基因组稳定性论文-孙晓辉,刘强

基因组稳定性论文-孙晓辉,刘强

导读:本文包含了基因组稳定性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:NRF2,ATR,细胞周期阻滞,DNA损伤修复

基因组稳定性论文文献综述

孙晓辉,刘强[1](2019)在《NRF2维持基因组稳定性机制研究》一文中研究指出目的探究电离辐射(IR)和化学试剂诱导DNA损伤条件下,NRF2调控DNA损伤修复过程、维持基因组稳定性的机制。材料和方法在A549细胞、H1299细胞、H460细胞和293T细胞中采用CRISPRCas9技术,siRNA或shRNA构建NRF2敲除或敲降细胞系;通过质粒转染在细胞内表达外源蛋白。克隆形成实验检测IR或喜树碱(CPT)处理后细胞存活和增殖能力。流式细胞术检测IR或CPT诱导DNA损伤后细胞凋亡和细胞周期。免疫荧光检测细胞DNA损伤后NRF2、ATR、H2AX、53BP1、BRCA1、RAD51等蛋白焦点形成情况。DR-GFP-U2OS同源重组报告系统检测NRF2对同源重组修复效率影响。蛋白质免疫印迹检测NRF2、ATR、CHK1、CDC2、CyclinA等蛋白变化情况。免疫共沉淀实验检测细胞内NRF2与ATR间相互作用。GST-pull down实验检测在细胞外NRF2与ATR相互作用情况。裸鼠移植瘤模型中检测NRF2抑制剂Brusatol辐射增敏效果。结果细胞内敲除或敲降NRF2导致辐射敏感性增强,对DNA损伤诱导药物CPT敏感性增强。表达外源NRF2可以增强细胞对IR和CPT的抗性。NRF2缺失细胞DNA损伤修复时间延长,微核形成率升高,同源重组修复(HR)效率降低。NRF2在DNA损伤修复过程中促进ATR磷酸化,ATR-CHK1-CDC2信号通路活化,进而引起G2期细胞周期阻滞。NRF2可以在DNA损伤位点与ATR相互作用形成蛋白复合物,并且其对ATR的活化依赖于AAD(ATR activation domain)结构域。在移植瘤模型中使用NRF2抑制剂Brusatol可减弱移植瘤由IR引起的ATR-CHK1-CDC2信号通路活化,进而增强肿瘤的辐射敏感性。结论在电离辐射和化学试剂诱导DNA损伤条件下,NRF2可以通过促进ATR磷酸化、ATRCHK1-CDC2信号通路活化、G2期细胞周期阻滞参与DNA损伤修复过程,维持基因组稳定性。(本文来源于《中国毒理学会第九次全国毒理学大会论文集》期刊2019-09-17)

曹宇,张乔晔,花蕊,马晓玲,汪旭[2](2019)在《白藜芦醇对人结肠细胞NCM 460和SW620增殖及基因组不稳定性的影响》一文中研究指出目的:探讨白藜芦醇(RSV)对人结肠上皮细胞株NCM460及结肠癌细胞株SW620增殖和基因组不稳定性(GIN)的影响。方法:选用NCM460和SW620细胞为研究材料,以台盼兰拒染法检测不同浓度RSV(3.125、6.25、12.5、25、50、100μmol/L)对细胞增殖的影响;以CBMN-Cyt和集落形成实验分别检测不同浓度RSV(25、100μmol/L)对GIN和细胞集落形成能力的影响。结果:与对照组相比,6.25~100μmol/L的RSV对SW620细胞的增殖具有明显的抑制作用(P<0.05),100μmol/L的RSV处理后细胞凋亡率增加、GIN上升、细胞集落形成能力降低(P<0.05或0.01);同时,相同浓度的RSV可以降低NCM460细胞的GIN,促进细胞分裂并增强细胞集落形成能力(P均<0.05)。结论:RSV可维护正常细胞结肠上皮细胞NCM460的基因组稳定性,同时显着提高结肠癌细胞SW620的GIN发生率,可能是其在结肠癌治疗中表现出较好的抗癌效应及正常细胞保护作用的分子基础。(本文来源于《癌变·畸变·突变》期刊2019年04期)

