特异性引物鉴定论文_徐鹏昊,罗武松,何恩明,王焱磊,蔡枫

导读:本文包含了特异性引物鉴定论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:引物,特异性,鉴定,多态性,基因,苹果酸,石斛。

特异性引物鉴定论文文献综述

徐鹏昊,罗武松,何恩明,王焱磊,蔡枫[1](2018)在《16S rDNA特异性引物设计优化及其在淞江鲈体表微生物鉴定中的应用》一文中研究指出引物与模板的结合特异性是PCR反应成功与否的主要决定因素之一.在进行以16srDNA为目标序列的菌种鉴定或者各种检测应用中,对引物的特异性具有较普遍的要求.需扩增出完整的目标属,实现属内保守,同时避免有效扩增其他属的相应序列即实现属间特异.对此,我们对引物设计进行优化,通过分析所有已知细菌16srDNA序列,针对特定目标属筛选特异和最高效的引物对,并在淞江鲈的体表菌群样品中进行验证实验.结果表明,所设计的引物具有较好的属内保守性和特异性,而且引物在扩增中的效率也有一定的保证,能够很好地应用于菌群的定量PCR分析.(本文来源于《复旦学报(自然科学版)》期刊2018年01期)

陈蓉,吴成丽,邓赟,卞金辉[2](2015)在《适用于不同产地半夏药材的特异性引物PCR鉴定分析方法》一文中研究指出目的:通过特异性引物PCR技术,建立不同产地半夏药材通用的聚合酶链式反应(PCR)鉴别法。方法:提取不同产地半夏药材的基因组DNA,利用特异性引物对基因组DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳对扩增结果进行分析。结果:所设计的引物能够特异性地扩增出半夏的目的DNA,并适用于全国9个主要不同产地半夏药材的检测。结论:该方法具有较强的特异性和普适性,适用于半夏药材的真伪性鉴别。(本文来源于《中药与临床》期刊2015年06期)

赵文秀,潘迎捷,王锡昌,王霞,赵勇[3](2011)在《基于黄姑鱼物种特异性引物的PCR技术对鱼糜制品中黄姑鱼成分的鉴定和追溯》一文中研究指出DNA溯源是食品质量安全管理控制的新兴有效手段之一。为了建立对海产品中黄姑鱼DNA的特异性检测,进而对黄姑鱼鱼丸加工过程直至消费者食用后的黄姑鱼成分进行鉴定及溯源的目的。本研究采集市售鱼丸中常用原料作为试验对象提取基因组DNA。从GenBank数据库下载四种海水鱼、叁种淡水鱼、两种禽畜肉以及两种植物的线粒体12S rDNA基因序列,通过比较和优化条件,设计出一对针对黄姑鱼的特异性PCR引物。运用该对引物对黄姑鱼鱼丸加工的各个阶段进行PCR检测,都得到了193bp的目标片段,且所设计的引物可以检出黄姑鱼比例仅占0.5%的鱼糜混合物,结果表明此对引物对黄姑鱼DNA鉴定具有很高的特异性和灵敏度,从而达到了对黄姑鱼进行特异性分子追溯的目的 。(本文来源于《渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集》期刊2011-11-15)

潘渠,杨维华,王颖,余小平,陈恬[4](2011)在《设计乳杆菌特异性引物并运用菌落PCR技术快速检出和鉴定四川泡菜中的乳杆菌》一文中研究指出乳杆菌(Lactobacillus)是益生菌,也是当前的研究热点之一。研究泡菜等样品中的乳杆菌需要快速的检出方法。根据已完成全基因组测序的14种乳杆菌的16S rDNA序列,设计一对乳杆菌特异性引物。PCR检测结果表明该引物对乳杆菌和明串珠菌能扩增出800 bp的片段,对表皮葡萄球菌、乳酸乳球菌和枯草芽胞杆菌却没有扩增条带,具有一定的乳杆菌特异性。结合MRS乳杆菌半选择培养基和革兰氏染色,运用菌落PCR技术,可以快速高效地检出四川泡菜中的乳杆菌。再通过对PCR扩增片段测序,可以将乳杆菌鉴定到种。从16份四川泡菜样品中检出了15株乳杆菌,其中14株被鉴定为植物乳杆菌,1株需进一步鉴定才能确定种。该方法可以检出乳杆菌新种。(本文来源于《微生物学通报》期刊2011年08期)

