微卫星标志遗传论文_林琳

导读:本文包含了微卫星标志遗传论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:染色体,基因,疟原虫,群体,标志,心律失常,基因组。

微卫星标志遗传论文文献综述

林琳[1](2011)在《应用微卫星DNA标志研究我国雷氏按蚊群体遗传结构》一文中研究指出雷氏按蚊Anopheles lesteri Baisas & Hu 1936,隶属按蚊属(Genus Anopheles)、赫坎按蚊种团(An. hyrcanus group),分布于菲律宾、中国、日本、韩国和关岛等地,就医学重要性而言,仅在我国中部具有较高的传疟效能。多年的调查显示,雷氏按蚊在我国不同地理分布区,生态习性和传病能力也存在一定差异,故亟待深入研究雷氏按蚊的群体的遗传差异。本研究应用分子特征首先鉴别我国的按蚊样本;在研究雷氏按蚊多态微卫星DNA位点特征的基础上,应用多态的微卫星DNA位点检测我国雷氏按蚊群体遗传结构。依据分子特征鉴别我国的按蚊样本,提高了准确性,在一定程度上补充和更新了各地按蚊的本地资料。雷氏按蚊不同群体的遗传差异程度,以及群体分化等问题的阐明,可望为制定媒介区的疟疾控制策略提供理论依据。课题研究策略如下:首先,对我国不同分布地的按蚊样本依据rDNA的2个标志,即ITS2和D3,进行分子鉴定;之后,对课题组已分离的雷氏按蚊微卫星DNA位点应用现场样本进行GENESCAN扫描,研究各位点的基本特征;应用获得的多态微卫星位点检测我国雷氏按蚊的群体内和群体间的遗传差异。取得如下主要结果:1.本研究分子鉴定的样本来自云南、湖北、贵州、河南、广东、山东、辽宁、陕西和海南共126个样本,序列分析结果显示包括:中华按蚊(An. sinensis)(n=44)、迷走按蚊(An. vagus)(n=22)、暗灰按蚊(An. pullus) (n=18)、微小按蚊(An. minimus)(n=13)、林氏按蚊(An. lindesayi)(n=10)、克莱按蚊(An. kleini)(n=4)、筠连按蚊(An. junlianensis)(n=4)、腹簇按蚊(An. kochi)(n=4)、比伦按蚊(An. belenrae)(n=3)、贵阳按蚊(An. kweiyangensis)(n=3)和乌头按蚊(An. aconitus)(n=1)。2.序列分析发现存在4类无法定名的种类,即LL1、LL2、LL3和LL4,除LL4外,其他3类均与赫坎按蚊种团成员种最为近似,应是该种团的新成员种。另外,在多种按蚊中发现个体内的碱基双峰现象,提示这些按蚊物种近期分化活跃,处于隐种形成中(speciation)。3.应用分子鉴定确认的雷氏按蚊现场57个样本,研究了雷氏按蚊11个多态微卫星DNA的基本特征,为进一步检测雷氏按蚊的群体遗传结构提供了新的分子标志。4.应用9个多态的微卫星DNA位点检测了采自我国17个,以及韩国1个采集地的雷氏按蚊样本共216个,各行政省份合并后成1个群体,将获得的9个群体进行后续分析。5.雷氏按蚊群体内遗传差异的分析结果可见,平均期望杂合度和观察杂合度的范围为0.4848(江苏)~0.7134(辽宁)和0.3309(江苏)~0.4704(韩国);在辽宁群体中自有等位基因最多(9),而云南群体无自有等位基因;近交系数范围为0.2101(海南)~0.5037(湖北),平均为0.3508;经检验,总共30个位点偏离哈代-温伯格平衡,辽宁群体中的位点最多(7),在韩国、云南和湖北群体无位点偏离;连锁不平衡的检验结果显示,存在连锁关联的共38对位点(P<0.01),位点ANL10与ANL11在所有群体中均出现连锁关联,其他位点无规律。6.雷氏按蚊群体间遗传差异分析时去除江苏群体(实验室品系),以及位点ANL11。分析结果可见,成对群体间的FST范围为-0.0127(辽宁与韩国)~0.2539(云南与海南);Mantel检验结果显示群体间遗传差异与地理距离为正相关关系,群体遗传结构符合地理隔离模型;分子变异等级分析显示雷氏按蚊的变异主要存在于群体内,占总变异的86.55%,群体间的变异仅占总变异的13.45%;贝叶斯法的分析结果均显示所有群体可分为2个支,分支I包括广东和辽宁群体,分支II包括即韩国、河南、湖北、广东、海南和四川群体。7.雷氏按蚊群体的稳定性和规模的分析结果可见,河南、湖北、海南和辽宁共4个群体经历了近期群体的扩张;基于连锁不平衡模型,群体规模的范围为1.2(湖北)~33.7(广东),总体的群体规模为44.6,95%置信区间为40.6~49.0。8.综合分析雷氏按蚊的群体遗传结构,可以推测雷氏按蚊的祖先群体来自云南,其他群体均为扩散而至,向北、东迁移和扩散,在途中定殖,为适应当地生态环境出现一定比例的变异。雷氏按蚊分布广泛,地理屏障虽在一定程度上阻碍基因的交流,但群体间差异并不大,群体遗传结构符合地理隔离模型(Isolation-by-distance Model)。因其在我国中部的医学重要性,故在分布地长期、大量使用杀虫剂,导致雷氏按蚊的群体数量较小,存在大量近交,偏离哈代-温伯格平衡的现象。(本文来源于《第二军医大学》期刊2011-04-25)

