导读:本文包含了脂肪酸脱氢酶论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:谷子,膜结合FAD基因,鉴定,进化分析
脂肪酸脱氢酶论文文献综述
李凤,郑汪东,唐文博[1](2019)在《谷子膜结合脂肪酸脱氢酶基因家族的鉴定及进化分析》一文中研究指出以谷子基因组数据库为平台,借用生物信息学手段,对谷子膜结合脂肪酸脱氢酶(FAD)基因家族进行全基因水平上的鉴定及进化分析。结果表明,谷子中含有9个膜结合FAD成员,通过与拟南芥和水稻的膜结合FAD成员一起构建进化树,将其划分成4个亚家族,并发现第一类脱氢酶亚家族的基因在谷子中发生了缺失。此外,谷子膜结合FAD中各个亚家族的基因结构表现出一定的保守性,并且这种保守与其进化关系高度吻合;谷子中仅发现1对膜结合FAD复制基因SiFAD3.1/SiFAD3.2,且该次基因复制事件属于片段复制。研究结果可为谷子膜结合FAD家族的鉴定及分子进化研究提供重要的理论依据。(本文来源于《山西农业科学》期刊2019年07期)
赵彤彤[2](2019)在《植物乳杆菌p-8羟基脂肪酸脱氢酶的原核异源表达与生物信息学分析及其酶学性质研究》一文中研究指出共轭亚油酸(Conjugated linoleic acid,CLA)是具有共轭双键的十八碳二烯酸,具有抗癌、抗动脉粥样硬化和降脂等生理功效。植物乳杆菌可以转化亚油酸(Linoleic acid,LA)生成CLA,此过程需要脂肪酸水合酶(Fatty acid hydratase,CLA-HY)、羟基脂肪酸脱氢酶(Hydroxy fatty acid dehydrogenase,CLA-DH)和乙酰乙酸脱羧酶(Acetoacetate decarboxylase,CLA-DC)共同参与。所以,CLA-DH 是酶法生产 CLA的瓶颈之一。本实验对植物乳杆菌p-8的CLA-DH进行了基因克隆、原核表达、生物信息学分析和酶学性质研究,得到以下结果:(1)以植物乳杆菌p-8的基因组为模板扩增出CLA-DH,构建pET-28a-CLA-DH,转化入E.col Trans1-T1,经菌落PCR、酶切和序列分析说明原核表达载体构建成功。(2)通过对CLA-DH的生物信息学分析发现,CLA-DH为同亚基六聚体,属于典型的SDR超家族成员,具有Rossman折迭的典型保守结构,其N端存在辅酶结合位点的特征序列G-x-x-x-G-x-G,在140~160位氨基酸残基之间存在保守的催化活性位点的特征序列S-xn-Y-x-x-x-K。CLA-DH含286个氨基酸,是稳定的水溶性的胞质蛋白,无跨膜区和信号肽。其分子质量为32.0918 kDa,等电点为5.15,不稳定指数为25.53,平均亲水性(GRAVY)为-0.179。(3)将pET-28a-CLA-DH转化入E.coli Transetta(DE3),经IPTG诱导表达,Western Blot证明重组酶CLA-DH成功表达。(4)为提高可溶性CLA-DH的表达量,研究了诱导温度、诱导剂浓度和诱导时间对可溶性CLA-DH的表达量的影响,结果表明在诱导温度为16℃,IPTG终浓度为0.5 mmol/L,诱导时间为12 h的条件下可溶性CLA-DH的表达量最高。(5)对CLA-DH进行纯化浓缩,得到电泳均一性和含量较高的CLA-DH。以蓖麻油酸为底物对其酶学性质进行研究,发现CLA-DH最适温度为45℃,在20℃能保持一定的稳定性。最适pH为6~7,在此范围内稳定性较好。Mg2+、Mn2+、Fe3+可以提高酶活力,Cu2+、Zn2+、Fe2+会抑制酶活力,Vmax是1.04μmol/L·min,Km值是6.72 mmol/L,kcat 值是 3.3 6 min-1。(本文来源于《内蒙古农业大学》期刊2019-06-01)