职晓阳,杨玲玲,王芸,唐蜀昆,娄恺[5](2008)在《涅斯捷连科氏菌特异性引物PCR分子鉴定(英文)》一文中研究指出涅斯捷连科氏菌属的建立基于对 Micrococcus halobius 的再分类,这是一类广泛分布于高盐土壤环境的革兰氏阳性细菌,属放线菌类。在对我国西部盐湖环境放线菌的生物多样性及分类学研究中,大量类似菌株被分离。【目的】为了对其进行快速鉴定,特别是筛选出属于优势类群的涅斯捷连科氏菌,【方法】本研究根据前人以报道的方法设计了一对针对其16S rRNA 基因的特异性PCR 引物(Nes1/Nes2),【结果】并通过部分典型菌和野生菌株的PCR实验验证,结合16S rRNA基因的测序验证,证明了Nes1/Nes2 的 PCR 反应有效性及其对涅斯捷连科氏菌的特异性。【结论】利用该引物可以快速准确的对涅斯捷连科氏菌进行鉴定。(本文来源于《微生物学报》期刊2008年05期)

王东[6](2008)在《利用特异性S2-R2引物鉴定动物组织、人石蜡切片和临床皮损中的孢子丝菌》一文中研究指出申克氏孢子丝菌是孢子丝菌病的致病菌,主要引起皮肤,皮下组织和附近淋巴系统的亚急性和慢性感染,偶尔可以播散至骨骼和内脏,甚至诱发全身的播散性感染。本病在我国东北较为多发,可在流行区成批发生,危害人民健康。目前该病的诊断较为困难。真菌培养,不仅耗时(约一周),且阳性率不高;组织病理为非特异性肉芽肿性炎症,组织内病原学诊断仍只限于HE和PAS染色,但因菌量少,常规组织学方法很难发现。近年来,学者们在该病的诊断研究中进行了多方面的探索,包括血清学检测、免疫荧光抗体、免疫病理及电镜技术。血清学检测因特异性问题而未能延续;免疫荧光抗体与免疫病理技术的应用,虽然提高了诊断速度,却因抗体不易标准化、病理存在非特异染色等问题而限制其应用;电镜由于操作复杂,视野小很难发现病原菌而无法推广。我们课题组曾以50株不同地区来源的孢子丝菌临床分离株及标准株的基因组DNA作为研究样本,以毛霉、烟曲霉、念珠菌临床分离菌株基因组DNA作为对照,通过特异引物PCR扩增的方法筛选国内外文献中报道的4对孢子丝菌引物S2-R2、SSHF31-SSHR97、ITS3-SSP、SS3-SS4结果表明针对几丁质合成酶基因Ⅰ的引物S2-R2最特异且敏感。目的:本研究将以感染孢子丝菌的动物模型为研究样本,进一步对4对引物进行筛选,并将获得的特异而又敏感的引物用于石蜡切片及临床活检标本的孢子丝菌检测,以达到从基因水平对孢子丝菌病进行准确、快速诊断的目的,为尽早治疗提供依据,也可减少因误诊误治而造成的损失。材料和方法:(1)12只小鼠随机分成试验及对照组,实验组皮内注射孢子丝菌菌悬液,并于不同时间留取皮损组织,分别进行真菌培养和皮损组织DNA提取,PCR扩增。比较不同引物的敏感性和特异性。(2)取30例大连及10例长春地区临床疑诊孢子丝菌病、组织病理示感染性肉芽肿的石蜡切片标本,采用改良的微波脱蜡、液氮研磨-CTAB破壁法提取孢子丝菌DNA,以我们筛选获得的孢子丝菌特异而又敏感的S2-R2引物进行PCR扩增,扩增产物于1%琼脂糖凝胶中电泳,紫外灯下观察,与真菌培养的结果进行比对。(3)10例临床疑诊孢子丝菌病患者,在病理活检时获取0.4×0.8CM2皮损,平分皮损组织分别用于传统的真菌学鉴定(真菌培养,组织病理)及PCR检测。皮损经钝刀去除杂质后匀浆,离心取下层沉淀,以微量提取法(液氮研磨--CTAB法)提取其中的真菌DNA,以特异性S2-R2作为引物,进行PCR扩增,产物于1%琼脂糖凝胶中电泳,紫外灯下观察。结果:1.4对引物S2-R2,SSHF31-SSHR97,ITS3-SSP,SS3-SS4在感染孢子丝菌的小鼠皮损中均可扩增出目的条带,但引物SSHF31-SSHR97所需浓度较高,与在体外培养条件下筛试的结果相同,引物S2-R2为最敏感和特异的引物。2.30例初诊疑是孢子丝菌病的石蜡标本中PCR扩增阳性为22例,阳性率为73.33%。真菌培养阳性为22例。在22例真菌培养阳性的标本中有20例PCR出现阳性条带,阳性率为91%。8例真菌培养为阴性的标本中有2例PCR出现阳性条带,阳性率为25%。10例长春地区的标本中PCR阳性为7例,阳性率为70%。毛霉、烟曲霉、念珠菌病石蜡切片各1例的PCR扩增结果均阴性。3.10例临床疑似孢子丝菌病患者的组织标本分别取自躯干(5例),腕部(3例),面部(1例),眼睑(1例)。新鲜组织真菌培养9例阳性。菌落3-10天长出。10例标本提取基因组DNA,应用引物S2-R2进行PCR扩增所得结果9例阳性,与真菌培养的复合率为100%。结论:1.以感染孢子丝菌的小鼠模型为研究样本筛选孢子丝菌特异引物,结果与在体外菌纯培养菌株筛选所得结果相同,针对几丁质合成酶基因1的引物S2-R2为最特异、最敏感的引物。2.与传统方法相比,改良的微波脱蜡、液氮研磨-CTAB破壁法可以从存档的石蜡包埋组织中提取足量、高质量的孢子丝菌DNA。从而提高了PCR反应的阳性率。3.应用特异性S2-R2引物检测石蜡切片中的孢子丝菌阳性率可高达91%。对培养阴性的标本也能检出,阳性率为25%。该方法不仅可利用实验室保存的大量石蜡切片进行科研和临床回顾性诊断。同时也可作为疑难病的诊断和鉴别诊断依据。4.应用特异性S2-R2引物检测临床新鲜活检组织中的孢子丝菌,以真菌培养为参照,阳性率可达100%。该方法具有操作简单,经济省时,敏感特异性好,准确可靠等优点,适用于孢子丝菌病的快速诊断。(本文来源于《大连医科大学》期刊2008-04-01)

