簸箕柳AP2/ERF家族基因的全基因组分析

论文摘要

为了研究簸箕柳AP2/ERF转录因子家族的成员和分类,及后续深入探究其在簸箕柳生长发育过程中的功能,本文基于簸箕柳基因组数据,利用生物信息学技术和方法,对簸箕柳的AP2/ERF家族基因进行鉴定、分类及染色体定位,并对其理化性质、基因结构、保守结构域、表达模式等进行分析.结果表明,簸箕柳含有178个AP2/ERF家族基因,并根据AP2/ERF保守域的数量与拟南芥AP2/ERF家族基因的进化关系将其划分成AP2、ERF、RAV和Soloist亚家族4类.此外组织表达模式分析结果显示,簸箕柳AP2/ERF家族基因的表达具有明显的组织特异性,且在leaf、root、shoot、flower中表达较强,在其他组织中表达较弱.

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 田应明,王皆恒,沈方圆,李校

关键词: 簸箕柳,转录因子,生物信息学,表达模式

来源: 四川大学学报(自然科学版) 2019年05期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 四川大学生命科学学院四川省分子生物与生物技术重点实验室

基金: 国家自然科学基金(61001149)

分类号: Q943.2

页码: 983-988

总页数: 6

文件大小: 2058K

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标签：簸箕柳论文;  转录因子论文;  生物信息学论文;  表达模式论文;