张加强,刘慧春,朱开元,周江华,谭晨[3](2019)在《油用牡丹脂肪酸脱氢酶基因FAD3密码子偏好性分析》一文中研究指出本研究以油用牡丹的脂肪酸脱氢酶FAD3基因为研究对象,运用Codon W和CUSPS等研究FAD3基因的密码子使用偏好性及组成特征。研究表明,油用牡丹FAD3基因的ENc值为55.58,该基因密码子选择偏性较弱,GC含量为0.457,密码子第3位碱基的GC含量为0.420,油用牡丹FAD3基因有18个偏好使用的密码子,其中约72.22%(13个)的密码子以A/T结尾;聚类结果分析表明,基于FAD3基因密码子相对使用度RSCU和CDS序列的分类结果一致,均能将单子叶植物和双子叶植物区分开;与大肠杆菌、酵母、拟南芥和烟草的基因组密码子使用偏好性比较,油用牡丹与烟草基因组密码子的使用偏性更为接近,烟草更适合作为FAD3转基因的受体。本研究结果为FAD3基因选择适合的受体和提高该基因的表达水平提供参考依据。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年17期)
赵彤彤,赵微,王丹,赵国芬,刘扬[4](2019)在《植物乳杆菌P-8羟基脂肪酸脱氢酶的克隆表达及活性鉴定》一文中研究指出以植物乳杆菌P-8的基因组DNA为模板扩增出其羟基脂肪酸脱氢酶基因,对其进行生物信息学分析,结果表明该基因共编码286个氨基酸,蛋白质理论分子质量约为32 k Da,理论等电点为5. 15,不含跨膜区,是1个亲水性的细胞质蛋白。Ser、Thr、Tyr磷酸化位点个数分别为3、3、7。蛋白质的二级结构主要构成方式为α螺旋、无规则卷曲和β折叠。将此基因连接到p ET-28a(+)质粒载体中构建重组质粒p ET28a-DH,并转化入大肠杆菌E. coli Transetta (DE3)中获得重组大肠杆菌。重组菌在16℃条件下,经0. 1 mmol/L IPTG诱导16 h有可溶性表达,经Western Blot验证确定为重组羟基脂肪酸脱氢酶。通过镍柱亲和层析,得到纯化的重组酶。重组酶经初步活性检测,结果显示重组酶可以转化10-羟基-顺-12-十八碳烯酸为10-氧代-顺-12-十八碳烯酸,本研究为进一步探明植物乳杆菌P-8转化共轭亚油酸的机制奠定了基础。(本文来源于《食品与发酵工业》期刊2019年01期)
李丹丹,王庆,胡博,张慧慧,吴卫[5](2018)在《低温对红花脂肪酸组成和脂肪酸脱氢酶基因表达的影响》一文中研究指出为探测低温对红花微粒体和质体脂肪酸脱氢酶的影响,本研究分别采用GC-MS和RT-PCR测定了低温条件下两种基因型红花材料苗期不同组织部位脂肪酸含量和ω-6和ω-3基因的表达水平变化。研究发现,低温不同程度地提高了两种红花材料组织中不饱和脂肪酸的相对百分含量,但不同基因型红花材料的不同组织部位对低温响应情况有所不同,总体上PI470942材料根对低温不敏感,而叶片对低温较为敏感,而PI544021材料叶片对低温不敏感,茎对低温较敏感。此外,低温对不同材料脂肪酸脱氢酶基因表达及对同一基因型红花材料的不同组织部位的相关基因表达情况的影响均有较大差异。低温显着促进了PI470942材料叶片脂肪酸脱氢酶基因的表达,而对根中脂肪酸脱氢酶基因变化影响不显着,而低温显着促进了PI544021材料根中脂肪酸脱氢酶基因的表达,而对叶片影响较小。另外,低温对脂肪酸含量的调节既有转录水平又有转录后水平,且这种调节具有组织差异性。低温主要在转录水平上调节根和叶片中脂肪酸含量变化,而主要在转录后水平上调节茎中脂肪酸含量变化。本研究为进一步探究低温对脂肪酸脱氢酶的调控情况提供了参考。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年16期)
