43种植物CaM1基因密码子使用特征及遗传差异分析

论文摘要

为深入了解不同类植物CaM1基因(calmodulin 1,简称CaM1)在抵抗逆境进化过程所形成的密码子的使用特征和遗传差异。运用CodonW、BioEdit和MEGA软件对43种植物序列进行分析,并构建系统发育树。结果表明,CaM1基因对密码子的使用具有极强的偏好性,CUC、AUC、UCU、CCA、ACU、UGA为其最优密码子,禾本目植物更偏好使用G/C碱基。G、C碱基含量和位置是引起CaM1基因密码子偏性的主要原因。遗传距离分析表明,山柑目与白花菜目之间的亲缘关系最近,豆目和无患子目间的亲缘关系次之,与聚类分析结果相符。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 李晨辉,赵子捷,陈文烨,焦义然,杨帆,刘永伟,董福双,杜进民,周硕

关键词: 密码子偏性,遗传距离,亲缘关系

来源: 江苏农业科学 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 山西农业大学信息学院,河北科技大学生物科学与工程学院,河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心

基金: 国家自然科学基金青年科学基金(编号:31600216),河北省自然科学基金青年基金(编号:C2017301066),河北省现代农业创新工程项目(编号:2019-4-8)

分类号: Q943

DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.05.008

页码: 28-32

总页数: 5

文件大小: 162K

下载量: 90

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标签：密码子偏性论文;  遗传距离论文;  亲缘关系论文;