导读:本文包含了转座子论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:座子,转录,玉米,基因,子粒,标记,籽粒。
转座子论文文献综述
雷浩然,张晔[1]（2019）在《想要“高颜值”玉米，来这里找跳跃基因吧》一文中研究指出不知你有没有注意到，从菜市场买回来的玉米，有的是黄灿灿的，有的却像个大花脸，中间夹杂着紫色、白色的玉米粒？其实，这是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活跃的转座子，它们就像一支“小画笔”，跳到哪个基因上，就会抹去那里本来的“颜色”。因此导致籽粒(本文来源于《科技日报》期刊2019-12-11）
宁龙龙,刘佳佳,赵昆昆,李柯,李忠峰[2]（2019）在《利用AhMITE转座子标记鉴定花生F_1代真伪杂种》一文中研究指出本试验以花生品系花7616为父本、H1338为母本杂交得到的F_1代群体为材料,利用AhMITE标记对F_1代真伪杂种进行鉴定。结果表明:F_1代群体78个单株中有8株呈现母本单一条带,50株呈现父本单一条带,20株是双亲杂合带型;结合父母本叶片表型特征,共有20个单株鉴定为真杂种,真杂种率为25.64%,与分子标记鉴定结果一致。综上,利用转座子分子标记可以准确地对杂交后代进行鉴定,进而为高世代RIL群体的构建奠定基础。(本文来源于《山东农业科学》期刊2019年09期）
蒋政勤,周明兵,郑浩,季航,徐芷馨[3]（2019）在《毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定》一文中研究指出长末端重复序列(LTR)反转录转座子广泛存在于植物基因组中,本质是一段可移动的脱氧核糖核酸(DNA)序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录,对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化,克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7。该转座子全长为6 073 bp,属于Ty1-copia家族中的Tork分支,LTR序列相似性为96.7%,插入时间为126.923万a前。对毛竹实生苗分别进行辐照(30, 50, 70 Gy),甲基化抑制剂(50, 100, 150μmol·L-1),高温(42℃),低温(4℃),高盐(0.1, 0.2, 0.3 mol·L~(-1))等5种不同胁迫处理,通过定量荧光聚合酶链式反应(PCR)检测,PHRE7在INT, RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2～0.3 mol·L-1高盐处理下随处理强度的上升而下降,其余所有处理(甲基化抑制剂、高温、低温、高盐0.1～0.2 mol·L~(-1))的表达量都随处理强度呈上升趋势。这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子,且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响,表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化。图7表2参42(本文来源于《浙江农林大学学报》期刊2019年05期）
吴敏芳,刘厚宇,文晓鹏[4]（2019）在《枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列克隆及分析》一文中研究指出为探索枇杷Eriobotrya japonica基因组进化起源和多样性的关系,本文根据Tyl-copia类反转座子反转录酶(Reverse transcriptase,RT)的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,经过克隆、测序及序列分析,获得了59条来源于枇杷的RT序列。通过系统演化分析,所得核苷酸序列可分为4个群组,序列长度变化范围为241～282 bp,同源性范围为30.8%～100%;编码氨基酸中有17条序列出现终止密码子突变;经反转录转座子RT氨基酸序列比对,枇杷与苹果、李、梅等蔷薇科植物亲缘关系较近。因此,枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列具有高度异质性,枇杷与蔷薇科物种间有共同起源,而且Ty1-copia类反转座子不仅可以纵向传递,还可在不同类群间横向传递。(本文来源于《中国南方果树》期刊2019年05期）