汪企再[6](2018)在《亚甲基四氢叶酸脱氢酶对高山被孢霉脂肪酸合成的调控作用》一文中研究指出多不饱和脂肪酸(PUFAs)具有重要的生理功能,可以用来预防和治疗各种慢性疾病。高山被孢霉(Mortierella alpina)能够从头合成多种PUFAs,但脂肪酸产量达到瓶颈,急需解析脂肪酸合成机理,对高山被孢霉进行定向分子改造。NADPH可为脂肪酸合成提供还原力,传统来源主要包含6-磷酸葡萄糖脱氢酶(6PGD)、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)、苹果酸酶(ME)和异柠檬酸脱氢酶(IDH)。近年来,细胞和动物水平的研究发现,叶酸代谢途径中的亚甲基四氢叶酸脱氢酶(MTHFD)可将5,10-亚甲基-四氢叶酸(5,10-CH_2-THF)转化为5,10-甲炔基-四氢叶酸(5,10-CH-THF),此过程伴随着NADPH的生成,是细胞NADPH池的重要组成部分,因此MTHFD在脂肪酸合成中可能具有重要作用。基因组分析表明高山被孢霉中存在MTHFD1和MTHFDL两种亚甲基四氢叶酸脱氢酶,本文通过在高山被孢霉体内对MTHFD1和MTHFDL进行基因操作,首次在分子水平上证明了MTHFD1和MTHFDL在高山被孢霉脂肪酸合成中具有关键作用,并初步研究了MTHFD1和MTHFDL对脂肪酸合成还原力的调控机制,从而为对高山被孢霉进行分子改造,进而重构高山被孢霉脂肪酸代谢通路提供理论依据。主要研究结果如下:首先,通过构建过表达MTHFD1基因重组高山被孢霉(MA-MTHFD1),发现与原养型高山被孢霉相比,MA-MTHFD1菌株中总脂肪酸含量增加了40.1%,其中花生四烯酸(AA)相对含量增加了91.1%,这表明过表达MTHFD1基因显着提高了高山被孢霉内总脂肪酸含量和不饱和度。其次,通过构建过表达和RNA干扰MTHFDL基因重组高山被孢霉(MA-MTHFDL和MA-MTHFDLSilent),发现与原养型高山被孢霉相比,MA-MTHFDL菌株中总脂肪酸含量增加了35.6%,其中AA相对含量增加了80.8%,这表明过表达MTHFDL基因显着提高了高山被孢霉内总脂肪酸的含量和不饱和度;MA-MTHFDLSilent菌株中总脂肪酸含量下降了45.0%,这表明RNA干扰MTHFDL基因显着降低了高山被孢霉内总脂肪酸含量。最后,通过对NADPH水平和产NADPH相关基因表达水平分析,结果表明MA-MTHFD1和MA-MTHFDL中NADPH含量分别增加了26.4%和32.4%,MA-MTHFDLSilent中NADPH含量下降了19.0%;进一步分析发现,在高山被孢霉中,过表达MTHFD1基因和MTHFDL基因后,相关产NADPH基因的转录水平也发生显着性上调,这表明过表达MTHFD1和MTHFDL增强了脂肪酸合成所需还原力NADPH来源;RNA干扰MTHFDL基因后,相关产NADPH基因的转录水平发生显着性下调,这表明干扰MTHFDL降低了脂肪酸合成所需还原力NADPH来源。综上所述,高山被孢霉叶酸代谢途径中的MTHFD1基因和MTHFDL基因在脂肪酸合成所需还原力NADPH合成调控中起重要作用。(本文来源于《江南大学》期刊2018-06-01)
