烟草‘云烟87’叶片衰老中WRKY转录因子的表达及功能预测

论文摘要

WRKY基因家族是一类含有WRKY保守结构域的转录因子(transcription factors, TFs),在植物的生长发育、胁迫应答等过程中起着重要的作用。目前,已在多种植物中鉴定了WRKY基因家族,但是研究烟草中与发育相关的WRKY转录因子功能预测并不多。本研究通过对旺长期(P)、成熟期(M)、衰老1期(M1)、衰老2期(M2)的烟草叶片进行转录组测序,共获得122个WRKY转录因子。利用多种生物信息学软件对家族成员进行了去冗余处理后得到26条WRKY转录因子,进行结构域分析、家族分析、系统进化树分析,结果显示,可将26个候选NtWRKY蛋白分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ3个亚家族。通过表达量分析显示,在3个亚家族中与逆境胁迫功能相关的WRKY转录因子多与叶片衰老存在正相关,可以预测为衰老相关基因。本研究不仅为研究普通烟草WRKY转录因子在调控生长发育过程中的作用提供了相关的科学依据,也为进一步分析烟草WRKY基因提供了有价值的信息和表达研究。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 张柳,何晓健,林春,李军营,杨焕文,毛自朝

关键词: 转录因子,叶片衰老,转录组

来源: 分子植物育种 2019年08期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,农作物

单位: 云南农业大学农学与生物技术学院,云南省烟草农业科学研究院,云南农业大学烟草学院

基金: 国家烟草专卖局项目(Ts-03-20110024),中国烟草总公司云南省科技项目(09YN02,2011YN03)共同资助

分类号: Q943.2;S572

DOI: 10.13271/j.mpb.017.002423

页码: 2423-2432

总页数: 10

文件大小: 1809K

下载量: 178

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