板栗实时定量PCR内参基因的筛选与验证

板栗实时定量PCR内参基因的筛选与验证

论文摘要

实时荧光定量PCR技术具有高灵敏性和高特异性,被广泛应用于基因表达分析,选取合适的内参基因是利用该技术准确分析目的基因表达变化的前提。本文以板栗的7种不同组织器官(根、茎、叶、种子、花芽、雌花和雄花)为材料,采用qRT-PCR技术分析了板栗中6个候选内参基因(EF1α、TUA、TUB、UBQ、18S rRNA和Actin)的表达趋势,运用geNorm、NormFinder和BestKeeper 3种软件对候选内参基因的表达稳定性进行了综合分析,并利用目的基因CmSPL9对筛选出的内参基因进行验证。结果表明:Actin和EF1α在板栗不同组织器官中稳定性最佳, Actin、EF1α或Actin+EF1α可作为板栗的内参基因进行后续试验研究。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验材料
  •   1.2 实验方法
  •     1.2.1 总RNA提取与cDNA合成
  •     1.2.2 内参基因的选择和引物设计
  •     1.2.3 qPCR反应条件
  •     1.2.4 引物特异性鉴定及扩增效率的计算
  •     1.2.5 数据处理与分析
  • 2 实验结果
  •   2.1 总RNA质量检测及引物特异性分析
  •   2.2 候选内参基因Ct值分析
  •   2.3 候选内参基因表达稳定性分析
  •   2.4 内参基因稳定性的验证
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈国松,李靖同,刘阳,曹庆芹,张卿,秦岭,邢宇

    关键词: 板栗,内参基因,实时定量,基因

    来源: 植物生理学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学,园艺

    单位: 北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京市重点实验室,北京农学院生物科学与工程学院/农业部华北都市农业重点实验室,北京林果业生态环境功能提升协同创新中心

    基金: 北京市属高等学校创新团队建设与教师职业发展计划项目(IDHT20180509),北京市自然科学基金(KZ2017-10020012)~~

    分类号: Q943.2;S664.2

    DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2018.0385

    页码: 378-386

    总页数: 9

    文件大小: 1424K

    下载量: 381

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