裴友财[7](2018)在《大豆EMS诱变群体M2代主要品质性状遗传分析及脂肪酸脱氢酶FAD2相关SNP标记的开发》一文中研究指出大豆起源于中国,已有5000多年的栽培历史。大豆种子含有丰富的蛋白质和脂肪,同时也是食用油和种子蛋白的主要来源之一。大豆脂肪以不饱和脂肪酸为主,约占总脂肪酸总量80.00%-90.00%。脂肪酸的组成分别包括:亚油酸占41.00%-62.00%,油酸占12.40%-39.00%,软脂酸占10.00%-14.00%,亚麻酸占5.00%-14.70%,硬脂酸占1.63%-5.43%。大豆脂肪酸配比和组成成分也直接影响大豆油脂的营养价值并且对贮运加工等环节产生重要的影响,已成为决定大豆油脂品质的最重要因素,所以提高脂肪含量成为大豆品质育种的重要内容。本研究利用EMS诱变技术成功获得一批高蛋白,高脂肪,高油酸、亚油酸及低亚麻酸的大豆种质资源,一方面为东北大豆乃至我国大豆油脂品质的改良提供了新的种质资源,另一方面为更好的开展大豆相关功能基因的研究奠定前期基础。同时研究根据突变体的表型信息,以大豆高低亚油酸突变体及野生型亲本为材料,成功克隆了GmFAD2-1A/2A/1B基因,并针对GmFAD2-2A基因的突变位点,开发SNP标记,初步评价了其准确性。主要研究结果如下:1.确定了EMS最佳诱变条件。研究以大豆“吉农18”为材料,设置不同EMS浓度(0.3%、0.5%、0.7%、0.9%)和不同处理时间(2h、4h、6h)的12个处理及对照,以半数致死量作为敏感性指标,确定最佳诱变条件为EMS浓度0.5%,处理时间6h。2.大豆EMS诱变群体M_2代主要品质性状遗传分析。从变异系数分析,M_2代油酸、亚麻酸、硬脂酸的变异系数比较大;M_2代各性状的广义遗传力以亚油酸、亚麻酸和棕榈酸较高,脂肪和硬脂酸相对较低。主要品质性状的相关性分析结果表明,油酸与棕榈酸呈显着正相关,油酸与亚油酸、亚麻酸呈显着负相关,亚麻酸与亚油酸呈显着正相关。3.获得一批大豆脂肪酸突变体资源。研究初步筛选获得561株大豆M_3代脂肪酸突变体,其中包括高油突变体110份,高亚油酸突变体150份,低亚油酸突变体55份,高亚麻酸突变体35份,低亚麻酸突变体55份,高硬脂酸突变体34份,低硬脂酸突变体21份,高棕榈酸突变体36份,低棕榈酸突变体65份。4.初步确定了3个GmFAD2基因突变位点。用DNAMAN6.0软件分别对高亚油酸突变体、低亚油酸突变体及其野生型亲本GmFAD2-1A/2A/1B基因的测序结果进行比对,结果发现在大豆低亚油酸突变体(2017MT52)中分离得到的GmFAD2-1A基因,在其起始密码子后+928bp和+1037bp处分别存在一个碱基位点的突变(G→A);分离得到的GmFAD2-2A基因,在其起始密码子后+521bp处存在一个碱基位点的突变(G→A),产生终止密码子,使翻译提前终止;分离得到的GmFAD2-1B基因,在其起始密码子后+247bp和+1978bp处分别存在一个碱基位点的突变(G→A)。在大豆高亚油酸突变体(2017MT71)中分离得到的GmFAD2-1A基因,在起始密码子后+574bp处存在一个碱基位点变突(G→A);分离得到的GmFAD2-2A基因,在其起始密码子后+407bp处存在一个碱基位点的突变(G→A);分离得到的GmFAD2-1B基因分别在起始密码子后+318bp处和+507bp处存在一个碱基位点的突变(T→C),在+1096bp处和+1635bp处存在一个碱基位点的突变(G→A)。5.开发了1个基于PCR的SNP标记。研究以大豆低亚油酸突变体为材料,经过多轮筛选最终获得了1组最为理想的特异性引物:FAD2-2A-R2。针对GmFAD2-2A基因筛选到的SNP特异性引物,通过PCR产物直接测序方法检测突变大豆材料SNP位点基因型。将测序方法获得的结果与利用SNP标记鉴定的结果进行一致性比较,结果显示,特异性引物FAD2-2A-R2检测结果与测序结果一致,说明我们开发的这个SNP标记是准确的。(本文来源于《吉林农业大学》期刊2018-05-01)