王淑秀,张艳芳,杨献军,秦川,杨瑞[7](2007)在《序列特异性引物多聚酶链反应方法进行大样本多基因的多态性鉴定(英文)》一文中研究指出目的建立多个基因同时进行多态性分析的序列特异性引物多聚酶链反应(PCR-SSP)方法,以满足其在临床检验中进行基因多态性鉴定时的应用。方法应用优化后的PCR-SSP的方法分析以下基因的多态性:TNF-α-308A/G和-238G/A变异、IL-6-174G/C变异、CYP2D6*10B外显子第188位的C/T变异。结果应用同一个PCR扩增程序,可同时对多个基因、多个临床样本的基因多态性同时进行分析,基因型清晰,而且基因分型快速、准确。结论优化后的PCR-SSP适合对大样本、多个基因的单核苷酸位点变异进行多态性分析,值得在临床检验的应用中推广。(本文来源于《新乡医学院学报》期刊2007年04期)

顾慧芬,庄意丽,梅其春[8](2007)在《铁皮石斛试管苗的RAPD分析及其特异性鉴定引物设计》一文中研究指出为了能方便快捷地鉴别出铁皮石斛试管苗和铁皮石斛,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对铁皮石斛试管苗及石斛属23个种进行了基因组DNA多态性分析,从中找出铁皮石斛试管苗特征性条带进行克隆和测序,并根据测序结果设计了特异性引物.采用此特异性引物对铁皮石斛试管苗及石斛属其他一些种进行扩增,结果表明,铁皮石斛试管苗与各地产野生铁皮石斛出现同一特征条带,而石斛属其他种未出现该条带.(本文来源于《复旦学报(自然科学版)》期刊2007年03期)

杨瑞,王淑秀,秦川,杨献军[9](2007)在《用序列特异性引物多聚酶链反应的方法进行大样本、多基因的多态性鉴定》一文中研究指出目的:建立多个基因同时进行多态性分析的序列特异性引物多聚酶链反应的方法,以满足其在临床检验中进行基因多态性鉴定时的应用。方法:实验于2005-10/2006-05于河南省新乡医学院分子生物研究室完成。进行临床普通血液常规检测的患者血样200份(由新乡医学院第叁附属医院提供),采用临床血样,提取DNA后采用多聚酶链反应扩增,并以扩增后的样品进行琼脂糖凝胶电泳,以是否出现相应的扩增条带作为基因分型的标准。应用优化后的序列特异性引物多聚酶链反应的方法分析以下基因的多态性:肿瘤坏死因子α-308A/G和-238G/A变异、白细胞介素6-174G/C变异、细胞色素P4502D6(CYP2D6)*10B外显子第188位的C/T变异。并由此优化序列特异性引物多聚酶链反应的方法,以达到应用同一个多聚酶链反应扩增程序,可同时对多个基因、多个临床样本的基因多态性同时进行分析,且基因型清晰,分型快速、准确。结果:①用20 g/L的琼脂糖凝胶电泳可看到每泳道内可有2条或1条扩增产物,其中阳性对照β珠蛋白基因的扩增片段长268 bp,此条带可以出现、减弱或者不出现。②其中肿瘤坏死因子α-308A/G存在G/G和A/G两种基因型;肿瘤坏死因子α-238G/A位点可检测到的基因型有G/A、G/G和A/A3型;白细胞介素6-174G/C变异位点可检测到的基因型均为G/G纯合子;细胞色素P4502D6*10B外显子第188位的C/T位点可检测到的基因型为C/C、C/T、T/T3型。结论:优化后的序列特异性引物多聚酶链反应适合对大样本,多个基因的单核苷酸位点变异进行多态性分析,快速、准确、成本低。(本文来源于《中国组织工程研究与临床康复》期刊2007年02期)

