论文摘要
为详细了解口蹄疫病毒（Foot-and-mouth disease virus,FMDV）非结构蛋白3B的基本结构与功能,试验采用生物信息学方法研究了非结构蛋白3B的一般理化性质、亲疏水性、跨膜区、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、二级结构、三级结构、潜在的抗原表位,并对该蛋白进行了多重序列比对。结果表明:在NCBI数据库中检索到39个中国上传的口蹄疫病毒非结构蛋白3B序列,其中从新疆地区获得的分离株1株（Akesu/58）,属于O型毒株,非结构蛋白3B具有71个氨基酸,分子式为C356H596N98O93S1,相对分子质量为7 769.31,等电点为10.11,带负电荷氨基酸残基总数为6个,带正电荷氨基酸残基总数为16个,不稳定指数为28.67;亲水性平均系数为-0.731,无跨膜区,无信号肽;无糖基化位点,该蛋白在氨基酸序列第26位和第50位各存在1个酪氨酸磷酸化位点;二级结构延伸链占所有氨基酸比例的23.94%,β-折叠占所有氨基酸比例的4.23%,无规则卷曲占所有氨基酸比例的71.83%;三级结构蛋白覆盖率只有28%,可信度为10%;非结构蛋白3B有3个抗原决定簇,具有6个优势的B细胞抗原表位,4个优势的CD8+抗原表位,1个强结合多肽段和14个弱结合多肽段的CD4+抗原表位;非结构蛋白3B与NCBI公布的中国O型、A型和Asia 1型血清型核苷酸序列同源性分别为94.24%、91.55%和97.48%,氨基酸序列同源性分别为97.29%、92.96%、98.49%。说明非结构蛋白3B基因编码的蛋白质为亲水性蛋白,结构较为松散,同源性高,且具有保守的抗原决定簇,可作为区分疫苗接种和自然感染抗体诊断方法的候选蛋白靶标。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 吴文星,吴鹏,易继海,徐明国,陈创夫,王震
关键词: 口蹄疫病毒,毒株,非结构蛋白,疫苗接种,自然感染,生物信息学
来源: 黑龙江畜牧兽医 2019年15期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学,畜牧与动物医学
单位: 石河子大学动物科技学院,新疆地方与民族高发病教育部重点实验室
基金: 新疆生产建设兵团重大科技项目(2014AA001-3)
分类号: S852.65
DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.07.0242
页码: 94-97+100+184-185
总页数: 7
文件大小: 389K
下载量: 167
相关论文文献
- [1].牛病毒性腹泻病毒非结构蛋白研究进展[J]. 动物医学进展 2019(07)
- [2].三种感染动物阳性血清与口蹄疫病毒重组非结构蛋白的反应原性[J]. 中国动物检疫 2017(07)
- [3].小反刍兽疫病毒P蛋白及非结构蛋白V表达特性研究[J]. 中国兽医杂志 2017(08)
- [4].登革病毒非结构蛋白1结构及功能研究进展[J]. 病毒学报 2014(06)
- [5].猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白2分段真核表达及其细胞定位分析[J]. 中国动物传染病学报 2019(05)
- [6].新城疫病毒非结构蛋白W的分子特征及生物信息学分析[J]. 中国兽医学报 2020(03)
- [7].猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白9研究进展[J]. 现代畜牧兽医 2020(08)
- [8].细小病毒非结构蛋白诱导细胞凋亡研究进展[J]. 病毒学报 2015(06)
- [9].猪嵴病毒非结构蛋白2C的生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医 2014(11)
- [10].乙型脑炎病毒非结构蛋白1单克隆抗体的制备[J]. 湖北农业科学 2014(23)
- [11].Ⅱ型登革病毒非结构蛋白1多克隆抗体制备和免疫特征分析[J]. 分子诊断与治疗杂志 2016(04)
- [12].鼻病毒非结构蛋白2B诱导细胞发生内质网应激[J]. 微生物与感染 2015(03)
- [13].天山牦牛口蹄疫病毒非结构蛋白3ABC检测[J]. 中国草食动物科学 2014(06)
- [14].猪传染性胃肠炎病毒非结构蛋白3a和3b融合表达及对细胞周期的影响[J]. 中国农业科学 2015(02)
- [15].猪繁殖与呼吸综合征病毒结构和非结构蛋白生物学功能研究进展[J]. 畜牧兽医学报 2012(11)
- [16].猪脑心肌炎病毒非结构蛋白3C的原核表达及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医 2017(06)
- [17].口蹄疫病毒非结构蛋白3AB的原核表达及应用(英文)[J]. 生物工程学报 2011(02)
- [18].检测猪脑心肌炎病毒重组非结构蛋白2C间接ELISA方法的建立[J]. 中国兽医学报 2011(04)
- [19].轮状病毒非结构蛋白1与种属限制性的相关性研究[J]. 第三军医大学学报 2009(03)
- [20].口蹄疫病毒非结构蛋白3D单克隆抗体的制备及鉴定[J]. 细胞与分子免疫学杂志 2009(07)
- [21].猪繁殖与呼吸综合征病毒非结构蛋白2研究进展[J]. 浙江农业学报 2018(02)
- [22].一起口蹄疫非结构蛋白抗体阳性的分析报告[J]. 新农业 2016(05)
- [23].猪脑心肌炎病毒非结构蛋白2C的原核表达及其反应原性[J]. 中国兽医科学 2008(09)
- [24].免疫猪群口蹄疫非结构蛋白抗体与免疫剂量的关系[J]. 中国动物检疫 2017(11)
- [25].口蹄疫病毒非结构蛋白3AB基因的可溶性表达与反应原性的鉴定[J]. 农业生物技术学报 2008(01)
- [26].检测猪血清口蹄疫病毒非结构蛋白3AB抗体ELISA方法的建立[J]. 甘肃农业大学学报 2008(01)
- [27].口蹄疫病毒非结构蛋白3AB单克隆抗体的制备及其对应表位区分析[J]. 中国预防兽医学报 2011(09)
- [28].猪脑心肌炎病毒非结构蛋白3AB基因在重组杆状病毒中的表达与鉴定[J]. 畜牧与兽医 2009(02)
- [29].呼吸道合胞病毒非结构蛋白1对凋亡调节机制的研究[J]. 生物医学工程与临床 2015(01)
- [30].四种口蹄疫病毒非结构蛋白抗体ELISA试剂盒检测猪血清样本的质量评估[J]. 中国动物检疫 2017(08)