导读:本文包含了细菌区系论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:细菌,瘤胃,多样性,牦牛,多相,根瘤菌,滩羊。
细菌区系论文文献综述
聂召龙,刘书杰,崔占鸿,潘浩,柴沙驼[1]（2019）在《新疆巴州幼年与成年牦牛瘤胃细菌区系多样性分析》一文中研究指出为比较年龄对牦牛瘤胃细菌区系多样性的影响,以新疆巴州1岁幼年牦牛和4岁成年牦牛的瘤胃微生物总DNA为研究材料,利用16S rRNA基因序列分析技术对牦牛瘤胃细菌区系的操作归类单元(OTU)聚类、门和属水平上的物种丰度、Alpha多样性进行比较分析。结果表明,在门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度为66. 96%～70. 31%,拟杆菌门(Bacteroides)相对丰度为21. 87%～24. 11%,其他菌类所占比例极少。在属水平上,普雷沃菌属(Prevotella)在幼年牦牛瘤胃内相对丰度(4. 69%)高于成年牦牛(2. 68%);瘤胃球菌属(Ruminococcus)在幼年牦牛瘤胃内相对丰度(4. 69%)比在成年牦牛瘤胃内(1. 79%)高。幼年和成年牦牛的Chao1指数分别为783. 50和544. 00,Shannon指数分别为4. 68和4. 52。综上可知,在同一草地放牧饲养条件下,1岁和4岁巴州牦牛瘤胃细菌区系组成存在明显差异,幼年牦牛瘤胃消化吸收的功能正在转化建立的过程中,所以Chao1指数和Shannon指数高于成年牦牛,且瘤胃细菌物种丰度和多样性更高。本研究结果为该地区牦牛瘤胃微生物稳态及其营养调控研究提供了参考依据。(本文来源于《核农学报》期刊2019年11期）
杨鼎,祁云霞,王晓娟,伊风艳,吴江鸿[2]（2019）在《驼绒藜和苜蓿对苏尼特羊增重及瘤胃细菌区系的影响》一文中研究指出试验旨在通过二代测序技术分析饲喂驼绒藜和苜蓿对苏尼特羊增重以及瘤胃细菌区系的影响。分别以驼绒藜和苜蓿作为饲料主要成分,选择4对3月龄断奶雌性双胞胎苏尼特羊进行分组饲喂试验,试验结束后提取瘤胃内容物微生物的总DNA,PCR扩增细菌16S rDNA并通过二代测序技术获得序列信息,分析比较驼绒藜和苜蓿2种颗粒饲料对瘤胃细菌结构的影响。结果表明:2个组样品测序共鉴定出12个门、28个属的细菌;相对丰度最高且具有显着差异的细菌为拟杆菌门普雷沃菌属,饲喂苜蓿比驼绒藜增重效果显着并且可显着提高瘤胃拟杆菌门的相对丰度(P<0.05);多样性分析结果表明,饲喂驼绒藜会显着增加瘤胃中细菌多样性(P<0.05)。综上,饲喂苜蓿一类高蛋白饲草能够促进苏尼特羊增肥,但降低了羊瘤胃细菌多样性,瘤胃细菌优势细菌为拟杆菌门,优势菌种为普雷沃菌。而饲喂驼绒藜一类高纤维饲料对羊的增肥效果不明显,但提高了瘤胃细菌多样性和微生态环境,可能更有利于羊的健康。(本文来源于《中国畜牧杂志》期刊2019年06期）
牛彦波,吴皓琼,安琦,王笑庸[3]（2019）在《接种大豆根瘤菌对大豆根际土壤细菌区系的影响》一文中研究指出本研究采用illumina Miseq高通量测序技术,对接种大豆根瘤菌与不接种大豆根瘤菌的大豆根际土壤进行总细菌DNA的提取,对细菌16srRNA高可变区V4～V5进行序列分析,对土壤中的细菌群落进行比较性分析。以不施肥的大豆根际土壤为参照,在施入不同根瘤菌处理后,分析大豆根际土壤的细菌区系在门、纲、目、科、属、种的分类群方面是否有差异改变,从分子生物学的角度来揭示黑龙江黑土土壤环境中外源根瘤菌对土壤微生物环境的影响。结果显示:与不接种根瘤菌的秋季土壤为参照,接种适宜的根瘤菌制剂能够丰富大豆根际土壤细菌群落,而不适宜的根瘤菌制剂不能对根际土壤环境有大的影响。由此说明,外源接种大豆根瘤菌引起根际土壤细菌的改变可能需要外源根瘤菌与大豆根系形成共生固氮关系,否则其对土壤群落的影响有限。(本文来源于《黑龙江科学》期刊2019年06期）