贾雪琦,左永春[8](2018)在《大豆ω-3和ω-6脂肪酸脱氢酶基因密码子优化》一文中研究指出DHA和EPA对心脑血管疾病以及癌症等疾病的防治有着重要的作用,其中ω-3和ω-6脂肪酸脱氢酶是合成多不饱和脂肪酸DHA和EPA过程中的两个关键的去不饱和酶,由于缺乏这两种酶的基因,高等动物无法自发合成多不饱和脂肪酸,为了得到可以生产多不饱和脂肪酸的转基因动物,本研究计划将大豆的这两个去饱和脂肪酸作为目的基因,但由于不同物种之间的密码子使用具有偏爱性,会严重影响到目的基因在宿主体内的表达水平,为了解决这一问题,提高目的基因在宿主体内的表达水平,同时采用Jcat在线软件和手动替换密码子两种方法对大豆的ω-3和ω-6脂肪酸脱氢酶基因进行了优化,然后选出最优的优化方法,为后期进一步的实验提供目的基因。最后本文预测了两种优化结果的RNA二级结构和CAI、CBI、Nc值和GC含量,比较得出手动替换的结果优于在线优化的结果。(本文来源于《生物信息学》期刊2018年01期)
温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元[9](2017)在《‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析》一文中研究指出植物中的Δ12脂肪酸脱氢酶(FAD2)是油酸形成亚油酸的关键酶。通过NCBI和EXPASY 2大数据库,采用Signal P、TMHMM、Psort、Prot Param和Target P等分析程序对花生品种‘航花2号’及其它物种的19个FAD2蛋白序列进行分析,利用MEGA6.0软件比对序列及构建系统进化树阐明FAD2基因的系统发育关系,亲缘相近的FAD2蛋白聚在一起。预测了‘航花2号’和‘粤油13’的FAD2蛋白的分子质量、等电点、信号肽、跨膜和保守结构域等。结果表明:‘航花2号’FAD2蛋白的N端没有信号肽,预测定位在微体、细胞质、线粒体基质和叶绿体类囊膜中,而C端信号基序LKGL使得FAD2蛋白选择性地结合和嵌入内质网,植物的FAD2蛋白普遍有3个高度保守的组氨酸富集基序(HECGHH、HRRHH和H[A/C/T]HH)和3~5个跨膜结构,但分析结果显示,‘航花2号’的FAD2蛋白的H[A/C/T]HH的组氨酸基序是缺失的,而油酸转化为亚油酸的效率上并没有显着变化,为将来FAD2基因的基因工程操作提供一定的理论基础。(本文来源于《热带农业科学》期刊2017年09期)
于海彦,周志峰,贾俊强,桂仲争[10](2017)在《家蚕类ω3-脂肪酸脱氢酶基因的克隆、表达及功能研究》一文中研究指出ω3-脂肪酸脱氢酶是生物体内催化多不饱和脂肪酸合成的关键酶之一,其表达受生物胁迫和非生物胁迫因素的影响。从家蚕蛹中克隆了类ω3-脂肪酸脱氢酶基因(Bm FAD3-like),该基因具有一个长度为1 083 bp的开放阅读框,编码由360个氨基酸残基组成的分子质量为41.5 k D的蛋白质。将该基因克隆到p YES2.0载体,构建重组表达载体p YBm FAD3-like及重组酿酒酵母工程菌株YBm FAD3-like后进行诱导表达,收集菌体提取脂肪酸,经气相色谱检测表明异源表达的重组Bm FAD3-like能够将诱导表达体系中加入的外源底物亚油酸(LA)转化为α-亚麻酸(ALA)。半定量RT-PCR检测Bm FAD3-like基因mRNA几乎在家蚕5龄第3天幼虫的所有组织中都有转录,在5龄幼虫期、蛹期和蛾期的转录水平较高,并且其转录水平受低温(0℃)和真菌(球孢白僵菌Beauveria bassiana)侵染(6~36 h)诱导显着上调。对家蚕蛹体注射siRNA沉默目的基因12~72 h后,Bm FAD3-like mRNA转录水平显着下调。研究结果表明,Bm FAD3-like的表达产物能催化LA在ω3位脱氢生成ALA,并且该基因在蚕体受到低温诱导和真菌侵染等胁迫时显着上调表达,外源siRNA能够介导该基因的沉默,显着下调其转录水平。(本文来源于《蚕业科学》期刊2017年04期)
