入侵植物小蓬草的细菌群落组成和多样性研究

入侵植物小蓬草的细菌群落组成和多样性研究

论文摘要

生物入侵现象严重危害生态系统的健康,其中外来植物入侵是生物入侵中的重要组成,会对农业、林业、畜牧业产生直接的经济危害。选取生长状况良好的菊科外来入侵植物小蓬草(Conyza canadensis L.,Asteraceae)植株,利用16S rRNA基因的高通量测序技术和后续分析,探索小蓬草生境中的土壤及其根和叶的细菌群落组成和多样性,并分析表面消毒、冷冻干燥保存和不同研磨方法等处理方式对研究结果的影响。结果表明:小蓬草根样本细菌群落中OTU的数目最多,其次是土壤,小蓬草叶样本的细菌群落中OTU的数目最低;小蓬草细菌群落Alpha多样性在土壤样本中最高,其次是小蓬草根,小蓬草叶的细菌群落Alpha多样性最低;在门的水平,在土壤和小蓬草叶、根的细菌群落均以变形菌门和放线菌门丰度最高,此外在小蓬草根和叶的细菌群落丰度较高的还有厚壁菌门,在土壤细菌群落丰度较高的则是拟杆菌门;小蓬草根和叶细菌群落的优势属包括假单胞菌属(Pseudomonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)、甲基杆菌属(Methylobacterium)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、根瘤菌属(Rhizobium)和无色杆菌属(Achromobacter)等,这些优势属可能包含植物益生菌,并对小蓬草适应不良环境提供一定的帮助;是否进行表面消毒处理的小蓬草叶和根样本的细菌群落组成和多样性有明显的差异,表明小蓬草的根表和根内以及叶表和叶内的细菌群落存在明显的差异;机器研磨、冷冻干燥保存处理的小蓬草样本与人工研磨并及时处理的小蓬草样本相比,其细菌群落组成并没有明显的差异,表明这些处理方式对植物微生物组的研究结果不会产生明显的影响。该研究结果可为微生物在植物入侵机制中所起的作用提供数据支持。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1. 1 样本采集
  •   1. 2 样本处理
  •   1.3 PCR扩增及高通量测序
  •   1. 4 序列数据处理
  •   1. 5 统计分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 样本细菌群落的Alpha多样性
  •   2. 2 样本细菌群落组成
  •   2.3 不同处理对小蓬草叶和根细菌群落研究结果的影响
  • 3 讨 论
  • 4 结 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 程丹丹,赵菁,田忠赛

    关键词: 小蓬草,外来入侵植物,植物微生物组,细菌群落组成,多样性,基因,高通量测序

    来源: 安全与环境工程 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 中国地质大学(武汉)环境学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31570537)

    分类号: Q948

    DOI: 10.13578/j.cnki.issn.1671-1556.2019.02.003

    页码: 16-24

    总页数: 9

    文件大小: 435K

    下载量: 214

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