导读:本文包含了错义突变论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:突变,基因,基因突变,微管,系谱,血友病,家系。
错义突变论文文献综述
吕永楠,王京伟[1]（2019）在《NEBL基因错义突变导致扩张型心肌病一家系研究》一文中研究指出扩张型心肌病是与基因突变密切相关的一类心肌病,文章通过对1例诊断为扩张型心肌病患者及其家系进行基因筛查,寻找可能的致病基因。详细询问先证者及其家属成员病史,并进行体格检查、血液指标、心脏超声和心电图检查。对患者的病史、家族史及检查结果进行分析。对先证者候选致病基因全外显子高通量测序,发现先证者(Ⅲ1)、父亲(Ⅱ2)和母亲(Ⅱ3)携带NEBL基因c.1286C>T(p.Ser429Leu)错义突变。先证者临床症状为心功能不全,而其父母无明显临床症状,心脏超声检查无异常。NEBL基因突变与扩张型心肌病密切相关,对于筛查扩张型心肌病致病基因具有重要意义。(本文来源于《疑难病杂志》期刊2019年11期）
王京伟,李艳,乔斌,熊亮[2]（2019）在《凝血因子Ⅸ基因新发错义突变致乙型血友病一例家系分析》一文中研究指出目的:分析一例乙型血友病(HemophiliaB,HB)家系的遗传学病因。方法:采用凝固法检测先证者及其家系成员凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血酶时间(APTT)、凝血酶时间(TT),免疫比浊法检测D-二聚体浓度;采用血液分析仪检测血红蛋白(Hb)含量,发色底物法检测凝血因子Ⅸ(F9)活性,采用PCR-Sanger测序法分析HB的关键致病基因F9基因序列并进行突变分析。结果:先证者Hb含量降低,凝血功能示APTT延长,D-二聚体增高,F9活性明显下降;先证者母亲及女儿APTT及F9活性分别有不同程度的延长和降低,其父亲、妹妹和哥哥的APTT及F9活性正常。测序结果显示该家系先证者携带F9基因半合子错义突变c.289T>G(p.Cys97Gly),为首次发现的变异位点,先证者母亲及女儿各携带杂合突变。结论:F9基因第4外显子c.289T>G(p.Cys97Gly)半合子变异可能为HB致病性变异。(本文来源于《微循环学杂志》期刊2019年04期）
彭玲,陈婷,吴补领[3]（2019）在《DSP错义突变(G>A)导致非综合征型先天缺牙的功能研究》一文中研究指出目的:目前已知有许多基因能导致先天缺牙的发生,但DSP突变还未被报道与非综合征型先天缺牙有关。本研究旨对DSP突变进行体内外功能研究,探讨该基因在非综合征先天缺牙中的分子发病机制。方法:本课题组在前期工作中采集了一个25人的非综合征型先天性缺牙家系,排除已经报道的基因后通过全外显子测序发现DSP (Desmoplakin)存在错义突变。构建pRIES-EGFPDSP-Mut载体,采用双荧光素酶报告实验检测DSP突变对Wnt/β-catenin通路的影响。合成针对斑马鱼DSP同源基因的morpholino oligonucleotides;通过显微注射将其导入斑马鱼的受精卵,茜素红染色观察第六天有无牙齿缺失情况。使用整体原位杂交技术分析斑马鱼同源基因dspa基因敲降后对斑马鱼早期发育相关基因dlx2b、bmp2a和pitx2表达的影响。结果:双荧光素酶实验结果表明DSP突变后TCF/TEF的转录活性下降,β-catenin及其下游蛋白Cyclin D1的表达量均出现明显下调。斑马鱼在注射morpholino后第六天实验组出现牙齿有4-6颗的缺失。原位杂交结果显示dspa的缺失负性调控dlx2b、bmp2a和pitx2的表达。结论:DSP突变可能是导致非综合征先天缺牙的重要原因,其分子机制可能与Wnt/β-catenin通路有关。(本文来源于《2019年中华口腔医学会老年口腔医学专业委员会第十四次全国老年口腔医学学术年会论文汇编》期刊2019-10-15）