安素妨,李保全,鲁丹丹,李高原,侯锦娜[5]（2019）在《MITE转座子在不同甘蓝型油菜品种中的多态性研究》一文中研究指出微型反向重复转座因子(MITE)在真核生物基因组中普遍存在,其活动能够在物种内形成丰富的多态性,在基因组进化和基因调控中均发挥重要作用。该研究利用286对不同MITE家族侧翼序列筛选的特异引物,对101个中国油菜、27个加拿大油菜和29个合成油菜品系(共157个品系)的基因组DNA进行多态性研究,以明确MITE家族的插入/缺失多态性以及在不同油菜品种之间插入的遗传多样性,进而探讨他们之间的亲缘关系。结果显示:(1)286对引物中筛选出60对条带清晰重复性高的多态性引物,多态性比例21.0%;其中Stowaway-like家族和Tourist-like家族特异引物的多态性比例分别为24.6%和20.0%。(2)PCR扩增结果显示,60对多态性引物对中国、加拿大、合成油菜品系的基因组DNA分别扩增出4 029、1 044、1 087条清晰可辨的条带。(3)UPGMA聚类显示,中国油菜品种间遗传相似系数在0.59～0.95,加拿大油菜品种间遗传相似系数在0.73～0.95;合成油菜品种间遗传相似系数值在0.64～0.93。研究表明,MITE在基因组中大量随机插入,形成种内丰富的多态性,利用MITE家族引物检测不同地区的油菜种质资源的多态性,可为油菜的育种找到许多尚未被开发的遗传变异。(本文来源于《西北植物学报》期刊2019年08期）
蒋云峰,王琰,郭祯儒,徐彬杰,朱静[6]（2019）在《Q基因的转座子插入突变导致去驯化过程中普通小麦重获脆穗性》一文中研究指出Q是重要的驯化基因,它控制小麦的脱粒性、穗轴脆性、开花期、穗密度等驯化相关性状。西藏半野生小麦是我国特有的六倍体小麦亚种,其最典型的性状是脆穗。我们前期的研究中已经从西藏半野生小麦中鉴定到3个控制脆穗性状的主效QTL,分别位于2DL、3DS和5AL。本研究通过近等基因系衍生群体对位于5AL的QTL(Qbr.sau-5A)进行精细定位,成功将其定位于0.04 cM的遗传距离范围,对应34 kb的物理区域,最终确认Qbr.sau-5A的效应来源是西藏半野生小麦的Q基因(命名为Q~t)。基因序列分析显示Q的第五外显子有一个161 bp的转座子插入。利用酵母双杂、突变体以及转基因方法证明功能丧失是Q导致西藏半野生小麦脆穗的原因。基于Q基因区域147 kb的捕获测序序列构建聚类树,进一步证明Q~t起源于驯化的Q基因,是普通小麦去驯化的结果。在282份具有脆穗性状的小麦材料中检测Q~t,发现Q~t仅存在于西藏半野生小麦材料中,并受到强烈的选择。综上,本研究解析了一个西藏半野生小麦控制脆穗性状的主效位点Qbr.sau-5A为阐明西藏半野生小麦的起源提供了关键分子证据,为了解作物去驯化提供了新的有价值的案例。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11）
陈伟,许厚强,陈祥,杨涛,吴雨[7]（2019）在《PiggyBac转座子介导关岭牛UCP3基因启动子重组质粒的构建与鉴定》一文中研究指出为了构建以PiggyBac(PB)转座子为载体元件,绿色荧光蛋白(GFP)为报告基因,含UCP3基因启动子的PiggyBac转座子二元系统PB-513B-UCP3,并验证其转座活性,试验采用PCR技术扩增获得UCP3基因启动子,分别通过T4 DNA连接酶与质粒PB-513B-1和pEGFP-N3连接,构建重组质粒PB-513B-1-UCP3和pEGFP-N3-UCP3-pro;用脂质体法将质粒pEGFP-N3、重组质粒pEGFP-N3-UCP3-pro和PB-513B-1-UCP3以及PiggyBac转座子二元系统分别转染至小鼠成肌细胞C2C12中,检测其在小鼠成肌细胞C2C12中的表达情况。