小拟南芥转运蛋白基因及NHX2基因的克隆与表达

论文摘要

转运蛋白（transport protein）是膜蛋白的一大类,介导生物膜内外的化学物质及信号的交换。植物体内存在多个与Na+转运相关的蛋白,其中液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白（Vacuolar Na+/H+antiporter,NHX）在离子稳态和提高植物耐盐性方面发挥着重要作用。为了深入了解转运蛋白基因在短命植物小拟南芥（Arabidopsis pumila）耐盐方面的作用,本研究首先基于小拟南芥响应高盐胁迫叶片转录组数据筛选出1157个转运蛋白基因,按功能分为Na+转运蛋白,K+转运蛋白,Ca2+转运蛋白,ABC转运蛋白以及糖转运蛋白等,其中功能注释为Na+转运蛋白的基因有24个。K均值（K-means）聚类分析结果显示,1157个转运蛋白基因分布于20个K subcluster,其中在K6、K9、K15子聚类中的基因数量分布较多,分别为172、193、190个。在分布于K6子聚类的Na+转运蛋白基因中,有一个编码NHX2蛋白的基因经盐胁迫处理后明显上调表达。采用RT-PCR克隆了Ap NHX2基因,Ap NHX2开放阅读框1626 bp,编码541个氨基酸。Ap NHX2蛋白是一个典型的跨膜转运蛋白,具有12个跨膜结构区。系统进化分析表明Ap NHX2与拟南芥At NHX2亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析显示,Ap NHX2基因在小拟南芥各组织中均有表达,但在花中表达量最高。为进一步研究该基因的功能,构建了过量表达载体35S∶Ap NHX2并转化农杆菌GV3101。本研究为进一步阐述转运蛋白基因在小拟南芥响应盐胁迫中的功能机制奠定了基础。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 孙琦,黄薇,刘芳,金玉环,肖建旺,黄先忠

关键词: 小拟南芥,逆向转运蛋白,基因克隆,组织表达

来源: 石河子大学学报(自然科学版) 2019年02期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 石河子大学生命科学学院特色植物基因组学实验室

基金: 国家自然科学基金项目(U1303302)

分类号: Q943.2

DOI: 10.13880/j.cnki.65-1174/n.2019.02.010

页码: 200-209

总页数: 10

文件大小: 4249K

下载量: 105

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标签：小拟南芥论文;  逆向转运蛋白论文;  基因克隆论文;  组织表达论文;