q78

    总页数: 91

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