吕昕,王红艳,张斌[4]（2019）在《TGFBR3错义突变与先天性心脏病遗传关联性研究》一文中研究指出目的在先天性心脏病(CHD)人群中检测TGFBR3基因编码区的疾病特异性错义突变,并研究突变的生物学功能。方法①研究对象为中国山东地区的汉族人群。病例组为2008年8月至2011年1月连续就诊的404例散发CHD患儿;对照组为同时期收集的排除CHD以及有心脏病家族史的213例体检健康儿童。②提取样本外周血基因组DNA,进行TGFBR3基因外显子靶向测序。测序获得的病例组特异的单核苷酸变异(SNV)与数据库db SNP(version137)和千人基因组比对,筛选出疾病特异性稀有或新发突变,行Sanger测序验证。③构建野生型和突变型TGFBR3表达载体,在HEK293T细胞中表达后用免疫印迹检测外源TGFBR3蛋白水平,并用荧光素酶报告基因检测突变对TGF-β信号通路的影响。结果分别于3个CHD患儿中筛选得到3个CHD特异性的TGFBR3新发/稀有杂合突变,其中TGFBR3K685R为新发现的突变;TGFBR3A791V和TGFBR3A804S为稀有突变,并被SIFT和PolyPhen-2软件预测为有害突变。3个被突变的氨基酸都位于TGFBR3蛋白的高度保守区。功能分析实验显示,TGFBR3K685R和TGFBR3A804S突变导致TGFBR3蛋白表达水平显着降低,而且3个突变均导致TGFBR3蛋白对参与心脏发育重要信号通路TGF-β信号通路的抑制作用显著降低。结论突变TGFBR3K685R、TGFBR3A791V和TGFBR3A804S可能通过降低TGFBR3对TGF-β信号通路的抑制作用,参与先天性心脏病的发生。(本文来源于《中国循证儿科杂志》期刊2019年04期）
汤斌,周鹏,李斌,何娜[5]（2019）在《叁种生物信息学软件对癫痫相关SCN1B错义突变的预测性能评估》一文中研究指出目的使用叁种生物信息学软件(MutPred2、 PROVEAN和SNAP2)对癫痫相关SCN1B基因错义突变的预测性能进行评估。方法从HGMD数据库收集22个具有明确致病性的错义突变作为阳性组,从dbSNP和ExAC数据库收集136个无疾病表型报道的错义突变作为阴性组,评估叁种软件的预测性能。结果从准确率、特异度、 PPV、 NPV、 MCC值和AUC值指标进行评估,排名依次均为PROVEAN、 SNAP2、 MutPred2。PROVEAN软件阳性判断的阈值为-2.5,位于SCN1B错义突变阳性组和阴性组预测分值的中位数(-3.199～-2.026)之间。结论叁种软件在使用不同指标参数进行评估时的性能有所不同,其中PROVEAN软件综合多个指标参数对SCN1B基因错义突变的预测性能最佳。(本文来源于《临床医学工程》期刊2019年06期）
郭芮吉,韩刚,方霞,孙滨,崔恒庆[6]（2019）在《GNAS新错义突变导致D/E型短指畸形》一文中研究指出目的对我国一个短指家系进行致病基因进行鉴定。方法应用全外显子测序对该短指家系进行基因突变检测,并用Sanger测序对突变位点进行验证。结果该家系共有3名患者,均为短指表型,符合常染色体显性遗传。全外显子检测提示患者均存在GNAS基因(NM_001077488:exon13:c.A1145T:p.D382V)杂合错义突变,Sanger测序验证与全外显子结果一致。结论 GNAS基因第13号外显子上c.A1145T杂合错义突变是该短指家系的致病原因。(本文来源于《组织工程与重建外科杂志》期刊2019年03期）
