基于组稀疏先验知识的激发荧光断层成像方法研究

基于组稀疏先验知识的激发荧光断层成像方法研究

论文摘要

分子影像(Molecular Imaging,MI)是一种新兴的特异性成像技术。相比于传统的医学影像技术,分子影像结合了现代分子生物学技术,能够在细胞分子层面上对成像对象进行无侵入式的连续动态观测,目前已经广泛的应用于疾病诊疗、药物研发以及手术导航等多个领域。其中,以光作为成像媒介的光学分子影像技术由于其安全无辐射,成本低,灵敏度高等优点在过去十几年中取得了飞速的发展。作为光学分子影像的重要组成部分,激发荧光断层成像(Fluorescence Molecular Tomography,FMT)能够对生物体内特定的细胞分子进行三维空间观测。近年来,虽然FMT从算法到应用都获得了快速的发展,但由于重建模型及生物组织复杂性等原因,FMT的重建性能仍有待提高。本文针对如何提高FMT的成像效果及如何实现荧光光源形态学重建进行了研究,提出了基于组稀疏(Group Sparsity)先验知识的激发荧光断层成像重建模型,并根据该模型提出了基于L2,1范数正则化的组稀疏重建方法和基于融合LASSO的组稀疏重建方法。另一方面,为进一步验证组稀疏模型相对于传统稀疏模型的优势,本文提出了基于主加速近端梯度的稀疏重建方法,进一步提高了基于L1范数的激发荧光断层成像方法的重建精度及鲁棒性,并将该方法与基于L2,1范数正则化的组稀疏重建方法进行比较,更进一步的验证组稀疏先验知识在FMT重建中的效果。本文主要研究内容包含以下几点:1.提出了基于组稀疏(Group Sparsity)先验知识的激发荧光断层成像重建模型。在FMT重建中,荧光光源具有特殊结构特性,具体表现为:1.荧光光源相对于整个重建区域来说是稀疏的;2.荧光光源内部是紧密耦合在一起并具有相同的光强值。因此,我们认为荧光光源区域可以作为一个整体参与模型的构建,因此具有组稀疏特性。利用组稀疏先验知识,既保证了重建结果的稀疏性,能够精确地定位肿瘤,提高重建效率,又使重建结果具有分段常数的特性,从而可以更加准确地重建出肿瘤的形态。2.提出基于L2,1范数正则化的组稀疏重建方法,该方法通过在目标函数中引入L2,1范数正则化项,能够实现目标变量的组选择能力,使重建结果不至于过度收敛,保证重建区域的边界信息,从而实现FMT的形态学重建。数值仿真以及在体实验表明基于L2,1范数的FMT重建方法较传统的基于L2范数、L1范数方法可以有效提高定位精度和鲁棒性,并且在荧光光源形态学重建上有较大提升。3.提出了基于融合拉索(Fused LASSO Method,FLM)的组稀疏重建方法,该方法在目标函数中加入融合LASSO惩罚项,既保证了重建结果的稀疏性,能够精确地定位肿瘤,又使重建结果具有分段常数的特性,从而可以更加准确地重建出肿瘤的形态。数值仿真和肝原位瘤在体实验证明该方法较传统Tikhonov正则化方法和迭代收缩方法具有较好的重建精度和较高的重建效率,并且在肿瘤形态学重建上较传统算法有较大优势。4.提出了一种基于主加速近端梯度的稀疏重建方法。该方法对L1范数正则化问题进行求解,利用当前及前一次的迭代结果得到搜索点s,然后利用L1正则化映射得到最优解,从而更加快速、准确的得到最优解,增强了重建结果的鲁棒性,提高了重建精度,并将该方法与基于L2,1范数正则化的组稀疏重建方法进行比较,更进一步的验证组稀疏先验知识在FMT重建中的效果。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 引言
  •   1.1 研究背景及意义
  •   1.2 光学分子影像概述
  •   1.3 激发荧光断层成像研究进展
  •     1.3.1 激发荧光断层成像系统研究进展
  •     1.3.2 激发荧光断层成像方法研究进展
  •   1.4 本文主要工作及论文框架
  • 2 多模态激发荧光断层成像系统
  •   2.1 引言
  •   2.2 多模态激发荧光断层成像系统架构及工作流程
  •   2.3 基于有限元方法的激发荧光断层成像前向问题求解
  •     2.3.1 光在生物组织中的传输模型
  •     2.3.2 基于有限元方法的前向问题求解
  •   2.4 基于组稀疏先验知识的激发荧光断层成像逆向问题求解
  •   2.5 本章小结
  • 2,1范数正则化的组稀疏重建方法研究'>3 基于L2,1范数正则化的组稀疏重建方法研究
  •   3.1 引言
  • 2,1范数正则化的组稀疏重建方法'>  3.2 基于L2,1范数正则化的组稀疏重建方法
  •   3.3 光源定位实验验证及结果分析
  •     3.3.1 收敛性分析
  •     3.3.2 数值仿真实验
  •     3.3.3 生物在体实验
  •   3.4 形态学重建实验验证及结果分析
  •     3.4.1 数值仿真实验
  •     3.4.2 生物在体实验
  •   3.5 本章小结
  • 4 基于融合拉索的组稀疏重建方法研究
  •   4.1 引言
  •   4.2 基于融合拉索的组稀疏重建方法
  •   4.3 实验验证及结果分析
  •     4.3.1 数值仿真实验
  •     4.3.2 生物在体实验
  •   4.4 本章小结
  • 5 基于主加速近端梯度的稀疏重建方法研究
  •   5.1 引言
  •   5.2 基于L1-PAPG的稀疏重建方法
  •   5.3 实验验证及结果分析
  •     5.3.1 数值仿真实验
  •     5.3.2 物理仿体实验
  •     5.3.3 生物在体实验
  •   5.4 本章小结
  • 6 结论
  •   6.1 工作总结
  •   6.2 工作展望
  • 参考文献
  • 作者简历及攻读博士学位期间取得的研究成果
  • 学位论文数据集
  • 文章来源

    类型: 博士论文

    作者: 蒋仕新

    导师: 刘杰

    关键词: 光学分子影像,激发荧光断层成像,组稀疏,范数重建方法,融合拉索方法,主加速近端梯度法

    来源: 北京交通大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学,信息科技

    专业: 生物学,计算机软件及计算机应用

    单位: 北京交通大学

    分类号: TP391.41;Q-334

    总页数: 117

    文件大小: 10599K

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