梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析

论文摘要

以梁山慈竹Dendrocalamus farinosus转录组数据库为基础,采用同源克隆技术从梁山慈竹笋中克隆到1个BABY BOOM(BBM)基因,命名为Df BBM,其开放阅读框长度为1101 bp,推测编码366个氨基酸残基。蛋白功能域预测分析表明,Df BBM基因含有AP2结构域,证明该基因确实属于AP2/ERF转录因子家族基因之一;进化树分析发现,Df BBM基因与玉米的BBM2以及山羊草和旱麦草的BBM基因在一个分支上,序列高度相似;保守结构域分析发现,Df BBM和Zm BBM2,Ae BBM1,Et BBM之间含有8个保守基序,这可能有助于研究Df BBM和其他物种BBM基因的相似功能。Df BBM的三级结构预测和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似。组织表达分析表明,Df BBM基因在梁山慈竹展开叶和笋尖表达较高,Df BBM基因对ABA、IAA、NAA和Me JA激素处理均有响应,其中ABA、IAA和Me JA激素处理2 h后其表达量上升达到最高值,随后开始下降;而在NAA激素处理后其表达则明显下降。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王丽丽,唐一,黄艳,曹颖,胡尚连

关键词: 梁山慈竹,基因,克隆,生物信息学,表达模式

来源: 竹子学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,林业

单位: 西南科技大学植物细胞工程实验室,四川省生物质资源利用与改性工程技术研究中心

基金: 四川省“十三五”重点攻关项目(2016NYZ0038),四川省重点研发项目(2017NZ0008),四川省应用基础研究项目(18YYJC0920),西南科技大学研究生创新基金(18ycx028)

分类号: S795;Q943.2

DOI: 10.19560/j.cnki.issn1000-6567.2019.02.004

页码: 24-31

总页数: 8

文件大小: 610K

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