导读:本文包含了兼并引物论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:引物,逆转录,基因组,信息学,抑制,常规,分子。
兼并引物论文文献综述
朱晓静,戴忠敏[1]（2015）在《利用抑制性PCR提高兼并引物扩增效率及特异性》一文中研究指出为提高兼并引物PCR的特异性和扩增效率,改进了兼并引物的设计,在兼并引物上加入接头序列,使其延长,并利用该方法成功获得了一个新的聚酮类合成酶的基因片段,表明抑制性PCR能够提高兼并引物扩增的效率及特异性.(本文来源于《杭州师范大学学报(自然科学版)》期刊2015年06期）
李志强,何德,李翠新[2]（2015）在《基于兼并引物的PCR扩增特定基因的效果比较》一文中研究指出根据NCBI上的DNA拓扑异构酶Ⅱ基因序列设计兼并引物,采用常规PCR、降落PCR、巢式PCR叁种方法扩增糙皮侧耳和阿魏侧耳的拓扑异构酶Ⅱ部分基因序列,比较叁种方法扩增效果的特异性、灵敏度.结果表明,巢式PCR的灵敏度和特异性都优于常规PCR和降落PCR,并且巢式PCR的灵敏度是常规PCR灵敏度的100倍以上,更加适合兼并引物扩增.这对利用兼并引物获取特异基因具有指导意义.(本文来源于《湖北民族学院学报(自然科学版)》期刊2015年02期）
李晓霞,邱玉玉,于爱莲,柴同杰,王海荣[3]（2009）在《应用兼并引物RT-PCR快速检测及鉴别气载鸡新城疫病毒》一文中研究指出为了快速检测并鉴别鸡舍内外空气中的新城疫病毒(NDV),应用AGI-30气体收集器在一大型商品肉鸡舍舍内外收集气体,同时采集鸡的气管和泄殖腔拭子,采用兼并引物RT-PCR检测气体样品和拭子中的NDV,并鉴别NDV的毒力;同时分离、纯化气体样品中的NDV,用常规毒力学试验鉴别分离株的毒力。结果RT-PCR检测到舍内2/15的气体样品和4/15的拭子中同时有强毒和弱毒株,3/15气体样品和13/15的拭子只有弱毒;舍外上风向5 m处气体样品检测结果均为阴性,舍外下风向5 m处1/3的样品只有弱毒;其他样品均为阴性;从RT-PCR检测为阳性的样品中分离到3株强毒和4株弱毒株;从RT-PCR检测为阴性的样品中均未分离到NDV。结果表明兼并引物RT-PCR可直接、快速对气体样品进行检测及鉴别诊断。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2009年07期）
周光涛[4]（2007）在《M.xanthus DK1622基因组序列分析及新型随机兼并引物数据库的构建》一文中研究指出本文工作的主要内容包括两部分：粘细菌Myxococcus xanthus DK1622基因组序列分析和新型随机兼并(arbitrary degenerated，AD)引物数据库(AD Primer Database for Microbes，ADDB)的构建。微生物基因组的序列分析需要借助于生物信息学技术，生物信息学技术大致可以分两个层次：数据管理和数据分析。数据管理是指通过数据库技术来有效地管理生物数据，本文将介绍一系列的生物学数据库。数据分析是指通过统计学、计算机技术从海量的生物数据中挖掘出信息和知识。对于微生物基因组序列分析，包括单个基因组序列分析和比较基因组分析。单个基因组序列分析主要包括基因组注释，以及基因组组分分析，如GC含量分析、GC skew分析和密码子偏好性分析。在基因组比较分析中，不仅包括基本的基因组特征比较，还包括分子系统发生分析的内容，即对序列进行相似性比较，以推测序列间的亲缘关系，从而构建进化树。2003年11月，TIGR公布的黄色粘球菌DK1622(Myxococcus xanthus DK1622)基因组序列不含有注释信息，为了在重要功能基因的研究中抢占先机，我们对其进行了注释工作并做了相应的基因组序列分析，以此搭建微生物基因组序列的分析平台。