结果表明:PCR扩增得到大小为1 080 bp的单一目的条带;经酶切和测序鉴定,成功构建重组质粒PB-513B-1-UCP3和pEGFP-N3-UCP3-pro,PiggyBac转座子二元系统的阳性克隆数明显多于重组质粒PB-513B-1-UCP3和pEGFP-N3-UCP3-pro的克隆数。说明试验成功构建了PiggyBac转座子介导的重组质粒PB-513B-1-UCP3及pEGFP-N3-UCP3-pro,且证实PiggyBac转座子介导的牛UCP3基因启动子在小鼠成肌细胞C2C12中具有较高的转座活性。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年15期）
张迎[8]（2019）在《水稻转座子受驯化选择和在抗病抗逆中的调节功能》一文中研究指出近日,何祖华研究组宣布了一个重大研究结果——发现水稻转座子受驯化选择和在抗病抗逆中的调节功能。该项研究发现自然条件下一个活跃的反转录转座子HUO("活"),该转座子广泛存在于野生稻基因组中,部分存在于考古水稻样本和农家种,但在现代栽培稻中丢失。研究揭示HUO通过表观遗传学途径影响基因组(本文来源于《粮食科技与经济》期刊2019年07期）
李茫茫[9]（2019）在《菊花反转录转座子鉴定及分子标记开发》一文中研究指出菊花(Chrysanthemum×morifolium Ramat)是菊科、菊属多年生草本植物,是中国十大传统名花之一,具有重要的观赏和经济价值。菊花在1600多年的栽培历史中产生了丰富的变异,呈现出千姿百态,菊花变异起源的问题一直是研究者普遍关注的一个重要命题。在一些研究中发现转座子转座可导致物种产生变异,但菊花中还未有相关报道。对菊花转座子进行深入研究,探明其起源与进化的历程,对了解菊花的进化过程及培育新品种材料都有重要的意义。由于菊花基因组比较大、变异性和结构都很复杂,目前对菊花基因组进行全面测序比较困难,没有可供利用的观赏型多倍体基因组序列,这限制了对菊花反转录转座子的深入研究。近年来,随着高通量测序技术快速发展,单分子实时测序技术(该技术能对较长片段进行测序,现已成为全长转录组测序的主要采用方法之一)得以广泛应用。本研究利用该方法对传统菊花品种‘金背大红’进行了全长转录组测序。本研究以测序分析结果为依据,通过信息学分析对全长转录本中的长末端重复反转录转座子(Long terminal repeat,LTR)和微型终端重复反转录转座子(Terminal-repeat retrotransposon,TRIM)进行分析与鉴定,并利用这些序列,建立相应的分子标记技术体系,并分别对103和24种不同菊花品种进行聚类分析,建立相应的分子标记图谱。主要结果如下:(1)通过对传统观赏菊花品种‘金背大红’进行短日照处理使其提前开花,取10个组织部位(根、茎、叶、叶柄、脚芽、侧芽、花蕾、花瓣、花蕊和花托)提取RNA进行全长转录组测序,Zero mode waveguide(ZMW)孔平均单分子比率为62.4%,产生有效数据18.3 Gb,937,088条Circular Consensus Sequence(CCS)序列,平均准确度0.8;经Subreads进行自我纠错后共得到902,490条CCS序列,其中372,712条为全长序列,占CCS总数的41.3%,365,766条为高质量非冗余(Full-length Non-chimeric,FLNC)序列,占CCS总数的40.5%。经过聚类去冗余得到用于后续分析的141,817条FLNC序列。以上数据说明全长转录组测序结果是相对可靠的,可用于构建高品质的菊花参考基因集,并将作为菊花未来生物学研究的宝贵资源。(2)利用在线软件LTR_FINDER(http://tlife.fudan.edu.cn/ltr_finder/)分析测序结果,分析发现:在一定的参数条件下,鉴定到LTR反转录转座子共有274个,分布在转录本5’UTR的有124个,3’UTR有24个,CDS区有126个;最高得分为8,最低得分为5,其中得到LTR相似值为1的有33个。所鉴定的反转录转座子大部分都含有PBS和PPT结构域,但这些反转录转座子在结构上基本都不完整。