基于网络药理学黄芩-黄连药对治疗2型糖尿病作用机制探讨

基于网络药理学黄芩-黄连药对治疗2型糖尿病作用机制探讨

论文摘要

目的探讨黄芩-黄连药对治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索黄芩、黄连的化学成分和作用靶点,通过OMIM、TTD、Drugbank、Digsee等多个数据库查询与T2DM相关的基因。通过Uni Prot数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape3.2.1构建化合物-靶点(基因)网络、蛋白相互作用(PPI)网络筛选出核心靶点,最后通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,研究其作用机制。结果化合物-靶点网络包含42个化合物和相应靶点213个,关键靶点涉及PTGS2、PTGS1、HSP90AA1、HSP90AB1、NOS2等。PPI核心网络包含15个蛋白,关键蛋白涉及TNF、IL6、INSR等。GO功能富集分析得到GO条目108个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目87个,分子功能(CC)条目9个,细胞组成(MF)条目12个。KEGG通路富集筛选得到24条信号通路(P<0.05),涉及胰岛素抵抗通路、T2DM通路、胰岛素信号传递通路等。结论黄芩-黄连中的活性成分主要通过DPP4、PPARG、IL6、PPARD、TNF等靶点调节炎症细胞因子、作用于胰岛素受体协同治疗T2DM。

论文目录

  • 1 方法
  •   1.1 黄芩、黄连成分收集
  •   1.2 活性化合物及靶标蛋白的筛选
  •   1.3 疾病靶点的筛选
  •   1.4 靶标蛋白基因名的确定及化合物-靶点网络的构建
  •   1.5 蛋白质相互作用网络 (PPI) 的构建及其核心网络的筛选
  •   1.6 核心靶点的通路分析
  • 2 结果
  •   2.1 活性化合物的筛选
  •   2.2 化合物-靶点相互作用网络
  •   2.3 黄芩、黄连与T2DM的交集基因
  •   2.4 黄芩、黄连与2型糖尿病蛋白质相互作用核心网络 (PPICN) 的构建与筛选
  •   2.5 靶点通路分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 宗阳,董宏利,陈婷,颜帅,江国荣

    关键词: 黄芩,黄连,型糖尿病,网络药理学,靶点,基因,信号通路

    来源: 中草药 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 中药学

    单位: 苏州市吴门医派研究院,苏州市中医医院肛肠科

    基金: 江苏省青年医学人才项目(QNRC2016252),苏州市中医医院院级课题(YQN2017004)

    分类号: R285

    页码: 888-894

    总页数: 7

    文件大小: 715K

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