付辑光[4]（2018）在《饲粮铜水平对泌乳牛生产性能、血液生化指标、瘤胃细菌区系与铜代谢相关基因影响的研究》一文中研究指出本试验旨在研究饲粮铜水平对中国荷斯坦泌乳牛生产性能、养分表观消化率、血液生化指标、瘤胃细菌区系与肝脏铜代谢相关蛋白及酶类基因表达的影响。选取60头产奶量、泌乳天数与胎次相近的荷斯坦奶牛,按随机分配原则分为4组,以饲料级五水硫酸铜为铜源,分别在基础饲粮基础上添加0、10、15与20 mg/kg铜,试验Ⅰ组(铜水平8.09 mg/kg DM)、试验Ⅱ组(铜水平18.09 mg/kg DM)、试验Ⅲ组(铜水平23.09 mg/kg DM)与试验Ⅳ组(铜水平28.09 mg/kg DM),每组15头,试验期共90天。结果表明:1)与试验Ⅰ组相比,试验Ⅱ组、Ⅲ组与Ⅳ组的产奶量分别提高了4.91%、6.27%与4.78%(P<0.05),试验Ⅱ、Ⅲ与Ⅳ组的牛奶体细胞数极显着降低(P<0.01)。2)与试验Ⅰ组相比,试验Ⅱ组与Ⅲ组的中性洗涤纤维(NDF)消化率分别提高了6.21%与7.60%(P<0.05),酸性洗涤纤维(ADF)分别提高了6.78%与8.22%(P<0.05)。3)血液生化指标分析显示,随着铜采食量的增加,血清铜、铜蓝蛋白、超氧化物歧化酶(SOD)、铜-锌超氧化物歧化酶(Cu-ZnSOD)与谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)含量显着提高;与试验Ⅰ组相比,试验Ⅱ组、Ⅲ组与Ⅳ组的丙二醛(MDA)含量分别降低50.0%、60.23%与47.08%(P<0.01);与试验Ⅰ组相比,试验Ⅱ组、Ⅲ组与Ⅳ组的IgG含量分别提高了49.56%、165.56%与90.22%(P<0.01)。4)铜代谢指标分析说明,饲粮中补充铜能显着提高粪铜、尿铜与沉积铜含量,但铜的采食量对铜的消化率与沉积率没有影响。5)与试验Ⅰ组相比,试验Ⅱ组、Ⅲ组与Ⅳ组瘤胃液乙酸浓度分别提高了4.46%(P<0.05)、6.86%(P<0.01)与6.48%(P<0.01),瘤胃液丙酸浓度分别降低5.19%(P<0.05)、9.88%(P<0.01)与11.97%(P<0.01),乙酸与丙酸的比值分别提高了10.0%(P<0.05)、18.70%(P<0.01)与20.87%(P<0.01)。6)随着铜采食量的增加,瘤胃细菌区系的Alpha多样性分析指数明显增加,试验Ⅱ组、Ⅲ组与Ⅳ组的细菌物种丰度显着高于试验Ⅰ组。7)从门水平对瘤胃细菌区系物种组成进行相对丰度分析,拟杆菌门、变形菌门与厚壁菌门为优势菌门,与试验Ⅰ组相比,试验Ⅱ组、Ⅲ组与Ⅳ组变形菌门的相对丰度分别降低了26.03%(P<0.01)、18.52%(P<0.05)与23.23%(P<0.01)。从属水平对瘤胃细菌区系物种的组成进行相对丰度分析,琥珀酸弧菌UCG-001与普雷沃氏菌1为优势菌属,试验Ⅱ组普雷沃氏菌1的相对丰度极显着高于其他各组,理研球菌株RC9的相对丰度显着高于其他各组;试验Ⅱ组与Ⅲ组的密螺旋体菌2的相对丰度显着高于试验Ⅰ组与Ⅳ组(P<0.05)。8)随着铜采食量的增加奶牛肝脏铜转运基因铜离子转出蛋白B(ATP7B)与铜蓝蛋白mRNA的相对表达量极显着提高(P<0.01);试验Ⅱ组铜代谢MURR1域蛋白质1(COMMD1)mRNA相对表达量比试验Ⅰ组提高了9.0%(P>0.05),试验Ⅲ组与Ⅳ组分别比试验Ⅰ组降低54.0%与78.0%(P<0.01)。9)含铜酶相关基因相对表达量分析显示,随着铜采食量的增加,超氧化物歧化酶1(SOD1)、赖氨酰氧化酶(LOX)、单胺氧化酶A(MAOA)mRNA相对表达量显着提高;与试验Ⅰ组相比,试验Ⅱ组、Ⅲ组与Ⅳ组单胺氧化酶B(MAOB)mRNA的相对表达量分别降低24.0%、34.0%与60.0%(P<0.01)。综合本试验结果,饲粮中补充铜可提高奶牛的生产性能,促进机体对养分的利用,提高机体免疫力与抗氧化能力;饲粮中添加铜可提高泌乳牛乙酸的含量,降低丙酸的含量,提高乙酸与丙酸的比值,瘤胃菌群的相对丰度也显着提高;饲粮中添加铜能够促进机体内铜的代谢与含铜蛋白的合成。铜排泄量随着铜采食量水平的增加而增加。在本试验条件下,泌乳牛饲粮适宜铜水平为18.09~23.09 mg/kg DM(铜的采食量为403.59~514.21 mg/d)。(本文来源于《河北农业大学》期刊2018-05-31）
