母乳源植物乳杆菌的全基因组测序与潜在的益生能力探究

母乳源植物乳杆菌的全基因组测序与潜在的益生能力探究

论文摘要

母乳菌群是影响新生儿健康的重要影响因素之一,而健康的母乳是一个重要的益生菌筛选库。作为益生菌制剂的细菌,植物乳杆菌具有用途广泛、适应性强的特点。然而,不同菌株益生功能存在明显差异性,现有的生理生化方法对其潜在益生机制研究仍显不足,采用高通量的方法寻找具有种群特异性的益生菌将尤为有意义。因此,本研究旨在从母乳中筛选出植物乳杆菌作为益生菌候选株,并进行全基因组测序,即在基因组的结构上对菌株的表型进行探究,最终希望将菌株商业化后添加进婴幼儿配方食品中,以最佳的方式模拟母乳,提供给因一些特殊原因不能实现母乳喂养的婴幼儿,保证其健康。本实验选取10例健康母乳样本进行益生菌株的分离、培养与鉴定,共获得59株潜在益生菌(共9个种),通过Illumina Hiseq X ten测序仪对其中2株植物乳杆菌株进行全基因组测序并取得以下研究结果。1.对母乳来源的2株植物乳杆菌分别命名为,植物乳杆菌MP37、MP55;2.MP37、MP55具有利用多种碳源作为底物的特点;MP37最适初始pH为6.8、最适培养温度为37℃;MP55最适初始pH为6.5、最适培养温度为37℃;3.MP37、MP55经过人工胃、肠液消化后,其活菌数量均大于1×106CFU/mL;其对于Caco-2细胞系的黏附率分别为76%、0.56%;4.MP37、MP55均为非溶血性菌株;其益生能力包括产β-半乳糖苷酶、抑菌性、以及对抗高脂饮食引起的肝脏脂肪病变的能力。5.全基因组测序结果表明,MP55、MP37基因组大小分别为3299180 bp、3204421 bp;GC含量分别为44.46%、44.36%;分别存在3101、3012个基因编码序列;结合菌株生化特征在基因组上找到4个与肠液耐受相关的基因以及与细菌素合成相关基因簇;并且两菌株均不存在可移动的遗传性耐药元件。综上所述,母乳源植物乳杆菌MP37、MP55是两株潜在的益生菌候选株,本实验结果为进一步阐明其益生菌特性的功能机理提供了遗传学基础。

论文目录

  • 缩略词
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 绪论
  •   1.1 母乳微生物群
  •     1.1.1 母乳微生物群的起源
  •     1.1.2 母乳微生物组成与功能
  •     1.1.3 母乳来源的益生菌
  •   1.2 益生菌
  •     1.2.1 益生菌定义与发展史
  •     1.2.2 益生菌分类
  •     1.2.3 益生菌的功能与作用机制
  •   1.3 植物乳杆菌
  •     1.3.1 植物乳杆菌生理生化与基因组特征
  •     1.3.2 植物乳杆菌的益生作用研究进展
  •   1.4 高通量测序技术
  •   1.5 研究目的、意义及内容
  •     1.5.1 研究目的与意义
  •     1.5.2 研究内容
  • 第二章 母乳源植物乳杆菌的分离、鉴定与分型
  •   2.1 引言
  •   2.2 实验材料和仪器
  •     2.2.1 主要试剂、耗材
  •     2.2.2 主要仪器
  •   2.3 实验方法
  •     2.3.1 培养基及溶液准备
  •     2.3.2 样本采集及处理
  •     2.3.3 菌株分离、纯化与保种
  •     2.3.4 MALDI-TOFMS初步鉴定
  •     2.3.5 16S rRNA扩增与菌株鉴定
  •     2.3.6 rep-PCR分型
  •   2.4 实验结果与分析
  •     2.4.1 MALDI-TOF MS鉴定结果
  •     2.4.2 菌株测序鉴定分析
  •     2.4.3 rep-PCR分型结果
  •   2.5 小结
  • 第三章 植物乳杆菌的形态学观察与生长条件优化
  •   3.1 引言
  •   3.2 实验材料与仪器
  •     3.2.1 主要试剂、耗材
  •     3.2.2 主要仪器
  •   3.3 实验方法
  •     3.3.1 菌落形态与革兰氏染色观察
  •     3.3.2 扫描电镜
  •     3.3.3 生长曲线
  •     3.3.4 最适培养时间的确定
  •     3.3.5 最适初始pH的确定
  •     3.3.6 最适温度的确定
  •     3.3.7 糖发酵实验
  •   3.4 实验结果与分析
  •     3.4.1 菌落形态与革兰氏染色结果分析
  •     3.4.2 扫描电镜结果
  •     3.4.3 生长曲线监测结果
  •     3.4.4 最适培养时间
  •     3.4.5 最适初始pH
  •     3.4.6 最适温度的实验结果
  •     3.4.7 糖发酵结果
  •   3.5 小结
  • 第四章 模拟环境下测试植物乳杆菌的适应性
  •   4.1 引言
  •   4.2 实验材料和仪器
  •     4.2.1 主要试剂、耗材
  •     4.2.2 主要仪器
  •     4.2.3 培养基及溶液准备
  •   4.3 实验方法
  •     4.3.1 人工胃肠液耐受试验
  •     4.3.2 细胞黏附性实验
  •   4.4 结果与讨论
  •     4.4.1 人工肠胃液结果
  •     4.4.2 细胞黏附结果
  •   4.5 小结
  • 第五章 菌株益生能力的初步探究
  •   5.1 引言
  •   5.2 实验材料与仪器
  •     5.3.1 实验材料、仪器
  •     5.3.2 主要仪器
  •   5.3 实验方法
  •     5.3.1 融血实验
  •     5.3.2 β-半乳糖苷酶实验
  •     5.3.3 抑菌实验
  •     5.3.4 肝细胞脂质堆积实验
  •   5.4 结果与讨论
  •     5.4.1 溶血实验结果
  •     5.4.2 β-半乳糖苷酶实验结果
  •     5.4.3 抑菌实验结果
  •     5.4.4 肝细胞脂质堆积实验结果
  •   5.5 小结
  • 第六章 全基因组测序与功能基因预测分析
  •   6.1 引言
  •   6.2 实验材料与方法
  •     6.2.1 实验材料、仪器
  •     6.2.2 主要仪器
  •   6.3 实验方法
  •     6.3.1 菌株的DNA的提取
  •     6.3.2 测序文库的构建
  •     6.3.3 上机与组装
  •     6.3.4 基因组注释功能与预测
  •   6.4 实验结果与讨论
  •     6.4.1 测序与组装结果分析
  •     6.4.2 植物乳杆菌基因组的基本特点
  •     6.4.3 植物乳杆菌种属分类与遗传发育树的构建
  •     6.4.4 基因组注释功能与预测
  •     6.4.5 两株菌在抑菌基因簇比较结果
  •     6.4.6 胆汁耐受性相关基因
  •     6.4.7 耐药基因检测
  •   6.5 小结
  • 第七章 结论与展望
  •   7.1 结论
  •   7.2 创新点
  •   7.3 展望
  • 参考文献
  • 发表论文
  • 附录
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 张欢畅

    导师: 常学东,朱宝利

    关键词: 母乳,益生菌,植物乳杆菌,全基因组测序,半乳糖苷酶

    来源: 河北科技师范学院

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑

    专业: 生物学,生物学,轻工业手工业

    单位: 河北科技师范学院

    分类号: Q78;TS201.3

    总页数: 85

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