王冬,马雅军,周红宁[2](2010)在《应用微卫星DNA标志研究我国大劣按蚊群体的遗传差异》一文中研究指出目的应用微卫星DNA分子标志阐明我国大劣按蚊(广义)群体的遗传差异水平。方法研究样本包括经分子鉴别的大劣按蚊(海南省实验室品系和海南省毛阳野生群体)和大劣按蚊D种(云南省江城和云南省勐腊野生群体),扩增10个多态的微卫星DNA位点,用Arlequin软件分析和计算相关指标。结果对89个大劣按蚊样本进行微卫星位点的扩增,等位基因数范围为1~32个,平均值为3.60~25.20,并非所有微卫星位点在所有群体中均呈现多态性。群体的平均期望杂合度和观察杂合度的范围分别为0.49~0.72和0.36~0.58,两者在海南省群体中均为最低。成对群体间的FST值为负值或很小,提示群体间未出现遗传分化。分级AMOVA计算结果显示,大劣按蚊群体内的变异占总变异的103.29%,种内变异为负值(-3.97%),种间变异仅占总变异的0.67%。结论大劣按蚊与大劣按蚊D种内和种间遗传差异均非常小,微卫星DNA的变异主要在个体间。(本文来源于《中国媒介生物学及控制杂志》期刊2010年02期)

俞萍,周强,郭磊,周永明,罗媛媛[3](2004)在《常染色体显性遗传小眼球病与12个微卫星多态标志的初步连锁分析》一文中研究指出本文报道了一个常染色体显性遗传小眼球的大家系,初步排除了此家系致病基因在目前已知位点(CHX10、MITF、RX、MCOP、NNO1、NNO2)的可能,并探讨了与11号染色体上的微卫星DNA标志的连锁关系。采用聚合酶链(PCR)扩增微卫星DNA片段,扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,用银染显示结果;用MLINK连锁分析软件计算LOD值。结果显示,本家系小眼球致病基因与6个已知位点及11号染色体上的微卫星DNA标志之间不存在连锁,提示此家系的致病位点目前尚未被定位。(本文来源于《实验生物学报》期刊2004年02期)

