论文摘要
Aux/IAA是一种生长素早期响应因子,影响生长素对植物生长发育的调控。烟草作为一种模式植物,在烟草中鉴定Aux/IAA家族基因对于研究生长素调控机制具有重要意义。本研究利用生物信息学方法,从普通烟草基因组中鉴定出77个Aux/IAA家族基因,平均氨基酸数为379,全部为亲水性蛋白,大部分为酸性蛋白。其中46个基因定位到19条连锁群上,分布最多的22号连锁群上有6个基因,其余31个基因位于Scafford上,所有基因均定位于细胞核内。Aux/IAA家族划分为2个类群,10个亚群,包括6对直系同源和40对旁系同源姐妹对,每个亚群中都分布有烟草的Aux/IAA基因。所有的烟草Aux/IAA基因均缺失了结构域Ⅰ,68个基因同时包含Aux/IAA结构域Ⅲ和Ⅳ,21个B6亚组基因包含B3、ARF和Aux/IAA结构域。内含子-外显子结构除了B6亚组基因外,都较为简单。表达模式分析结果显示,不同亚群的基因组织表达特异性不同,同一亚群的基因组织表达特异性一致。Aux/IAA家族基因主要参与细胞组成、蛋白结合、生物进程调节、信号转导、刺激反应、代谢过程等功能。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 王国平,周东洁,牛永志,郑昀晔
关键词: 烟草,生物信息,基因家族
来源: 中国烟草学报 2019年06期
年度: 2019
分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑,基础科学
专业: 生物学
单位: 玉溪中烟种子有限责任公司,云南省烟草农业科学研究院
基金: 中国烟草总公司云南省公司科技计划重点项目(编号：2018530000241035),玉溪中烟种子有限责任公司自立项目(编号：2016ZYZZ04)
分类号: Q943.2
DOI: 10.16472/j.chinatobacco.2019.120
页码: 80-89
总页数: 10
文件大小: 1664K
下载量: 244