基于整合网络分析柿蒂治疗顽固性呃逆的药效物质基础及作用机制

基于整合网络分析柿蒂治疗顽固性呃逆的药效物质基础及作用机制

论文摘要

目的:整合多元网络分析柿蒂治疗顽固性呃逆的药效物质基础及作用机制。方法:检索中国知网、万方、PubMed和TCMSP等数据库获取柿蒂中的化合物,采用Targetnet数据库对化合物进行潜在靶点预测,将靶点导入CTD数据库获得对应疾病,采用在线分析数据库DAVID对靶点进行基因功能及通路富集分析。最后以Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,靶点-疾病网络。提取度值较高的靶点和化合物及通路,构建"核心化合物-核心靶点-信号通路"核心网络。结果:本研究共收集柿蒂中22个化合物,可作用于77个靶点。通过多元及核心网络分析,柿蒂中的化合物可通过作用于PTPN1、ALOX15、BCL2A1、MIF、ESR2、DNMT1、TLR9等关键靶点,进一步调节Bile secretion pathway、Ovarian steroidogenesis pathway,Steroid hormone biosynthesis pathway等信号通路来发挥治疗各种疾病引起的顽固性呃逆。结论:本研究体现了柿蒂多化合物、多靶点、多途径的作用规律,为深入开展柿蒂治疗顽固性呃逆的作用机制研究提供新的依据。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 软件和数据库
  •   1.2 柿蒂中化合物的收集
  •   1.3 柿蒂化合物潜在靶点预测
  •   1.4 化合物-靶点网络构建与分析
  •   1.5 靶点-疾病网络构建与分析
  •   1.6 靶点蛋白的基因功能通路分析
  •   1.7 核心化合物-核心靶点-信号通路整合网络分析
  • 2 结果
  •   2.1 柿蒂中化合物的收集
  •   2.2 化合物-靶点的网络分析
  •   2.3 靶点-疾病网络分析
  •   2.4 GO生物进程分析
  •   2.5 KEGG通路富集分析
  •   2.6 核心化合物-核心靶点-信号通路整合网络分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 刘方,陈宽,段灿灿,晏仁义,李晓飞,张建永

    关键词: 柿蒂,顽固性呃逆,网络药理学,核心网络,作用机制

    来源: 中药材 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 中药学

    单位: 遵义医学院基础医学院,遵义医学院药学院,遵义医学院基础药理教育部重点实验室暨特色民族药教育部国际合作联合实验室

    基金: 国家自然科学基金(81803838,81760746),贵州省教育厅科技拔尖人才(黔教合KY字[2017]078),贵州省药学国内一流学科建设(YLXKJS-YS-05)

    分类号: R285.5

    DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2019.09.034

    页码: 2133-2141

    总页数: 9

    文件大小: 493K

    下载量: 150

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