刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因的鉴定及序列分析

刺齿报春苣苔肌醇半乳糖苷合成酶基因的鉴定及序列分析

论文摘要

肌醇半乳糖苷合成酶基因与植物光合产物运输、种子耐脱水性、抵御生物与非生物胁迫和自我保护等生理生化过程密切相关。基于刺齿报春苣苔(Primulina spinulosa)转录组测序数据,获得(鉴定)1个肌醇半乳糖苷合成酶基因。序列分析结果表明,该基因全长1 347 bp(GenBank登录号为MG521418),开放阅读框(ORF)为1 008 bp,共编码335个氨基酸。进一步基于氨基酸序列的分析表明,该基因编码的蛋白质分子量为38.05 ku,理论等电点为5.09,为亲水性蛋白,含有1个与糖基转移酶家族蛋白相同的保守结构域;刺齿报春苣苔的肌醇半乳糖苷合成酶基因与同科的旋蒴苣苔(Boea hygrometrica,FJ222452)的相似性高达90%,两者在系统进化树上聚为1支。研究结果为进一步研究刺齿报春苣苔的肌醇半乳糖苷合成酶基因的分子结构和功能奠定了基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 RNA的提取、建库和测序
  •     1.2.2 序列分析和系统树构建
  • 2 结果与分析
  •   2.1 基因的生物信息学分析
  •   2.2 编码蛋白质的分析和疏水性预测
  •   2.3 功能结构域的分析
  •   2.4 跨膜预测
  •   2.5 蛋白质的磷酸化预测
  •   2.6 糖基化位点和信号肽的分析
  •   2.7 蛋白质的二级结构及三级结构预测
  •   2.8 系统发育分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 覃信梅,卢永彬,江祈贵,黄章平,黄夕洋

    关键词: 刺齿报春苣苔,肌醇半乳糖苷合成酶基因,基因序列分析,信号肽

    来源: 江苏农业科学 2019年08期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 广西师范大学生命科学学院,广西植物功能物质研究与利用重点实验室/广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所,广西喀斯特植物保育与恢复生态学重点实验室/广西壮族自治区中国科学院广西植物研究所

    基金: 广西自然科学基金(编号:2015GXNSFAA139090),广西喀斯特恢复与保护重点实验室基金(编号:16-380-32),广西喀斯特植物保育与恢复生态学重点实验室基金(编号:18-A-01-03)

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2019.08.012

    页码: 56-60

    总页数: 5

    文件大小: 1993K

    下载量: 93

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