颜霞,张亚男,刘聪,赵玲云,郭红梅[5]（2017）在《生防菌Hhs.015对苹果枝条皮层内生细菌区系的影响》一文中研究指出【目的】用生防菌Hhs.015发酵液处理苹果发病枝条,研究其对树体微生态的影响。【方法】采用改良CTAB法提取样本中的总DNA,对细菌群落的16S r DNA的V4+V5区进行高通量测序,研究发病枝条涂抹Hhs.015菌悬液30 d后树皮内细菌区系组成变化,分析其相对丰度以及多样性指标。【结果】在属水平上,生防菌处理样本与对照样本中的细菌种类显现出明显差异,生防菌处理组Gluconobacter丰度明显升高,放线菌门菌株丰度高于对照组,Burkholderia和Luteibacter等可能与致病相关的菌属丰度大幅下降。刮去外皮后取样,糖丝菌属(Saccharothrix)丰度仍处于较高水平。【结论】Hhs.015能够在苹果树皮内定殖,并影响苹果枝条皮层细菌区系。(本文来源于《果树学报》期刊2017年09期）
石明菁[6]（2017）在《威海海参养殖池沉积物富集培养过程中细菌区系演替分析及新菌鉴定》一文中研究指出近海海洋沉积物中海洋细菌资源丰富,存在很多潜在功能细菌和潜在新物种,具有重要的研究价值。本文以威海荣成海参养殖池沉积物样品为实验对象,结合纯培养和免培养测序技术,探究了样品中细菌的群落组成以及在富集前后细菌区系的变化,并发现了 56株潜在新物种。同时,完成了五株海洋新菌的多相分类分析,丰富了海洋细菌的资源。本次富集培养分为两种处理,一种为传统的富集培养方法,命名为A处理,一种是在传统富集培养体系中添加具有捕食能力的沉积物慢生单胞菌,命名为F处理。两种处理中纯培养和免培养测序结果均证明,与富集前相比,富集后细菌的数量显着增加,多样性有所提高。在富集培养过程中,可培养细菌多样性表现为先增加后减少,在第21天多样性最高。本方法尤其适用于拟杆菌门,厚壁菌门和梭杆菌门细菌类群的富集分离,Parcubacter/a和热袍菌门在富集培养后出现,但对于蓝藻门的分离不适用。同时,与A处理相比,F处理在对应时间点的细菌数量和多样性减少,群落结构差异明显。据此,可以指导实验方法的进一步改进,同时对拟杆菌门等特定细菌类群的分离提供借鉴意义。另外,通过本次实验结果可知,在威海荣成海参养殖池沉积物样品中,含有丰富的海洋细菌资源,有待于进一步开发。从威海近海沉积物中分离到叁株海洋新菌,菌株编号分别是FA042T,HF004T,D2T,经多相分类分析,确定FA042T为李玄淳属的新种,命名为红色李玄淳菌(Hyunsoonleelarubra。HF004T为海球菌属的新种,命名为海泥海球菌(Halioglobus lutris)。D2T为卵链菌属的新种,命名为沉积物卵链菌(Catenovulum sediminis)。FA042T菌落呈红色,绝对好氧菌,杆状,没有鞭毛,不能滑动。生长的最适条件是:温度33℃,pH7.0-7.5,盐度为2-3%。基于16SrDNA分析结果,FA042T与济州岛李玄淳菌(Hyunsoonleella jejuensis)最相近,相似度为95%。主要脂肪酸成分为 iso-C15:0,iso-C15:1G,C15:0,iso-C17:03-OH 和 iso-C15:03-OH。主要呼吸醌型为MK-6。主要极性脂为叁种未知脂质,两种未知的氨脂和磷脂酰乙醇胺。DNAG+V含量为38.5mol%。建议FA042T(=KCTC42398T=MCCC 1H00110T)代表拟杆菌门李玄淳属的新种,命名为红色李玄淳菌(Hyunsoonleella rubra)。菌株HF004T是绝对好氧菌,杆状(长1.3-1.8μm,宽0.4-0.6lnm),不能滑动,革兰氏阴性菌。生长的最适条件是:温度28℃,pH7.5-8.0,盐度为2-3%。通过分析16SrDNA,HF004T与海球菌属最相近,相似度为95.6%-96.1%。主要呼吸醌型为 Q-8。主要脂肪酸成分为 summed feature 3(i.e.C16:1 ω7c and/or iso-C15:02-OH),C17:1cω8c和C18:1ω7c。