朱丽青,张海月,罗莎莎,方薇薇,刘斯奇[7]（2019）在《一种新型纤维蛋白原β链错义突变导致的遗传性低纤维蛋白原血症》一文中研究指出目的:对临床发现的1例遗传性低纤维蛋白原血症进行基因及表型分析,探讨其分子发病机制。方法:采集先证者及其家系成员共2代6人的外周血,采用STAGO自动化血凝仪检测凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血活酶时间(APTT)、凝血酶时间(TT)、D-D二聚体(D-D)和纤维蛋白降解产物(FDPs);凝血酶凝固法(Clauss法)与免疫比浊法分别测定血浆纤维蛋白原活性(Fg:C)和抗原水平(Fg:Ag)。PCR扩增纤维蛋白原FGA、FGB和FGG基因的所有外显子和侧翼序列,PCR产物纯化后直接测序进行基因分析。分别用Swiss-PDViewer、在线分析系统对突变蛋白的结构、突变位点的保守性进行预测分析。结果:先证者PT和TT均延长,Fg:C(0.82 g/L)和Fg:Ag(1.19 g/L)明显降低;基因分析发现先证者FGB基因存在c.425T>G杂合突变,导致纤维蛋白原Bβ链上121位亮氨酸突变为精氨酸(Leu121Arg)。其父亲及儿子也存在该突变位点。蛋白模型分析显示Leu121突变为Arg121后,氨基酸极性发生改变,并且新增与Try117、Met118、Trp125之间的氢键;蛋白同源性分析显示:Leu121在脊椎动物间有较高的保守性。结论:纤维蛋白原Bβ链Leu121Arg杂合突变是引起该家系遗传性低纤维蛋白原血症的主要原因。(本文来源于《温州医科大学学报》期刊2019年05期）
高云轻,欧俐羽,李亚勤,利婧,林金福[8]（2019）在《DMD基因新发错义突变致Becker型肌营养不良症一家系临床表型及基因突变分析》一文中研究指出目的总结DMD基因新发错义突变导致的Becker型肌营养不良症一家系临床表型及基因突变特点。方法与结果采用第二代测序技术对1例25岁男性Becker型肌营养不良症患者进行基因检测,Sanger测序进一步验证患者之母和妹DMD基因c.4449T> G(p.Asn1483Lys)位点,并结合患者及其家族成员的临床资料进行分析。结果显示,患者及其两位舅父具有相同的临床表型,双小腿肌肉呈假性肥大,双下肢近端肌萎缩和肌无力,血清肌酸激酶水平升高。患者基因检测DMD基因外显子34c.4449T> G(p.Asn1483Lys)为错义突变,经检索为新发突变,其母和妹为携带者,结合患者两位舅父临床表现,确诊为Becker型肌营养不良症,该家系为Becker型肌营养不良症家系且存在该基因突变位点的共分离现象。结论 DMD基因外显子34 c.4449T> G(p.Asn1483Lys)为新发错义突变,丰富了DMD基因突变谱,为该家系遗传咨询和产前诊断提供了有价值的信息。(本文来源于《中国现代神经疾病杂志》期刊2019年05期）
白雪寒[9]（2019）在《错义突变MTUS1通过微管相关通路影响心肌致密化过程的机制研究》一文中研究指出目的:探讨微管相关错义突变基因微管相关肿瘤抑制因子1(Microtubule-associated tumor suppressor 1,MTUS1)在心肌致密化发生过程中的作用,初步阐述心肌致密化不全的遗传学发生机制。方法:首先在CP15-5a细胞系水平构建过表达慢病毒突变组LV-M-MTUS1、野生组LV-W-MTUS1及空载组CON,采用RT-PCR技术检测各组MTUS1及小GTP酶RhoA(ras homolog family member A,RhoA)的mRNA表达水平,Western blot技术检测各组RhoA蛋白表达水平,细胞免疫荧光技术检测各组α-tubulin荧光表达强度,并对各组细胞进行细胞划痕实验,检测其细胞迁移情况;其次在HEK-293细胞系水平构建过表达慢病毒突变组LV-M-MTUS1、野生组LV-W-MTUS1及空载组CON,采用RT-PCR技术检测各组MTUS1 mRNA表达水平,细胞免疫荧光技术检测各组α-tubulin、α/β-tubulin及极性蛋白PAR6的荧光表达强度及细胞定位情况,同时根据α-tubulin荧光结果检测HEK-293细胞分裂期子代细胞纺锤体到胞膜的距离及分裂后子代细胞大小,Western blot技术检测各组Rac1/Cdc42蛋白磷酸化表达水平。