我们用Glimmer程序对DK1622的分析结果是查找到9314个ORF，并通过本地blast以及模式查找对ORF进行功能注释。在所有预测出的ORF中，去除了彼此之间有重迭的、短于90个氨基酸残基且功能未知的，以及一些移码的ORFs，从最初预测的9314个ORF中确定了7885个。从这7885个ORF中还可挑选出某些功能基因做下一步的研究。另外，我们对DK1622在全基因组范围内做了GC含量的分析，找到了8个特异区域。DK1622全基因组的GC skew图非常对称的，这与它的复制方式有关。我们还对DK1622所有预测的基因做了密码子偏好性分析，得到了DK1622的最优密码子集。从分析中可以大致看出DK1622是一种密码子偏好性很强的菌种，而且功能越重要的基因密码子偏好性越强。TAIL PCR是一种利用引物的热不对称性来分离已知序列侧翼未知序列的重要方法，由于其操作简单，高效灵敏等诸多优点，目前已被广泛使用。TAIL PCR中，随机兼并(AD)引物起了关键性的作用。现有的AD引物主要是靠经验摸索而来，广泛应用于动植物，对于基因组GC含量分布广、碱基组成差异大的微生物的效率较低。为了提高TAIL PCR在微生物中的效率，规范AD引物的设计思路，我们在进行微生物基因组序列分析过程中，提出新型AD引物的设计思路。我们将AD引物分成3个部分，每一部分都是从在基因组中的高频率出现的寡核苷酸中挑选出来的，3个部分要满足Tm值限制、结构限制和碱基分布限制叁大限制条件，然后才将其组装起来。我们根据301个已测序微生物基因组序列设计出301套相应的AD引物，并构建了相应的微生物AD引物数据库(ADDB)。每套AD引物都可应用于亲缘关系较近或GC含量相近的菌株。根据已测序的Myxococcus xanthus DK1622基因组设计的一套AD引物，用于Myxococcus fulvus strain HW-1(同属)，Sorangium spp(近缘)和Streptomyces griseus(GC含量相近)的TAIL PCR，已被验证效率很高。根据已测序的Pseudomonas aeruginosa PAO1基因组设计的AD引物，用于一株未知的Pseudomonas spp，已被验证高效。该工作的完成不仅提供了AD引物设计的新思路、新方法，更极大简化了相关研究中繁琐、盲目的引物筛选工作，从而有效解决了TAIL PCR在微生物中的应用瓶颈。不足之处是数据库的冗余度偏高，且缺乏足够多的实验证据。(本文来源于《山东大学》期刊2007-05-15）
兼并引物论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
根据NCBI上的DNA拓扑异构酶Ⅱ基因序列设计兼并引物,采用常规PCR、降落PCR、巢式PCR叁种方法扩增糙皮侧耳和阿魏侧耳的拓扑异构酶Ⅱ部分基因序列,比较叁种方法扩增效果的特异性、灵敏度.结果表明,巢式PCR的灵敏度和特异性都优于常规PCR和降落PCR,并且巢式PCR的灵敏度是常规PCR灵敏度的100倍以上,更加适合兼并引物扩增.这对利用兼并引物获取特异基因具有指导意义.
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
兼并引物论文参考文献
[1].朱晓静,戴忠敏.利用抑制性PCR提高兼并引物扩增效率及特异性[J].杭州师范大学学报(自然科学版).2015
[2].李志强,何德,李翠新.基于兼并引物的PCR扩增特定基因的效果比较[J].湖北民族学院学报(自然科学版).2015
[3].李晓霞,邱玉玉,于爱莲,柴同杰,王海荣.应用兼并引物RT-PCR快速检测及鉴别气载鸡新城疫病毒[J].畜牧兽医学报.2009
[4].周光涛.M.xanthusDK1622基因组序列分析及新型随机兼并引物数据库的构建[D].山东大学.2007
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