主要极性脂为双磷脂酰甘油,磷脂酰甘油和磷脂酰乙醇胺。DNA G+C含量约56.9mol%。建议HF004T(=KCTC 42395T=MCCC 1H00127T)代表变形菌门海仙菌科海球菌属的新种,命名为海泥海球菌 CHalioglobus lutimaris)。菌株D2T为绝对好氧菌,杆状,噬琼脂,侧生鞭毛,革兰氏阴性菌。生长最适条件是:温度37℃,pH7.5-8.0,盐度为2-3%。通过分析16SrDNA,D2T与卵链菌属最相近,相似度为93.9%-96.3%。主要呼吸醌型为Q-8。主要脂肪酸成分为 summedfeature3(i.e.C16:1 ω7cand/oriso-C15:02-OH),C16:0,C10:03-OH,C18:1ω7c和C12:0。主要极性脂为磷脂酰乙醇胺,磷脂酰甘油和两种氨磷脂。DNA G+C 含量约 40.4 mol%。建议 D2T(=KCTC 42869T=MCCC 1H00129T)代表变形菌门交替单胞菌科卵链菌属的新种,命名为沉积物卵链菌(Catenovulum sediminis)。从海南省陵水县黎安港采集的红藻表面分离到两株海洋细菌,分别编号为0182T,DC003T。经多相分类鉴定,确定0182T为藏红花黄色线菌属的一个新种,命名为藻居藏红花黄色线菌(Crocinitomix algico/a)。DC003T为赖兴巴赫氏菌属的一个新种,命名为变色赖兴巴赫氏菌(Reichenbachiellaversicolor)。菌株0182T为绝对好氧菌,没有鞭毛,菌落颜色为黄色,革兰氏阴性菌,杆状(长0.9-2.5μm,宽0.2-0.4μm)。生长最适条件是:温度30℃,pH7.0-7.5,盐度为2-3%。通过分析16SrDNA,0182T与产触媒藏红花黄色线菌最相近,相似度为94.6%。主要呼吸醌型为MK-7。主要脂肪酸成分为iso-C15:0,C15:0 iso-C17:03-OH和iso-C15:1G。主要极性脂为氨磷脂,两种未知的氨脂和四种未知的磷脂。DNA G+C 含量为 35.4 mol%。建议 0182T(=KCTC 42868T=MCCC 1H00128T)代表拟杆菌门藏红花黄色线菌科藏红花黄色线菌属的新种,命名为藻居藏红花黄色线菌(Crocinitomixalgicola)。菌株DC003T为绝对好氧菌,没有鞭毛,噬琼脂,革兰氏阴性。生长最适条件是:温度28℃,pH7.0-7.5,盐度为2-3%。通过分析16SrDNA,DC003T与赖兴巴赫氏菌属最相近,相似度为93.1%-94.7%。主要呼吸醌型为MK-7。主要脂肪酸为 iso-C15:0,summed feature 3(i.e.C16:1 ω7c and/or iso-C15:02-OH),C16:1ω5c和 summed feature 5(i.e.C18:2 ω6,9c and/or Cl8:0 ANTE)。主要极性脂为叁种未知脂质,两种氨磷脂,一种未知成分的磷脂和磷脂酰乙醇胺。DNAG+C含量约37.0mol%。建议DC003T(=KCTC42867T=MCCC1H00130T)代表拟杆菌门赖兴巴赫氏菌属的一个新种,命名为变色赖兴巴赫氏菌(Reichenbachiella versicolor)。(本文来源于《山东大学》期刊2017-05-20）
薛云[7]（2017）在《孕酮和雌二醇对猪粪细菌区系的影响》一文中研究指出为了探讨雌性类固醇激素孕酮(Progesterone,P4)和雌二醇(Estradiol,E2)与肠道菌群的互作机制,本论文比较分析了梅山母猪妊娠30 d和妊娠90 d粪便中的类固醇激素(P4、E2)、细菌区系及代谢物的变化,同时通过体外厌氧培养的方法,进一步分析P4和E2对粪便菌群的影响。1梅山母猪妊娠期类固醇激素、细菌区系和代谢物的变化梅山母猪妊娠30 d粪样中P4和E2的浓度均极显着低于妊娠90 d(P<0.01)。Illumina PE250测序目水平上分析结果表明,妊娠30 d粪样中的Burkholderiale和Selenomonadales相对丰度显着低于妊娠90 d(P<0.05)。