王晶,周永安,苏丽萍,李峰敏,陈明[3](2019)在《白血病患者线粒体基因组D-loop区基因不稳定性研究》一文中研究指出目的:探讨白血病患者线粒体基因组D-loop区基因的不稳定性。方法:采用PCR扩增24例患者D-loop区HV-1和HV-2两个高变区并测序,其结果与剑桥标准序列(rCRS)和mtDB数据库进行比对,分析其突变情况。采用SPSS 22.0统计学软件对数据进行分析。结果:23例患者D-loop区发生突变,突变率95.83%(23/24);共检测到82个基因突变,其中HV-1区47个(57.32%),HV-2区35个(42.68%)。急性髓系白血病患者中未治疗组(UT)与治疗组(T)对比:突变率分别为(2.37±0.82)×10~(-3)和(4.76±2.45)×10~(-3),其差异有统计学意义(P<0.01)。急性髓系白血病治疗组中部分缓解组(PR)和完全缓解组(CR)突变率比较显示,突变率分别为(5.10±2.56)×10~(-3)和(4.51±2.51)×10~(-3),其差异无统计学意义(P>0.05)。M3组间比较显示,未治疗组(UT)、部分缓解组(PR)和完全缓解组(CR)突变率分别为(2.55±0.63)×10~(-3),(5.37±3.41)×10~(-3)和(3.71±1.65)×10~(-3),其差异无统计学意义(P>0.05)。结论:D-loop区中存在较高的突变率和多种突变类型,具有较强的不稳定性;化疗可能加剧D-loop区基因的不稳定性。(本文来源于《中国实验血液学杂志》期刊2019年03期)

卞吉[4](2019)在《北京师范大学樊小龙教授团队在脑胶质瘤基因组不稳定性、风险评估及靶向治疗上取得重要进展》一文中研究指出2019年3月15日,北京师范大学樊小龙教授团队与首都医科大学附属北京天坛医院、北京市神经外科研究所的江涛教授团队及天津医科大学康春生教授团队合作,在美国科学院院刊(PNAS)在线发表题为《Elevated signature of a gene module coexpressed with CDC20marks genomic instability in glioma》的文章(DOI:10.1073/pnas.1814060116),该文基于胶质瘤转录组数据库,首次发现并建立了CDC20-M共表达模块,CDC20-M在胶质瘤的基因组不稳定性检测、预后评估及治疗靶点筛选上具有重要意义.(本文来源于《北京师范大学学报(自然科学版)》期刊2019年02期)

王咪,张云航,张阔,兰敏,詹晶[5](2019)在《猪流行性腹泻病毒YZ2016全基因组测序与稳定性分析》一文中研究指出2016年我国江苏扬州某规模化养猪场暴发严重腹泻,本实验室通过RT-PCR确定其病原为猪流行性腹泻病毒(PEDV)。将阳性样品接种Vero细胞,盲传5代后出现典型病变,并通过RT-PCR及间接免疫荧光试验确定成功分离到PEDV毒株,命名为PEDVYZ2016。采用分段重迭法对分离株基因组扩增测序,获得其全长序列。遗传进化分析显示PEDV YZ2016与近年流行毒株亲缘关系较近,与经典毒株亲缘关系较远。PEDV YZ2016与BJ-2011-1、LZW全基因组核苷酸序列一致性可达99. 2%,与BJ-2011-1、OKN-1/JPN/2013 S基因推导氨基酸序列一致性可达98.5%。此外,分离株S基因发生多处点突变,导致其抗原表位及糖基化位点均发生部分改变。同时,序列比对分析显示不同代次的S、ORF3、N基因核苷酸突变率均极低。结果表明,本研究分离的PEDV YZ2016株属流行变异毒株,且在传代过程中遗传稳定性良好。(本文来源于《中国兽医科学》期刊2019年07期)