刘延琳,蒋思欣,李华[10](2006)在《用苹果酸通透酶基因的特异性引物进行酒酒球菌快速鉴定(英文)》一文中研究指出以Oenococcus oeni苹果酸通透酶基因为目标基因,设计了1对特异性引物PmlepL/PmlepR进行酒酒球菌的快速鉴定研究。结果表明,直接以O.oeni的菌落为模板,通过PmlepL/PmlepR引物的PCR扩增,可得到苹果酸通透酶基因的特异性条带;用此特异性引物进行供试乳酸菌的PCR鉴定,所有O.oeni菌系均得到特异性条带,而供试的其他种类乳酸菌未扩增出目标带。引物PmlepL/PmlepR可用于O.oeni的快速PCR鉴定。(本文来源于《西北农林科技大学学报(自然科学版)》期刊2006年09期)

特异性引物鉴定论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

目的:通过特异性引物PCR技术,建立不同产地半夏药材通用的聚合酶链式反应(PCR)鉴别法。方法:提取不同产地半夏药材的基因组DNA,利用特异性引物对基因组DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳对扩增结果进行分析。结果:所设计的引物能够特异性地扩增出半夏的目的DNA,并适用于全国9个主要不同产地半夏药材的检测。结论:该方法具有较强的特异性和普适性,适用于半夏药材的真伪性鉴别。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

特异性引物鉴定论文参考文献

[1].徐鹏昊,罗武松,何恩明,王焱磊,蔡枫.16SrDNA特异性引物设计优化及其在淞江鲈体表微生物鉴定中的应用[J].复旦学报(自然科学版).2018

[2].陈蓉,吴成丽,邓赟,卞金辉.适用于不同产地半夏药材的特异性引物PCR鉴定分析方法[J].中药与临床.2015

[3].赵文秀,潘迎捷,王锡昌,王霞,赵勇.基于黄姑鱼物种特异性引物的PCR技术对鱼糜制品中黄姑鱼成分的鉴定和追溯[C].渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集.2011

[4].潘渠,杨维华,王颖,余小平,陈恬.设计乳杆菌特异性引物并运用菌落PCR技术快速检出和鉴定四川泡菜中的乳杆菌[J].微生物学通报.2011

[5].职晓阳,杨玲玲,王芸,唐蜀昆,娄恺.涅斯捷连科氏菌特异性引物PCR分子鉴定(英文)[J].微生物学报.2008

[6].王东.利用特异性S2-R2引物鉴定动物组织、人石蜡切片和临床皮损中的孢子丝菌[D].大连医科大学.2008

[7].王淑秀,张艳芳,杨献军,秦川,杨瑞.序列特异性引物多聚酶链反应方法进行大样本多基因的多态性鉴定(英文)[J].新乡医学院学报.2007

[8].顾慧芬,庄意丽,梅其春.铁皮石斛试管苗的RAPD分析及其特异性鉴定引物设计[J].复旦学报(自然科学版).2007

[9].杨瑞,王淑秀,秦川,杨献军.用序列特异性引物多聚酶链反应的方法进行大样本、多基因的多态性鉴定[J].中国组织工程研究与临床康复.2007

[10].刘延琳,蒋思欣,李华.用苹果酸通透酶基因的特异性引物进行酒酒球菌快速鉴定(英文)[J].西北农林科技大学学报(自然科学版).2006

论文知识图

基因特异性目的片断基因抗干涉片段TOPO扩增M:DL20...一28特异性引物鉴定重组杆粒Fig....3-4035S启动子特异性引物鉴特异性引物鉴定TAIL-PCR产物用特异性引物鉴定菌株RCOL一l

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