结果:成功构建过表达慢病毒突变组、野生组及空载组CP15-5a及HEK-293细胞模型;在CP15-5a细胞模型中,突变组与野生组相比,细胞α-tubulin荧光强度表达下降(P<0.01),细胞内α-tubulin较稀疏、紊乱。与野生组相比,突变组RhoA的mRNA及蛋白表达水平明显增高(P<0.01)。划痕实验结果显示,与野生组相比,在划痕后6 h、12 h突变组细胞迁移速率增快(P<0.01);在HEK-293细胞模型中,突变组及野生组MTUS1 mRNA表达明显升高(P<0.05);突变组与野生组相比,细胞α-tubulin荧光强度表达下降(P<0.01),作为运输作用的α/β-tubulin荧光强度表达升高(P<0.01),并且在细胞质内有浓聚的表现;同时极性蛋白PAR6在突变组细胞内表达增加(P<0.01),定位更偏向细胞膜侧;根据α-tubulin细胞免疫荧光结果,突变组分裂期子代细胞纺锤体到胞膜的距离差值较野生组的距离差值明显增加(P<0.01),并且突变组分裂末期的子代细胞体积较野生组明显增加(P<0.01);突变组与野生组相比,磷酸化Rac1/Cdc42蛋白表达下降(P<0.01)。结论:在CP15-5a细胞模型中,错义突变MTUS1能够降低细胞微管稳定性,并通过升高RhoA mRNA及蛋白水平,进而影响细胞迁移能力;在HEK-293细胞模型中,错义突变MTUS1影响α-tubulin表达,降低细胞微管稳定,进而影响细胞极性分裂情况,其可能的作用机制是微管稳定性降低后,进一步降低Rac1/Cdc42磷酸化蛋白水平,使调控运输的α/β-tubulin蛋白表达增加,促进PAR6蛋白从胞质运输至胞膜位置,导致细胞极性分裂趋势增加;综上,错义突变MTUS1可促进心肌致密化的进程,从而降低或者缓解心肌致密化不全的发生风险,是心肌致密化不全发生的保护性突变。(本文来源于《重庆医科大学》期刊2019-05-01）
孙海洋[10]（2019）在《癌症驱动错义突变预测方法的比较分析和性能提升初步研究》一文中研究指出癌症作为一种人类复杂遗传疾病,一般是由基因组上不断累积的大量突变所导致。在众多突变中,仅有一小部分突变对于癌症的发生发展起到关键作用,这些突变被称为驱动突变。驱动突变的发生会显着改变正常细胞的分子运行系统,并且刺激肿瘤细胞的生长。由于癌症基因组的不稳定性,通常驱动突变的发生会伴随着大量的乘客突变,这些乘客突变一般不会参与癌症的发生发展以及治疗等过程。考虑到驱动突变是作为癌症的诊断和预后的分子标志,并且是癌症相关药物的研发或者作用的靶标,所以从癌症基因组上众多的突变中识别出驱动突变是非常重要的。错义突变是基因组上数量最多的一种突变,目前已有多种策略用于预测癌症驱动错义突变。第一种策略是通过传统生物学实验方法鉴定驱动突变,但是比较耗时耗力,难以处理和挖掘众多测序项目产生的海量突变数据。第二种策略是通过统计学方法发现驱动突变,但是需要较大数量级的癌症样本,一般难以获取到。最后一种策略是基于序列位点保守性,蛋白质结构与功能等特征开发相关算法,预测对癌症发生发展有功能影响的驱动突变。目前已经有很多算法用于预测癌症驱动错义突变,这些预测算法有着不同的设计特点。已有的关于癌症驱动错义突变预测算法评估性研究工作指出不同类别预测算法存在着预测偏向性问题,并提出了集成不同预测工具的解决方案,但是没有对造成不同预测工具预测偏向性的原因进行深层次地分析。通过标准测试集(癌症相关、有代表性、非冗余)上的实验结果,本文参照模型的设计方法系统地对不同类别的突变预测工具的预测性能进行了评估和分析。根据评估结果,构建了基于高质量负样本的癌症驱动错义突变预测模型。本文的主要工作如下。1.分析比较了现有错义驱动突变预测工具,在多套标准测试集的预测结果表明,癌症特异性突变预测工具比广谱性疾病突变预测工具对负样本预测性能较差。本文共获取34种错义驱动突变预测工具(包括5种保守性分数预测方法),基于6套标准测试集对这些突变预测工具的预测性能进行了比较分析。