[6](2018)在《高温高光下水稻维持基因组稳定性和ROS动态平衡的机制》一文中研究指出高温和高光是农业生产中常见的非生物胁迫,现已成为水稻高产、稳产和优质的重要限制因素。研究人员以高温高光为条件对日本晴突变体库进行筛选,得到一个对高温高光敏感的突变体ls1(local lesions 1)。在高温高光胁迫下,该突变体具有叶片局部细胞凋亡(本文来源于《种业导刊》期刊2018年12期)

潘理会,李育庄,李春辉[7](2018)在《基因组不稳定性在散发性结肠癌中的研究现状》一文中研究指出结肠癌是常见的消化道恶性肿瘤之一,其中80%以上为散发性结肠癌。散发性结肠癌是一种异性疾病,主要包括叁条基因组不稳定性途径:染色体不稳定性(CIN)、微卫星不稳定性(MSI)和Cp G岛甲基化表型(CIMP)。深入探讨散发性结肠癌发生、发展中的生物学途径,对肿瘤的早期诊断和预防治疗具有重要指导意义。(本文来源于《当代临床医刊》期刊2018年05期)

程金科[8](2018)在《类泛素化修饰(SUMOylation)与基因组稳定性》一文中研究指出蛋白质翻译后修饰在细胞有丝分裂和基因组稳定性中的作用机制一直是生物学研究的热点。该文主要介绍蛋白去SUMO化修饰酶SENP3在细胞有丝分裂期姐妹染色体分离中的作用,以及蛋白SUMO化修饰和磷酸化修饰的相互调控作用在维持细胞基因组稳定性中新的分子机制。(本文来源于《上海交通大学学报(医学版)》期刊2018年07期)

赵玫[9](2018)在《HCV NS2、NS3/4A蛋白对人肝癌Huh7细胞基因组稳定性的影响》一文中研究指出目的:肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是我国发病率和死亡率分别位居第四位和第叁位的癌症“杀手”,到目前为止仍缺乏有效的防治手段。丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)慢性感染与肝癌的发生发展密切相关,但相关的分子机制仍不清楚。因此本研究拟初步探讨HCV编码的非结构蛋白NS2和NS3/4A对细胞基因组稳定性的影响,以期为HCV感染相关的HCC发病机制提供新的视角。方法:1.质粒构建:以p CMV-tag2B为载体,以HCV 2a型JFH-1株基因为模板,采用双酶切法构建HCV NS2基因的重组载体p CMV-tag2B-NS2,经酶切和DNA测序进行鉴定;2.WB和DAPI染色分析:在Huh7细胞中分别转染空载体、HCV NS2及NS3/4重组载体后,采用Western blot和/或DAPI染色分析不同药物处理(CPT、Taxol及Nutlin-3)处理时HCV蛋白对DNA损伤应答信号和凋亡的影响;3.免疫荧光检测:在U2OS细胞中分别转染空载体、HCV NS3/4A重组载体后,用免疫荧光方法检测γ-Tubulin和α-Tubulin的表达;4.流式细胞术检测:在Huh7细胞中转染HCV NS2或NS3/4A表达质粒后,流式细胞术检测病毒蛋白对细胞周期的影响;5.MTT法分析:在Huh7细胞中转染p LV-Green和p LV-Green-NS3/4A后,采用MTT法分析Taxol、Nutlin-3单独或联合处理时NS3/4A蛋白对细胞活力的影响;6.数据处理:数据统计用SPSS19.0软件处理,计量资料以均数±标准差表示,组间率的比较采用卡方检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果:1.成功构建真核表达质粒p CMV-tag2B-NS2;2.p CMV-tag2B-NS2和p CMV-tag2B质粒转染的细胞凋亡率分别为(15.33±0.88)%和(4.66±0.88)%(P<0.05),表达HCV NS2蛋白的细胞周期分布与对照细胞相近(c2=0.17,P>0.05);并且表达HCV NS2蛋白的细胞中DNA损伤相关蛋白γH2AX、CHK1及DNA损伤修复蛋白RPA32表达水平较对照细胞显着升高;3.过表达HCV NS3/4A蛋白的细胞经喜树碱(CPT)处理时,磷酸化的NBS1、CHK1及RPA32的表达水平降低。4.HCV NS3/4A蛋白表达的细胞与对照细胞相比,中心体数量及异常分裂的细胞显着增多(P<0.05);HCV NS3/4A蛋白表达的Huh7细胞在Taxol诱导下增殖活性明显下降(P<0.05)。5.HCV NS3/4A蛋白表达的细胞S期减少而G2/M期增多(c2=6.21,P<0.05)。结论:1.HCV NS2蛋白可促进Huh7细胞凋亡,但对细胞周期进程无影响;2.HCV NS2蛋白可诱导DNA损伤,并激活ATR-CHK1通路活化DNA损伤应答反应;3.HCV NS3/4A蛋白可诱导DNA损伤并干扰ATR和ATM介导的损伤应答反应;4.HCV NS3/4A蛋白可诱导细胞发生中心体扩增和有丝分裂异常,增强细胞对Taxol处理的敏感性;5.HCV NS3/4A蛋白能引起细胞发生DNA损伤,且抑制其修复,造成细胞基因组不稳定。(本文来源于《山西医科大学》期刊2018-06-15)

