植物miR399家族分子特征及靶基因功能分析

论文摘要

为研究植物miR399家族成员构成、分子特征及其靶基因功能,利用生物信息学方法对植物miR399家族成员数量、系统进化、二级结构、启动子特征及靶基因功能进行分析。共获得244个成熟miR399成员,仅分布在被子植物中,不同物种中pre-miR399和miR399的数量分布差异较大;大多数pre-miR399仅剪切为单个成熟miR399,数量最多的pre-miR399长度为64 nt,93.85%的成熟miR399序列长度为21 nt;pre-miR399序列分析显示,3′端保守性高于5′端,且大部分成熟miR399序列来源于3′端,保守序列为UGCCAAAGGAGA*UUGCCC*G;进化分析显示,miR399序列一致性较高,但不同种属间聚类关系较复杂;植物pre-miR399主要分为3种类型:①产生1条成熟miR399,且位于pre-miR399的3′端;②产生2条成熟miR399,分别位于pre-miR399的3′端和5′端;③产生1条成熟miR399,且位于pre-miR399的5′端;pre-miR399启动子区含有大量激素和胁迫响应元件;水稻miR399家族靶基因本体分析显示,细胞组分分类中的细胞和细胞部分类别占比均为59.1%,分子功能分类中的催化活性和结合类型占比分别为40.9%和45.5%,miR399调控了多个磷响应和磷转运靶基因,这些基因主要参与了植物磷代谢、应激响应、基因表达调控等多项进程。研究表明,miR399在植物进化过程中高度保守,能够响应多种不同信号,其参与了植物的多种生命过程,尤其在植物磷饥饿胁迫和磷转运中发挥重要作用。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 刘潮,褚洪龙,韩利红,代冬琴,陈欢欢,唐利洲

关键词: 进化,靶基因,磷胁迫

来源: 华北农学报 2019年02期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心

基金: 国家自然科学基金项目(31760013,31460561,31860005,31860057,31860620),云南省地方本科高校基础研究联合专项(2017FH001-034,2017FH001-037),国家级大学生创新创业训练计划项目(201610684004,201710684012)

分类号: Q943.2

页码: 1-7

总页数: 7

文件大小: 3219K

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标签：进化论文;  靶基因论文;  磷胁迫论文;