不结球白菜BcSERK1基因的克隆及表达分析

不结球白菜BcSERK1基因的克隆及表达分析

论文摘要

[目的]本文旨在研究不结球白菜BcSERK1基因及其在胚胎发生中的作用。[方法]采用同源克隆的方法从不结球白菜‘二桩白’中克隆到BcSERK1基因全长序列,利用生物信息学分析其结构特征,并与其他物种进行氨基酸序列比对和进化分析,同时利用基因枪介导的方法进行亚细胞定位;利用小孢子培养技术研究不结球白菜‘二桩白’和‘四九菜心’小孢子培养出胚情况;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析BcSERK1基因在2个品种不同组织和在小孢子胚胎发生早期的表达特征。[结果]BcSERK1含有1个1 878 bp开放阅读框,编码625个氨基酸。与其他物种的氨基酸序列比对和系统进化分析结果显示:BcSERK1在进化过程中保守程度较高,与甘蓝型油菜亲缘关系最近。亚细胞定位结果显示:BcSERK1蛋白定位于细胞膜上。游离小孢子培养结果显示:‘二桩白’出胚率较高,每蕾6.67个胚,而‘四九菜心’不出胚。RT-qPCR结果表明:BcSERK1在2个品种不同组织中均有表达,除根外‘四九菜心’的组织中其表达量均低于‘二桩白’;在小孢子胚胎发生早期,BcSERK1基因在‘二桩白’不同培养时间的表达量均高于‘四九菜心’。[结论]BcSERK1蛋白在进化过程中保守性较高,定位于细胞膜上;SERK1基因在2个不结球白菜品种中的差异表达表明该基因对胚胎发生具有重要作用。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 不结球白菜BcSERK1基因的克隆
  •   1.2 生物信息学分析
  •   1.3 BcSERK1亚细胞定位分析
  •   1.4 游离小孢子培养
  •   1.5 实时荧光定量PCR
  • 2 结果与分析
  •   2.1 BcSERK1基因的克隆及序列分析
  •   2.2 不结球白菜BcSERK1系统进化分析
  •   2.3 BcSERK1蛋白亚细胞定位分析
  •   2.4 不结球白菜游离小孢子培养及BcSERK1基因的组织表达分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张娅,黄天虹,张西林,刘同坤,侯喜林,李英

    关键词: 不结球白菜,克隆,序列分析,亚细胞定位,胚胎发生

    来源: 南京农业大学学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,园艺

    单位: 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/农业农村部华东地区园艺作物生物学与种质创新重点实验室/园艺学院

    基金: 国家自然科学基金项目(31872106),国家重点研发计划项目(2018YFD1000800,2017YFD0101803),国家大宗蔬菜产业技术体系项目(CARS-23-A-06)

    分类号: S634.3;Q943.2

    页码: 1014-1021

    总页数: 8

    文件大小: 10269K

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