陈姝敏[10](2018)在《烟草TMV抗性基因TV突变体的筛选及烟草基因组稳定性研究》一文中研究指出自然界高等植物中半数以上物种为多倍体,现为二倍体的物种也常常经历过古老的多倍体化。一般认为,多倍体化加快基因组进化速度,促进新物种的形成。然而,即使是进化速度最快的植物物种,基因组中的突变频率依然很低,很难用常规的方法检测突变类型及其发生频率。了解植物基因组各种突变的频率、多倍体植物基因组的进化特点对深入了解植物进化具有重要意义。本论文利用一个高通量鉴定突变体的方法,详细分析了异源四倍体烟草(Nicotiana tabacum)基因组的稳定性,调查了不同突变类型及估算了突变发生频率。具体研究结果如下:(1)利用一个高通量筛选抗病基因突变体的体系鉴定TMV抗性基因的功能缺失突变体。将纯合转TMV无毒基因P50的烟草,与含有TMV抗性基因N的烟草杂交,获得既含有抗病基因又含有无毒基因的F1杂种,这两个基因的同时表达诱导细胞发生程序性死亡,导致整个发芽幼苗的死亡。但是,当N基因或者P50基因发生功能缺失突变,幼苗不再发生系统性过敏反应,幼苗正常存活。(2)利用这个系统,共筛选了1,400万粒F1杂交种,对存活植株进行分析,鉴定出2,134个F1植株失去对TMV的抗性,突变率为1/6,600。用N基因特异性引物PCR扩增发现除14个突变体外,其它绝大多数突变体中N基因全部序列缺失。用N基因所在染色体的分子标记筛选,发现N基因的侧翼序列也存在不同范围丢失。其中整条染色体丢失的频率为1/15,000,GISH研究表明,这些突变纯合体中只有46条染色体(野生型为48条)。分子标记筛选表明N基因所在染色体部分序列丢失的频率为1/12,000。(3)随机挑选一个N染色体部分缺失突变体N160,分析其序列缺失的机理。利用N基因所在染色体上的分子标记对该突变的纯合体进行筛选,将该突变体序列缺失边界定位在36 bp范围内,用FPNI PCR方法获得缺失区域的替换序列,序列分析发现,N基因所在染色体丢失的部分由它的同祖染色体替换,形成一个嵌合染色体。GISH实验证明嵌合染色体的存在。因此,突变体N160中N基因丢失是由于同祖染色体交换导致的。(4)同祖染色体交换后,分子标记在F2分离群体中表现出4:11:1的分离比例。随机挑选5个染色体部分缺失突变体进行分析,发现均存在接近4:11:1分离比例的分子标记。因此,所有部分染色体缺失突变体都可能是同祖染色体交换引起的,其发生频率为至少1/12,000(有些交换不能被本研究方法鉴定)。(5)染色体不同区域发生同祖染色体交换的频率与该区域发生同源染色体交换的频率不存在线性相关,表明两者存在完全不一样的机制。(6)无论是N基因所在染色体丢失,还是发生同祖染色体交换,都显着降低了这些突变纯合体的生活力。总结,通过本实验室建立的高通量筛选方法,共鉴定了2,134个N基因功能缺失突变体。N基因功能缺失的主要原因是染色体丢失或同祖染色体交换,其频率大大高于点突变及缺失插入突变的频率。同时,与点突变不一样,每一个同祖染色体交换或染色体丢失事件可能改变基因组中106-108碱基。同祖染色体交换及染色体丢失只能在多倍体中产生,二倍体几乎不可能发生这些突变。因此,与二倍体相比,多倍体的基因组可能比二倍体更加不稳定,一方面可能加快物种的灭绝,也可能使多倍体获得更多的多态性,进而在严酷的环境中竞争过二倍体,产生新的物种。(本文来源于《华中农业大学》期刊2018-06-01)