通过比对基因库,发现这些反转录转座子插入的基因有很多具有重要的功能,例如,RNA聚合酶Ⅱ转录起始因子,不同特异性的脱氢酶,α/β水解酶等。以分析后的反转录转座子的LTR序列设计16条引物,建立菊花的反转录转座子序列间扩增多态(Inter-retrotransposon amplified polymorphism,IRAP)和反转录转座子序列特异扩增多态性(Sequence-specific amplification ploymorphisms,S-SAP)分子标记体系,对103种菊花品进行了遗传多样性研究构建遗传图谱,将103种菊花品种被分为4个大类群。(3)利用在线软件LTR_FINDER(http://tlife.fudan.edu.cn/ltr_finder/)查找TRIM反转录转座子,共得到TRIM反转录转座子309个,其中LTR相似度为1的有56个。在克隆TRIM反转录转座子中发现部分TRIM反转录转座子具有拓扑异构酶结构。以TRIM反转录转座子的LTR区设计引物,建立IRAP和S-SAP分子标记体系,对24种菊花品种进行遗传多样性聚类分析。综上所述:本研究发现LTR反转录转座子274个,TRIM反转录转座子309个,建立IRAP和S-SAP分子标记分析,为菊花遗传育种及分类奠定基础。(本文来源于《河南大学》期刊2019-06-01）
郜宁[10]（2019）在《PiggyBac转座子介导的嵌合抗原受体修饰T细胞（CAR-T）优化试验研究》一文中研究指出背景恶性肿瘤是危害人类健康的最重要疾病之一,对人类的生存造成了极大的危害。近年来,肿瘤的治疗尽管在手术、放疗和化疗等方面取得了很大的进步,但仍然存在着治愈率低、复发率高和药物副作用大等问题。过继免疫治疗(a doptive immunotherapy,AIT)是恶性肿瘤生物治疗的重要方法之一,通过嵌合抗原受体(chimeric antigen receptor,CAR)修饰T细胞的肿瘤过继免疫治疗,是近年来研究的热点,能够重塑T细胞的靶向性、增殖性和持久性,有效地提高其特异杀伤活性~([1-2])。基因转导有许多种方法,例如,γ逆转录病毒载体(Gamma retrovirus,γRV)、腺相关病毒载体、慢病毒载体、转座子及mRNA电穿孔等~([3-4])。目前常用的T细胞基因转导方法是慢病毒、逆转录病毒转染,但其除了转染效率有限之外,逆转录病毒的整合和插入突变可能会产生基因毒性,让人们对它在临床上的应用存在一些担忧~([5-6])。本研究所用的非病毒PiggyBac转座子系统可以通过“切离-粘贴”机制,特异的插入到“TTAA”四碱基位点整合基因,来达到外源基因长期表达的目的~([7])。有实验证明,PiggyBac(PB)转座子,可以成功对人类T细胞进行稳定基因修饰,从而提高T细胞在体内外对肿瘤的杀伤能力~([8])。本研究致力于建立一种基于PiggyBac转座子构建CAR-T细胞的策略,对T细胞进行稳定的基因改造,建立体外激活扩增体系,实现CAR-T细胞优势扩增及CAR在T细胞中的高表达,并保留记忆表型的CAR-T细胞。目的建立一种非病毒的T细胞基因转导及体外激活扩增系统,为CAR-T细胞免疫治疗提供实验基础。方法将CD19CAR表达框(1470bp)克隆入PiggyBac转座子载体PB513B-1的XbaI和EcoRI位点,构建靶向CD19的PiggyBac转座子载体(pb19CAR);DNA酶切电泳、基因测序确认载体构建成功,Western blot检测T细胞中CD19CAR的表达。将pb19CAR转座子和转座酶双质粒,或pb19CAR转座子单质粒经电穿孔仪(1×20ms 830V/840V/850V)和核转仪(U014/T023)转导外周血单个核细胞(PBMC),优化转导程序,比较两种转导装置的转导效率及细胞存活率,并与传统的慢病毒转染方法作对比。用靶抗原CD19蛋白(5μg/ml)和CD3/CD28mAb(5μg/ml)两种包被平板激活、IL-2(500U/ml)和混合细胞因子IL-7(10ng/ml)/IL-15(10ng/ml)/IL-21(20ng/ml)两种扩增方法,比较激活、扩增、CD19CAR表达和CAR-T细胞表型。