三白草AP1基因的表达和进化选择压力分析

三白草AP1基因的表达和进化选择压力分析

论文摘要

为了探究选择压力对三白草AP1基因进化的影响,本研究在已克隆三白草AP1基因的基础上,对AP1a和AP1b两个同源基因做RT-PCR分析,并对AP1a和AP1b 2个同源基因和29个AP1同源基因做多序列比对,通过生物信息学软件包PAML 4.9中的codeml程序对三白草AP1基因和29个供试物种的AP1基因的CDS序列进行了进化选择压力分析。结果显示,AP1a和AP1b基因在花中的表达明显高于叶;所有的31个CDS序列的选择压力测度参数ω均小于1,表明AP1基因所承受的选择压力总体趋势为纯化选择。而多序列比对结果表明AP1基因在不同品种植物间有所保守,但在同一个物种中AP1基因又存在着分化。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 目的基因的获取
  •     1.1.1 三白草总RNA的提取及纯化
  •     1.1.2 PCR获取目的基因
  •   1.2 AP1基因克隆与CDS序列的筛选
  •   1.3 系统进化分析
  •   1.4 AP1基因编码蛋白的进化选择压力分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 获取目的基因
  •   2.2 AP1基因CDS序列的同源性分析
  •   2.3 AP1基因编码氨基酸序列的同源性及结构域分析
  •   2.4 AP1基因编码蛋白的进化选择压力分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 穆彦峰,何丽莲,梁受文,赵银河

    关键词: 基因,进化,选择压力分析,纯化选择

    来源: 种子 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 云南农业大学农学与生物技术学院

    基金: 国家自然科学基金[NSFC 31760059,NSFC 31460053]

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.16590/j.cnki.1001-4705.2019.01.001

    页码: 1-4+12

    总页数: 5

    文件大小: 799K

    下载量: 302

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