属水平上分析结果表明妊娠30 d的Lachnospiraceae UCG-007、Pseudomonas的相对丰度显着高于妊娠90(P<0.05),而 Anaerotruncus、Candidatus Soleaferrea、Phascolarctobacterium、Prevotellaceae UCG-004、Intestinibacter、[Eubacterium]coprostanoligenes group相对丰度显着低于妊娠90 d(P<0.05)。但妊娠30 d和90 d的细菌区系丰度指数(Ace和Chao)、多样性指数(Shannon和Simpson)均无显着性差异。粪代谢组学分析结果显示,妊娠30 d到妊娠90 d母猪粪便中有11种代谢物的含量有显着差异(P<0.01),主要涉及氨基酸代谢途径(1个)、脂类代谢途径(6个)、碳水化合物代谢途径(3个)及维生素代谢途径(1个)。说明,随着粪便中P4和E2浓度的升高,粪便细菌区系结构也发生变化。2孕酮与猪粪细菌区系的互作关系研究为了分析P4与肠道细菌区系的互作机制,本试验用不同浓度梯度(0.2、2、4、8 μg/mL)P4进行猪粪菌群体外37℃厌氧培养,同时设空白对照组(ControlⅠ)和与各处理组等量的二甲亚砜(Dimethyl Sulfoxide,DMSO)对照组(对照组Ⅱ,Control Ⅱ),培养8 h后,对照组Ⅰ和对照组Ⅱ培养液短链脂肪酸(short chain fatty acids,SCFAs)含量及总菌数量无显着差异,说明每87 mL培养体系中含有的27.84 μL DMSO对粪便微生物区系没有产生影响。0.2～8μg/mL P4处理组OD630均显着高于Control Ⅱ组(P<0.05),其中2 μg/mL P4组显着高于其它各组(P<0.05)。q-PCR结果显示,0.2～8μg/mLP4处理组总菌数均极显着高于Control Ⅱ组(P<0.01),其中2 μg/mLP4组极显着高于其它各组(P<0.01)。说明,P4有促进细菌增殖的作用。2 μg/mLP4组乙酸、异丁酸、异戊酸、戊酸及总酸的含量显着高于Control Ⅱ组(P<0.01),但其中丙酸、丁酸含量显着低于Control Ⅱ组(P<0.05)。说明,2μg/mL P4影响细菌区系的代谢类型。Illumina Miseq PE250高通量测序结果表明,2 μg/mL P4处理组OTUs、Ace、Chao与Control ⅡI组相比无显着差异。2 μg/mLP4处理组的Shannon值极显着高于Control Ⅱ组,而Simpson值极显着低于Control Ⅱ组(P<0.01)。门水平上分析结果表明,2 μg/mL P4处理组Firmicutes相对丰度极显着低于Control Ⅱ组(P<0.01),Proteobacteria相对丰度极显着高于Control Ⅱ组(P<0.01)。属水平上分析结果表明,2 μg/mL P4 组 Enterobacter、Escherichia-Shigella 极显着高于Control Ⅱ组(P<0.01)。而 Achrmobacter、Pseurococcus、Pseudomonas、Ruminococcaceae UCG-005 和 Streptococcus 显着低于 Control Ⅱ 组(P<0.05)。说明2 μg/mL P4处理影响了粪便细菌区系的结构。P4在培养液中消减率由高到低依次为2、4、8、0.2 μg/mLP4组,其中2 μg/mL P4组显着高于其它各组(P<0.05)。4 μg/mL P4组极显着高于0.2、8 μg/mL P4组(P<0.01)。0.2 μg/mL P4组与8 μ/mL P4组相比差异不显着。说明细菌对P4的利用和分解呈剂量依赖型。3雌二醇与猪粪细菌区系的互作关系研究为了分析E2与肠道细菌区系的互作机制,本试验用不同浓度梯度的E2(20、40、60、120 ng/mL)进行猪粪菌群体外37 ℃厌氧培养,同时设空白对照组(对照组Ⅰ,Control Ⅰ)和与各处理组等量DMSO的对照组(对照组Ⅱ,Control Ⅱ)分别进行体外37℃厌氧培养猪粪菌群,经8 h培养后,对照组Ⅰ和对照组Ⅱ培养液SCFAs含量及总菌含量无显着差异,说明每87 mL的培养体系中含有的0.42μL DMSO对粪便微生物区系没有产生影响。