脂肪酸脱氢酶论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
共轭亚油酸(Conjugated linoleic acid,CLA)是具有共轭双键的十八碳二烯酸,具有抗癌、抗动脉粥样硬化和降脂等生理功效。植物乳杆菌可以转化亚油酸(Linoleic acid,LA)生成CLA,此过程需要脂肪酸水合酶(Fatty acid hydratase,CLA-HY)、羟基脂肪酸脱氢酶(Hydroxy fatty acid dehydrogenase,CLA-DH)和乙酰乙酸脱羧酶(Acetoacetate decarboxylase,CLA-DC)共同参与。所以,CLA-DH 是酶法生产 CLA的瓶颈之一。本实验对植物乳杆菌p-8的CLA-DH进行了基因克隆、原核表达、生物信息学分析和酶学性质研究,得到以下结果:(1)以植物乳杆菌p-8的基因组为模板扩增出CLA-DH,构建pET-28a-CLA-DH,转化入E.col Trans1-T1,经菌落PCR、酶切和序列分析说明原核表达载体构建成功。(2)通过对CLA-DH的生物信息学分析发现,CLA-DH为同亚基六聚体,属于典型的SDR超家族成员,具有Rossman折迭的典型保守结构,其N端存在辅酶结合位点的特征序列G-x-x-x-G-x-G,在140~160位氨基酸残基之间存在保守的催化活性位点的特征序列S-xn-Y-x-x-x-K。CLA-DH含286个氨基酸,是稳定的水溶性的胞质蛋白,无跨膜区和信号肽。其分子质量为32.0918 kDa,等电点为5.15,不稳定指数为25.53,平均亲水性(GRAVY)为-0.179。(3)将pET-28a-CLA-DH转化入E.coli Transetta(DE3),经IPTG诱导表达,Western Blot证明重组酶CLA-DH成功表达。(4)为提高可溶性CLA-DH的表达量,研究了诱导温度、诱导剂浓度和诱导时间对可溶性CLA-DH的表达量的影响,结果表明在诱导温度为16℃,IPTG终浓度为0.5 mmol/L,诱导时间为12 h的条件下可溶性CLA-DH的表达量最高。(5)对CLA-DH进行纯化浓缩,得到电泳均一性和含量较高的CLA-DH。以蓖麻油酸为底物对其酶学性质进行研究,发现CLA-DH最适温度为45℃,在20℃能保持一定的稳定性。最适pH为6~7,在此范围内稳定性较好。Mg2+、Mn2+、Fe3+可以提高酶活力,Cu2+、Zn2+、Fe2+会抑制酶活力,Vmax是1.04μmol/L·min,Km值是6.72 mmol/L,kcat 值是 3.3 6 min-1。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
脂肪酸脱氢酶论文参考文献
[1].李凤,郑汪东,唐文博.谷子膜结合脂肪酸脱氢酶基因家族的鉴定及进化分析[J].山西农业科学.2019
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[9].温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元.‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析[J].热带农业科学.2017
[10].于海彦,周志峰,贾俊强,桂仲争.家蚕类ω3-脂肪酸脱氢酶基因的克隆、表达及功能研究[J].蚕业科学.2017