结果PiggyBac转座子重组载体(pb19CAR)经XbaI和EcoRI双酶切后DNA凝胶电泳和基因测序确认构建成功;Western blot检测结果表明嵌合抗原受体CD19CAR在CAR-T细胞中成功表达。经流式细胞术及细胞活力计数仪检测,电穿孔仪转导效率及细胞活率均高于核转仪(53.2±2.7%和33.5±1.7%,75±3.8%和60±3.0%,均P<0.05);电穿孔仪、核转仪转导效率高于慢病毒转染(25.9±1.3%),而细胞活率低于慢病毒转染(80±2.8%)。电穿孔后激活、扩增培养12天,流式细胞术检测细胞表面CD19CAR表达显示:靶抗原CD19蛋白组明显高于CD3/CD28mAb组(72.5±3.6%和53.7±2.7%,P<0.05);流式细胞术细胞表型分析显示:混合细胞因子组(IL-7/IL-15/IL-21)比IL-2组有更高比例的T_(scm)/T_(scm-like)(24.7±1.2%和12.1±0.6%,P<0.05)、T_(cm)细胞(10.2±0.5%vs2.9±0.1%,P<0.05)。结论1.本研究测试了Celetrix电穿孔仪,Lonza核转仪及传统的慢病毒转染,以Celetrix电穿孔仪的转导效率、细胞活率、转染后细胞活化为佳。并且PiggyBac转座酶对外源目的基因的转座、稳定表达是不可或缺的。2.靶抗原CD19蛋白激活组CAR-T细胞的CD19CAR表达率明显高于CD3/CD28mAb激活组,表明靶抗原CD19蛋白刺激可优势扩增靶向CD19的CAR-T细胞。3.混合细胞因子(IL-7/IL-15/IL-21)支持具有中央记忆和干细胞记忆表型的CAR-T细胞生长。本研究为CAR-T细胞免疫治疗提供实验基础。(本文来源于《郑州大学》期刊2019-05-01）
转座子论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本试验以花生品系花7616为父本、H1338为母本杂交得到的F_1代群体为材料,利用AhMITE标记对F_1代真伪杂种进行鉴定。结果表明:F_1代群体78个单株中有8株呈现母本单一条带,50株呈现父本单一条带,20株是双亲杂合带型;结合父母本叶片表型特征,共有20个单株鉴定为真杂种,真杂种率为25.64%,与分子标记鉴定结果一致。综上,利用转座子分子标记可以准确地对杂交后代进行鉴定,进而为高世代RIL群体的构建奠定基础。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
转座子论文参考文献
[1].雷浩然,张晔.想要“高颜值”玉米，来这里找跳跃基因吧[N].科技日报.2019
[2].宁龙龙,刘佳佳,赵昆昆,李柯,李忠峰.利用AhMITE转座子标记鉴定花生F_1代真伪杂种[J].山东农业科学.2019
[3].蒋政勤,周明兵,郑浩,季航,徐芷馨.毛竹Phyllostachysedulisretrotransposon7(PHRE7)转座子的克隆与鉴定[J].浙江农林大学学报.2019
[4].吴敏芳,刘厚宇,文晓鹏.枇杷Ty1-copia类反转录转座子RT序列克隆及分析[J].中国南方果树.2019
[5].安素妨,李保全,鲁丹丹,李高原,侯锦娜.MITE转座子在不同甘蓝型油菜品种中的多态性研究[J].西北植物学报.2019
[6].蒋云峰,王琰,郭祯儒,徐彬杰,朱静.Q基因的转座子插入突变导致去驯化过程中普通小麦重获脆穗性[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019
[7].陈伟,许厚强,陈祥,杨涛,吴雨.PiggyBac转座子介导关岭牛UCP3基因启动子重组质粒的构建与鉴定[J].黑龙江畜牧兽医.2019
[8].张迎.水稻转座子受驯化选择和在抗病抗逆中的调节功能[J].粮食科技与经济.2019
[9].李茫茫.菊花反转录转座子鉴定及分子标记开发[D].河南大学.2019
[10].郜宁.PiggyBac转座子介导的嵌合抗原受体修饰T细胞（CAR-T）优化试验研究[D].郑州大学.2019
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