40、60、120 ng/mL E2 组 OD630 均显着低于 Control @ 组(P≤0.05),其中 120 ng/mL E2组OD630极显着低于其他各组(P<0.01)。q-PCR结果显示,60、120 ng/mL E2组总菌数均极显着低于Control Ⅱ组(P<0.01),其中120ng/mLE2组极显着低于其它各组(P<0.01)。说明,E2可抑制粪便中细菌的增殖,且抑制作用随着E2剂量的增加而增加。120 ng/mLE2组乙酸、丁酸、异丁酸及总酸的含量极显着低于Control Ⅱ组(P<0.01);异戊酸含量极显着高于Control Ⅱ组(P<0.01);但两组间丙酸及戊酸含量差异不显着。说明,120ng/mLE2影响细菌区系的代谢类型。E2在培养液中消减率由高到低依次为120、20、60 ng/mL E2组,其中120 ng/mL E2组极显着高于其它各组(P<0.01);20 ng/mL E2组与60 ng/mL E2组之间差异不显着。说明细菌对E2的利用和分解存剂量性差异。Illumina Miseq PE250高通量测序结果表明,120 ng/mL E2处理组OTUs显着低于 Control Ⅱ组(P<0.05),但两组间 Ace、Chao、Shannon 和 Simpson 差异不显着。门水平上的分析结果表明,120 ng/mL E2组Bacteroidetes相对丰度极显着低于Control Ⅱ组(P<0.01);Proteobacteria相对丰度极显着高于Control Ⅱ组(P<0.01)。属水平上的分析结果表明,120 ng/mL E2组Enterococcus、Macellibacteroides、Enterobacteriaceae_Unclassified 和 Kluyvera 显着高于 ControlⅡ 组(P<0.05),而Bacteroide 极显着低于 Control Ⅱ 组(P<0.01)。提示,120 ng/mL E2处理影响了粪便细菌区系的结构。总结:(1)母猪妊娠期后期粪便中的P4、E2含量显着高于妊娠前期,且细菌区系的结构和代谢产物存在明显差异;(2)雌性类固醇激素影响粪便细菌区系的结构和多样性,且这种作用因激素种类和剂量而异。创新点:本研究通过结合体内和体外培养的方法,首次揭示雌性类固醇激素(P4、E2)可影响粪便细菌区系的结构和多样性,且这种影响因激素的种类和剂量而异。(本文来源于《南京农业大学》期刊2017-05-01）
孙炜宁[8]（2017）在《基于高通量测序的泸酒酒醅和酸菜中细菌区系的研究》一文中研究指出我国拥有很多风味独特的传统发酵食品,发酵体系中的微生物对于发酵食品的生产和风味形成十分关键。目前对于我国一些发酵食品中微生物多样性的认识还十分有限。本文选取泸型白酒酒醅和东北手工自制酸菜作为研究对象,运用传统纯培养和高通量测序技术对其发酵过程中细菌群落的演替情况进行研究,以期阐明这些发酵食品中微生物的多样性。泸酒典范五粮液是由固态混合发酵技术酿造而成的,酒醅是微生物代谢产生白酒风味物质的重要固态介质。本研究以五粮液酒醅为样品,通过纯培养技术从中共分离得到了60株细菌,分属于4个属,6个种。酒醅中芽孢杆菌和乳酸菌的含量比较丰富,同时也检测出了醋酸杆菌的存在。运用Illumina高通量测序技术在冬夏酒醅中共检测出10个门、19个属的细菌,其中醋酸杆菌和乳酸杆菌为酒醅中的优势菌种。在发酵初期,细菌多样性水平较高,高温放线菌属等5个属首次在酒醅中检测出来。随着发酵的进一步进行,细菌群落的多样性水平不断降低,以醋酸菌为优势菌种的细菌群落逐步演替成为以乳酸菌为核心的细菌群落,在这一点上冬季和夏季酒醅的演替规律相似。但不同的是与夏季酒醅相比,冬季酒醅中醋酸菌的丰度更高而乳酸菌丰度更低。通过Beta多样性分析得出冬夏酒醅不同季节样品细菌群落的差异大于不同发酵阶段细菌群落组成的差异。