割手密蛋白磷酸酶基因SsPP2C1的克隆及表达分析

割手密蛋白磷酸酶基因SsPP2C1的克隆及表达分析

论文摘要

2C型丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶(PP2C)是植物体内脱落酸ABA信号传导关键负调控酶,在植物耐非生物胁迫中发挥着重要的作用。为探讨抗旱割手密材料中蛋白磷酸酶基因的序列及其表达特征,利用转录组测序数据,结合RT-PCR技术,克隆出编码割手密PP2C蛋白的基因,命名为SsPP2C1,其核苷酸序列编码区长855 bp,编码284个氨基酸残基,这些残基中包括了与二价金属离子结合的MED、DGH、DG和D结构域。系统发生分析结果表明,该氨基酸与谷子Sipp2c亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析结果表明在干旱协迫条件下,SsPP2C1基因主要在割手密的叶片中表达,在根和茎中的表达量相对较低;该基因在割手密伸长期表达量最高,成熟期次之,苗期最小;随着胁迫时间的延长,该基因的表达量显著升高,在胁迫6 d时达到最大值,为对照的4 940.27倍,随后显著下降,表明SsPP2c1基因与割手密抗旱性存在紧密关联。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 基因SsPP2C的克隆
  •   1.2 SsPP2C1基因编码的氨基酸序列分析和系统进化树构建
  •   1.3 干旱胁迫下割手密SsPP2C1基因的表达
  •     1.3.1 不同发育时期SsPP2C1基因受干旱诱导的表达情况
  •     1.3.2 不同干旱胁迫时间SsPP2C1基因的表达情况
  •     1.3.3 相同干旱胁迫时间下割手密不同组织的SsPP2C1基因表达情况
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •   3.2 提取RNA和合成cDNA第一链
  •   3.3 SsPP2C1基因克隆
  •   3.4 SsPP2C1基因的生物信息学分析
  •   3.5 胁迫处理
  •   3.6 实时荧光定量PCR分析
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王天菊,王先宏,杨清辉

    关键词: 割手密,蛋白磷酸酶,基因克隆,表达特征

    来源: 分子植物育种 2019年08期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 云南农业大学甘蔗研究所

    基金: 国家自然科学基金资助项目(31460372,31260348)资助

    分类号: S566.1;Q943.2

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.002502

    页码: 2502-2508

    总页数: 7

    文件大小: 2458K

    下载量: 67

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