杨春梅,黄峻,马立隽,卞茸文,许迪[4](2003)在《家族性致心律失常性右室心肌病与微卫星遗传标志的连锁分析》一文中研究指出目的 研究探索致心律失常性右室心肌病 (ARVC)家系与 3个微卫星遗传标志的连锁关系 ,进行ARVC的基因定位。方法 选择微卫星遗传标志D2S15 2、D14S2 5 2和D10S16 6 4 ,对 12 1例背景人群和 5个中国人ARVC家系 (家系编号 1~ 5 ) ,用每个微卫星引物扩增家系和背景人群DNA的微卫星片段 ,在DNA手工测序电泳仪槽上进行恒功率变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染、读取等位基因片段 ,在常染色体显性和隐性两种遗传模式下进行连锁分析。结果  (1)根据D2S15 2的连锁资料 ,在常染色体显性遗传模式下 ,1~ 5号家系的连锁值 (Logarithmofodd ,LOD值 )分别为 2 17、- 0 5 9、-∞ (负无穷大 )、- (表示此遗传模式下不支持连锁分析 )、-∞ ,均为θ =0。在常染色体隐性遗传模式下 ,1~ 5号家系的LOD值分别为 -∞、-∞、-∞、-∞、0 18。 (2 )根据D14S2 5 2的连锁资料 ,在常染色体显性遗传模式下 ,1~ 5号家系的LOD值分别为 -、-、-∞、-、0。在常染色体隐性遗传模式下 ,1~ 5号家系的LOD值分别为 -∞、- 0 81、-∞、-∞、0 0 9。 (3)根据D10S16 6 4的连锁资料 ,在常染色体显性遗传模式下 ,1~ 5号家系的LOD值分别为 -、-、0 5 4、-、0 6 0。在常染色体隐性遗传模式下 ,1~ 5号家系的LOD值分别为 -、-∞、-∞、-∞、(本文来源于《中华心血管病杂志》期刊2003年12期)

王勇[5](2002)在《恶性疟原虫微卫星标志和遗传作图》一文中研究指出从恶性疟原虫基因组测序计划中不断获得的资料,为抗人体恶性疟的深入研究奠定了基础。了解基因序列是认识疟原虫诸如发育、传播、致病、抗药性等基本生物学过程以及鉴定新的药物和疫苗作用靶分子机制的关键。然而,即便是新近完成测序的恶性疟原虫3D7株,广泛认识这些基因及其在疟原虫生物学方面的作用仍非易事,况且,恶性疟原虫的基因组序列不仅是3D7株的序列,而是相同基因背景的恶性疟原虫变异序列的集合。因此,需要补救方法以确定遗传变异(即序列差异)和它们相应的功能之间的关系。 遗传作图可用于确定生物体有性重组中(本文来源于《国外医学(寄生虫病分册)》期刊2002年03期)

微卫星标志遗传论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的应用微卫星DNA分子标志阐明我国大劣按蚊(广义)群体的遗传差异水平。方法研究样本包括经分子鉴别的大劣按蚊(海南省实验室品系和海南省毛阳野生群体)和大劣按蚊D种(云南省江城和云南省勐腊野生群体),扩增10个多态的微卫星DNA位点,用Arlequin软件分析和计算相关指标。结果对89个大劣按蚊样本进行微卫星位点的扩增,等位基因数范围为1~32个,平均值为3.60~25.20,并非所有微卫星位点在所有群体中均呈现多态性。群体的平均期望杂合度和观察杂合度的范围分别为0.49~0.72和0.36~0.58,两者在海南省群体中均为最低。成对群体间的FST值为负值或很小,提示群体间未出现遗传分化。分级AMOVA计算结果显示,大劣按蚊群体内的变异占总变异的103.29%,种内变异为负值(-3.97%),种间变异仅占总变异的0.67%。结论大劣按蚊与大劣按蚊D种内和种间遗传差异均非常小,微卫星DNA的变异主要在个体间。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

微卫星标志遗传论文参考文献

[1].林琳.应用微卫星DNA标志研究我国雷氏按蚊群体遗传结构[D].第二军医大学.2011

[2].王冬,马雅军,周红宁.应用微卫星DNA标志研究我国大劣按蚊群体的遗传差异[J].中国媒介生物学及控制杂志.2010

[3].俞萍,周强,郭磊,周永明,罗媛媛.常染色体显性遗传小眼球病与12个微卫星多态标志的初步连锁分析[J].实验生物学报.2004

[4].杨春梅,黄峻,马立隽,卞茸文,许迪.家族性致心律失常性右室心肌病与微卫星遗传标志的连锁分析[J].中华心血管病杂志.2003

[5].王勇.恶性疟原虫微卫星标志和遗传作图[J].国外医学(寄生虫病分册).2002

论文知识图

PCR分析显示ntES细胞含有人类基因组多态位点16399AA与GG基因型患者生存期比...微卫星遗传标志分析微卫星遗传标志分析证明核供体成纤维细...

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微卫星标志遗传论文_林琳
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