基因组稳定性论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的:探讨白藜芦醇(RSV)对人结肠上皮细胞株NCM460及结肠癌细胞株SW620增殖和基因组不稳定性(GIN)的影响。方法:选用NCM460和SW620细胞为研究材料,以台盼兰拒染法检测不同浓度RSV(3.125、6.25、12.5、25、50、100μmol/L)对细胞增殖的影响;以CBMN-Cyt和集落形成实验分别检测不同浓度RSV(25、100μmol/L)对GIN和细胞集落形成能力的影响。结果:与对照组相比,6.25~100μmol/L的RSV对SW620细胞的增殖具有明显的抑制作用(P<0.05),100μmol/L的RSV处理后细胞凋亡率增加、GIN上升、细胞集落形成能力降低(P<0.05或0.01);同时,相同浓度的RSV可以降低NCM460细胞的GIN,促进细胞分裂并增强细胞集落形成能力(P均<0.05)。结论:RSV可维护正常细胞结肠上皮细胞NCM460的基因组稳定性,同时显着提高结肠癌细胞SW620的GIN发生率,可能是其在结肠癌治疗中表现出较好的抗癌效应及正常细胞保护作用的分子基础。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

基因组稳定性论文参考文献

[1].孙晓辉,刘强.NRF2维持基因组稳定性机制研究[C].中国毒理学会第九次全国毒理学大会论文集.2019

[2].曹宇,张乔晔,花蕊,马晓玲,汪旭.白藜芦醇对人结肠细胞NCM460和SW620增殖及基因组不稳定性的影响[J].癌变·畸变·突变.2019

[3].王晶,周永安,苏丽萍,李峰敏,陈明.白血病患者线粒体基因组D-loop区基因不稳定性研究[J].中国实验血液学杂志.2019

[4].卞吉.北京师范大学樊小龙教授团队在脑胶质瘤基因组不稳定性、风险评估及靶向治疗上取得重要进展[J].北京师范大学学报(自然科学版).2019

[5].王咪,张云航,张阔,兰敏,詹晶.猪流行性腹泻病毒YZ2016全基因组测序与稳定性分析[J].中国兽医科学.2019

[6]..高温高光下水稻维持基因组稳定性和ROS动态平衡的机制[J].种业导刊.2018

[7].潘理会,李育庄,李春辉.基因组不稳定性在散发性结肠癌中的研究现状[J].当代临床医刊.2018

[8].程金科.类泛素化修饰(SUMOylation)与基因组稳定性[J].上海交通大学学报(医学版).2018

[9].赵玫.HCVNS2、NS3/4A蛋白对人肝癌Huh7细胞基因组稳定性的影响[D].山西医科大学.2018

[10].陈姝敏.烟草TMV抗性基因TV突变体的筛选及烟草基因组稳定性研究[D].华中农业大学.2018

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