东北酸菜是以白菜为原料经乳酸发酵的蔬菜制品,目前仍多以手工自制的方法进行加工。本论文以东北手工自制的酸菜为样品,运用Illumina高通量测序技术在酸菜发酵液中共鉴定出4个门,38个属的细菌;其中丰度大于1%的优势菌属有13个。酸菜发酵过程中细菌的丰度和多样性保持较高水平且不断变化。乳酸杆菌是厚壁菌门中的优势菌种,在酸菜成熟的过程中其丰度不断升高,乳酸菌的其他菌属多存在于酸菜发酵的前期。肠杆菌科和假单胞菌科也是酸菜中丰度较高的菌种,其中肠杆菌在发酵0天丰度最大,随后丰度不断降低在发酵初期结束后消失,假单胞菌属在酸菜发酵后期呈上升的趋势。本论文关于泸型白酒和东北酸菜微生物菌群的研究揭示了我国复杂的发酵食品体系中微生物的多样性,研究结果有助于这些发酵食品的品质提高和安全性控制,为传统发酵食品的生产提供参考依据。(本文来源于《天津大学》期刊2017-05-01）
王尧悦[9]（2017）在《日粮营养水平对滩羊瘤胃细菌区系及pH和VFA的影响》一文中研究指出宁夏滩羊以其优质的二毛裘皮以及鲜嫩的肉品质而闻名,近些年来,由于生态环境的压力,养殖方式由放牧转变为舍饲,饲料类型也随之变化。目前,有关滩羊瘤胃微生物发酵的研究较少,特别是日粮营养水平(能量和蛋白质水平)对滩羊瘤胃细菌区系的研究更少。因此,本试验的目的是研究不同日龄和不同营养水平的日粮对滩羊瘤胃细菌多样性、pH和VFA所占比例的影响。在本试验中共挑选平均体重为(29±1.25)kg健康的宁夏滩羊112只(其中公羊、母羊各一半,105日龄)。完全随机的分到4个不同日粮营养水平的处理组(组I,II,III和IV),每个处理组中包含4个重复,每个重复中有7只羊(每个处理组总共有28只羊)。从处理组I到IV,日粮能量分别为7.08 MJ·kg-1、8.09 MJ·kg-1、9.10 MJ·kg-1和10.11 MJ·kg-1;蛋白质水平分别为8.04%、9.19%、10.34%和11.49%。饲料中能量、蛋白质的比值相同(约为0.88)。试验期共75 d,其中预试期15 d。分别在每个试验期结束当天(即150日龄和180日龄),从每个处理组的每个重复中随机选取1只羊屠宰(即每个处理组共选取4只羊),采集瘤胃内容物并测定其pH和VFA的含量;提取瘤胃液基因组DNA,一部分基因组DNA样品通过绝对实时荧光定量PCR对相关微生物的含量进行测定,另一部分通过第二代测序技术对滩羊瘤胃细菌群落结构进行测定并进行相关功能的预测。试验结果表明:1、在150和180日龄时,仅S.ruminantium的数量有显着差异(P<0.05);P.ruminicola、R.flavefaciens和S.dextrinisolvens的数量随着日粮营养水平的提高均显着增加(P<0.05)。另外,通过相关分析发现,不同瘤胃细菌间(种分类水平)存在相互促进作用。2、滩羊瘤胃液pH不受日龄和日粮营养水平的影响(P>0.05);但不同日粮营养水平对VFA所占比例有显着影响。其中,乙酸的含量随着日粮营养水平的增加呈显着降低趋势(P<0.05),而丁酸、异丁酸、戊酸、异戊酸所占TVFA的比例呈明显上升趋势(P<0.05)。丙酸所占比例与V.parvula的数量呈显着正相关关系(r=0.42,P<0.05),而戊酸与V.parvula的数量呈极显着负相关关系(r=-0.53,P<0.01)。3、本试验共获得了滩羊瘤胃细菌的16个门分类和133个属分类。其中,Firmicutes门、Bacteroidetes门和Proteobacteria门的数量最多,且随着日粮营养水平的提高,Bacteroidetes门和Proteobacteria门的数量均呈线性增加的趋势(P<0.05),而Firmicutes门的数量呈线性降低的趋势(P<0.05)。Butyrivibrio属、Saccharofermentans属和Pseudobutyrivibrio属的含量随着日粮营养水平的提高均呈线性降低趋势(P<0.05),而Prevotella属、Prevotellaceae_uncultured属和Succinivibrio属的含量均呈线性增加的趋势(P<0.05)。