幼儿拇指螺（Pollicaria gravida）的分类学研究

论文摘要

[目的]幼儿拇指螺（Pollicaria gravida）被认为是蛹螺科（Pupinidae）拇指螺属（Pollicaria）的一个物种,至今在国内未见对活体标本进行系统的形态学和分子生物学研究的报道。本课题对采集自云南省元江县的幼儿拇指螺标本进行壳形测量和活体标本解剖,并对其线粒体16S rRNA基因及细胞核18S rRNA和28S rRNA基因片段进行扩增和序列测定,建立幼儿拇指螺与相关类群的16S rDNA、18S rDNA和28S rDNA数据集,计算各类群间的遗传距离,基于最大似然法（ML）、最大简约法（MP）和贝叶斯法（BI）构建各数据集的分子系统发育树,从形态水平和分子水平为明确幼儿拇指螺的分类学地位提供更多依据。[方法]1.云南省元江县实地采集幼儿拇指螺活体标本。2.测量标本的壳高、壳宽、壳口高和壳口宽,运用Excel计算平均值和标准差。3.对幼儿拇指螺活体标本去壳、冲洗标本体表粘液后,在体式显微镜下对幼儿拇指螺进行解剖,观察其结构,并进行记录。绘制幼儿拇指螺的解剖图。4.使用DNA提取试剂盒提取幼儿拇指螺的全基因组DNA,并就16S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因的片段进行聚合酶链式反应（PCR）扩增和序列测定。5.在美国生物信息中心（NCBI）网站的GenBank中下载幼儿拇指螺所属的环口螺超科（Cyclophoridae）其他物种的 16S rDNA、18S rDNA 和 28S rDNA 序列。使用Clustal X进行序列比对。运用MEGA X,选择Kimura 2-parameter核苷酸替换模型,分别计算相关类群间16S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因的遗传距离,分析碱基突变饱和度。6.运用 MEGA X、PAUP 4.0a165 和 Mrbayes 3.2,以田螺科Bellamya bengalensis和Viviparus georgianus为外群,选择合适核苷酸替换模型,分别基于最大似然法（ML）、最大简约法（MP）和贝叶斯法（BI）构建16S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因的单基因片段和联合基因的系统发育树。[结果]1.两次前往云南省元江县采集幼儿拇指螺活体标本分别为37只和7只,共44只。2.所测量标本的壳高、壳宽、壳口高和壳口宽的平均值与现有研究的相关数据进行比较,结果基本一致。3.幼儿拇指螺的解剖结构与现有文献中关于拇指螺属相关物种的描述比对一致。4.通过PCR扩增和测序得到幼儿拇指螺16S rDNA、18S rDNA、28S rDNA片段长度分别为480bp、317bp、609bp,与环口螺超科和外群物种序列比对后获得422bp、366bp 和 773bp。5.幼儿拇指螺同其它类群16S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因的遗传距离表明幼儿拇指螺同拇指螺属有较近的亲缘关系。6.获得幼儿拇指螺同其它类群基于16S rRNA、18S rRNA和28S rRNA基因的单基因片段和联合基因的ML树、MP树和BI树。[结论]1.幼儿拇指螺的贝壳形态和解剖结构与现有文献中关于拇指螺属和幼儿拇指螺的记录基本一致。2.幼儿拇指螺与蛹螺科拇指螺属物种有较近的亲缘关系。

论文目录

文章来源

类型: 硕士论文

作者: 柴家炫

导师: 陈元晓,田明

关键词: 幼儿拇指螺,系统分类

来源: 昆明医科大学

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 昆明医科大学

基金: 国家自然科学基金(31160425,31101616)

分类号: Q959

DOI: 10.27202/d.cnki.gkmyc.2019.000422

总页数: 79

文件大小: 3824K

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