论文摘要
目的类风湿关节炎(Rheumatoid arthritis,RA)是骨科常见关节炎性疾病,本研究的主要目的筛查类风湿关节炎发生发展的核心基因,以期寻找类风湿关节炎潜在的生物分子标志物和治疗靶点。方法表达谱芯片GSE12021和GSE55457下载自GEO数据库,通过R软件affy包及LIMMA包进行数据的预处理和差异分析,得出类风湿关节炎和对照组之间的差异基因(DEGs),通过DAVID数据库对差异基因进行功能聚类分析和通路聚类分析,通过STRING数据库构建蛋白互作网络图,并筛查其核心基因网络。结果本研究中,共纳入25例类风湿关节炎患者和19例正常对照组,经标准化处理及差异筛选,共得出77个上调基因和88个下调基因。通过PPI蛋白互作网络,我们构建了RA发生发展的核心互作网络,其中CXCL9、CXCL10、CXCL11、CXCL13、CCL5及APP等基因构成的核心网络在RA的发病中起到核心作用。结论趋化因子CXCL家族CXCL9、CXCL10、CXCL11及CXCL13等基因在RA发生发展中起到重要作用,这些基因及其相关通路可能是RA潜在的生物分子标志物和药物靶点。
论文目录
文章来源
类型: 国内会议
作者: 李照彦,陈香润,杜珍武,张桂珍,宋旸
关键词: 类风湿关节炎,核心基因,趋化因子
来源: 第十六届中国体视学与图像分析学术会议——交叉、融合、创新 2019-10-17
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,内分泌腺及全身性疾病
单位: 吉林大学第二医院骨科
分类号: Q811.4;R593.22
DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.058043
页码: 347-354
总页数: 8
文件大小: 880k
下载量: 2
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