根据对癌症特异性突变预测工具和广谱性疾病突变预测工具的评估,癌症特异性突变预测工具相比广谱性疾病突变预测工具表现了较低的综合预测能力,主要原因是其对负样本的预测能力较差,有待提升。2.提出了一种基于高质量负样本数据集的驱动错义突变预测方法,建立了驱动错义突变预测模型CMMPred(Cancer Missense Mutation Predictor)。训练集的正样本和负样本分别来源于COSMIC和dbCPM数据库。借助CRAVAT工具,本文为所有样本编码生成85维特征,并基于XGBoost算法建立了CMMpred模型。在独立测试集上,CMMPred的AUC、Sensitivity和Specificity分别为0.77、0.75和0.66,比紧随其后的PolyPhen2工具在AUC上高出7个百分点,表现了比其他所有工具更好的综合预测能力。实验结果说明经过人工注释的高质量乘客突变有效提升了癌症驱动错义突变预测性能。(本文来源于《安徽大学》期刊2019-05-01）
错义突变论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:分析一例乙型血友病(HemophiliaB,HB)家系的遗传学病因。方法:采用凝固法检测先证者及其家系成员凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血酶时间(APTT)、凝血酶时间(TT),免疫比浊法检测D-二聚体浓度;采用血液分析仪检测血红蛋白(Hb)含量,发色底物法检测凝血因子Ⅸ(F9)活性,采用PCR-Sanger测序法分析HB的关键致病基因F9基因序列并进行突变分析。结果:先证者Hb含量降低,凝血功能示APTT延长,D-二聚体增高,F9活性明显下降;先证者母亲及女儿APTT及F9活性分别有不同程度的延长和降低,其父亲、妹妹和哥哥的APTT及F9活性正常。测序结果显示该家系先证者携带F9基因半合子错义突变c.289T>G(p.Cys97Gly),为首次发现的变异位点,先证者母亲及女儿各携带杂合突变。结论:F9基因第4外显子c.289T>G(p.Cys97Gly)半合子变异可能为HB致病性变异。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
错义突变论文参考文献
[1].吕永楠,王京伟.NEBL基因错义突变导致扩张型心肌病一家系研究[J].疑难病杂志.2019
[2].王京伟,李艳,乔斌,熊亮.凝血因子Ⅸ基因新发错义突变致乙型血友病一例家系分析[J].微循环学杂志.2019
[3].彭玲,陈婷,吴补领.DSP错义突变(G>A)导致非综合征型先天缺牙的功能研究[C].2019年中华口腔医学会老年口腔医学专业委员会第十四次全国老年口腔医学学术年会论文汇编.2019
[4].吕昕,王红艳,张斌.TGFBR3错义突变与先天性心脏病遗传关联性研究[J].中国循证儿科杂志.2019
[5].汤斌,周鹏,李斌,何娜.叁种生物信息学软件对癫痫相关SCN1B错义突变的预测性能评估[J].临床医学工程.2019
[6].郭芮吉,韩刚,方霞,孙滨,崔恒庆.GNAS新错义突变导致D/E型短指畸形[J].组织工程与重建外科杂志.2019
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[8].高云轻,欧俐羽,李亚勤,利婧,林金福.DMD基因新发错义突变致Becker型肌营养不良症一家系临床表型及基因突变分析[J].中国现代神经疾病杂志.2019
[9].白雪寒.错义突变MTUS1通过微管相关通路影响心肌致密化过程的机制研究[D].重庆医科大学.2019
[10].孙海洋.癌症驱动错义突变预测方法的比较分析和性能提升初步研究[D].安徽大学.2019
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