EF-1α基因作为苹果牛眼果腐病菌DNA条形码的评价研究

EF-1α基因作为苹果牛眼果腐病菌DNA条形码的评价研究

论文摘要

苹果牛眼果腐病菌(Neofabraea malacorticis、N. perennans、N. kienholzii和N. vagabunda)是我国重点关注的进境水果检疫性有害生物,相似的形态和生理特征使该类真菌的鉴定非常困难。本研究在EF-1α基因区域设计了一对通用引物(NS1/NS4),对不同地理来源的苹果牛眼果腐病菌及其近缘种菌株进行序列分析,考察EF-1α基因是否具备成为苹果牛眼果腐病菌条形码的特征与条件。结果显示, EF-1α基因在苹果牛眼果腐病菌上的PCR扩增和测序成功率均为100%,具有明显的种间和种内遗传变异间距(Barcoding Gap),系统树分析显示该基因片段对4种苹果牛眼果腐病菌及其近缘种具有很好的区分能力,因此认为EF-1α基因可作为苹果牛眼果腐病菌理想的DNA条形码候选片段。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 菌丝体培养及DNA提取
  •   1.3 PCR扩增和测序
  •   1.4 EF-1α基因作为苹果牛眼果腐病菌DNA条形码的评价
  •     1.4.1 基因序列的PCR扩增与测序成功率
  •     1.4.2 序列比对和分析
  •     1.4.3 Barcoding Gap检验
  •     1.4.4 构建分子系统树
  • 2 结果与分析
  •   2.1 序列的获取难易程度评价
  •   2.2 Barcoding Gap检验
  •   2.3 EF-1α基因对苹果牛眼果腐病菌的物种识别能力评价
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 林惠娇,王卫芳

    关键词: 基因,苹果牛眼果腐病菌,明孢盘菌属,条形码,评价

    来源: 植物检疫 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,植物保护

    单位: 黄埔海关,广州海关,广东省动植物与食品进出口技术措施研究重点实验室

    基金: 原国家质检总局科技计划项目(2014IK004),原广东检验检疫局科技计划项目(2018GDK63)

    分类号: S432.44

    DOI: 10.19662/j.cnki.issn1005-2755.2019.03.003

    页码: 6-12

    总页数: 7

    文件大小: 585K

    下载量: 110

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