通过功能预测发现,参与碳水化合物代谢的基因家族所占比例较大,且随着日粮营养水平的提高,与氨基酸代谢相关的基因家族所占的比例呈线性增长趋势(P<0.05)。综上所述,与日龄相比,不同营养水平的日粮显着影响瘤胃微生物数量及VFA含量。瘤胃中细菌(门、属、种分类水平)的数量均随日粮营养水平的提高而改变。另外,本试验还预测了瘤胃细菌相关基因家族的潜在功能。本试验实现对滩羊瘤胃细菌组成的首次研究并为提高滩羊日粮中能量和蛋白质的利用效率提供依据。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2017-05-01）
赵敏,徐宸,贾凌,程廷才,汪长国[10]（2016）在《烟草叶际细菌区系检测探针的设计及优化》一文中研究指出为了快速准确地检测烟草叶面的细菌种群,本研究利用基因芯片技术,采集我国主要烟区主栽品种旺长期叶际微生物进行宏基因组测序,结合生物信息学分析方法,筛选用以检测其中细菌种属特异性的探针。宏基因组数据分析表明,烟草叶面的宏基因组整体质量值较高,Q20、Q30分别占总碱基数99.2%、81.4%,测序长度为100bp,碱基分布均匀,所获得测序数据可用于后续探针设计。Blast比对结果表明共筛选出候选探针200条,属于9种细菌属,其中属于假单胞菌属的探针有165条。该结果为基因芯片技术应用于烟草叶面的细菌种群的检测提供了坚实的基础。(本文来源于《中国烟草学会2016年度优秀论文汇编——烟草农业主题》期刊2016-12-01）
细菌区系论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
试验旨在通过二代测序技术分析饲喂驼绒藜和苜蓿对苏尼特羊增重以及瘤胃细菌区系的影响。分别以驼绒藜和苜蓿作为饲料主要成分,选择4对3月龄断奶雌性双胞胎苏尼特羊进行分组饲喂试验,试验结束后提取瘤胃内容物微生物的总DNA,PCR扩增细菌16S rDNA并通过二代测序技术获得序列信息,分析比较驼绒藜和苜蓿2种颗粒饲料对瘤胃细菌结构的影响。结果表明:2个组样品测序共鉴定出12个门、28个属的细菌;相对丰度最高且具有显着差异的细菌为拟杆菌门普雷沃菌属,饲喂苜蓿比驼绒藜增重效果显着并且可显着提高瘤胃拟杆菌门的相对丰度(P<0.05);多样性分析结果表明,饲喂驼绒藜会显着增加瘤胃中细菌多样性(P<0.05)。综上,饲喂苜蓿一类高蛋白饲草能够促进苏尼特羊增肥,但降低了羊瘤胃细菌多样性,瘤胃细菌优势细菌为拟杆菌门,优势菌种为普雷沃菌。而饲喂驼绒藜一类高纤维饲料对羊的增肥效果不明显,但提高了瘤胃细菌多样性和微生态环境,可能更有利于羊的健康。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
细菌区系论文参考文献
[1].聂召龙,刘书杰,崔占鸿,潘浩,柴沙驼.新疆巴州幼年与成年牦牛瘤胃细菌区系多样性分析[J].核农学报.2019
[2].杨鼎,祁云霞,王晓娟,伊风艳,吴江鸿.驼绒藜和苜蓿对苏尼特羊增重及瘤胃细菌区系的影响[J].中国畜牧杂志.2019
[3].牛彦波,吴皓琼,安琦,王笑庸.接种大豆根瘤菌对大豆根际土壤细菌区系的影响[J].黑龙江科学.2019
[4].付辑光.饲粮铜水平对泌乳牛生产性能、血液生化指标、瘤胃细菌区系与铜代谢相关基因影响的研究[D].河北农业大学.2018
[5].颜霞,张亚男,刘聪,赵玲云,郭红梅.生防菌Hhs.015对苹果枝条皮层内生细菌区系的影响[J].果树学报.2017
[6].石明菁.威海海参养殖池沉积物富集培养过程中细菌区系演替分析及新菌鉴定[D].山东大学.2017
[7].薛云.孕酮和雌二醇对猪粪细菌区系的影响[D].南京农业大学.2017
[8].孙炜宁.基于高通量测序的泸酒酒醅和酸菜中细菌区系的研究[D].天津大学.2017
[9].王尧悦.日粮营养水平对滩羊瘤胃细菌区系及pH和VFA的影响[D].西北农林科技大学.2017
[10].赵敏,徐宸,贾凌,程廷才,汪长国.烟草叶际细菌区系检测探针的设计及优化[C].中国烟草学会2016年度优秀论文汇编——烟草农业主题.2016
论文知识图
