碱基编辑器的开发及其在细菌基因组编辑中的应用

碱基编辑器的开发及其在细菌基因组编辑中的应用

论文摘要

碱基编辑器是近两年发展起来的新型基因组编辑工具,它将碱基脱氨酶的催化活性和CRISPR/Cas系统的靶向特异性进行结合,催化DNA或RNA链上特定位点的碱基发生脱氨基反应,进而完成碱基的替换。碱基编辑器分为DNA和RNA碱基编辑器两大类,其中DNA碱基编辑器分为两种:胞嘧啶碱基编辑器和腺嘌呤碱基编辑器;前者可以实现胞嘧啶到胸腺嘧啶的转换,而后者则可以将腺嘌呤突变为鸟嘌呤。由于DNA碱基编辑器不会造成DNA的双链断裂(DSB),也不依赖于宿主的非同源末端修复和同源重组途径,因此,大大减少了DSB相关的编辑副产物,如小片段插入或缺失等。基于CRISPR/Cas系统的RNA碱基编辑器,可以实现RNA链上腺嘌呤核苷到次黄苷的转换。本文对不同类型碱基编辑器的开发过程、适用范围和编辑特点等进行梳理,并对其在细菌基因组编辑中的应用进行了介绍;最后简要探讨了细菌中碱基编辑器的缺点以及将来可能的研究方向。

论文目录

  • 1 DNA碱基编辑器
  •   1.1 胞嘧啶碱基编辑器 (CBE)
  •   1.2 腺嘌呤碱基编辑器 (ABE)
  • 2 RNA碱基编辑器
  • 3 碱基编辑器在细菌基因组编辑研究中的应用
  •   3.1 大肠杆菌
  •   3.2 谷氨酸棒杆菌
  •   3.3 金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯氏菌等致病菌
  •   3.4 链霉菌
  • 4 总结与展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 赵亚伟,姜卫红,邓子新,汪志军,芦银华

    关键词: 系统,碱基编辑器,细菌

    来源: 微生物学通报 2019年02期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 上海师范大学生命科学学院,上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室

    基金: 国家自然科学基金(31770088,31570072)~~

    分类号: Q78

    DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180879

    页码: 319-331

    总页数: 13

    文件大小: 973K

    下载量: 391

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