梯度凝胶电泳论文_李峪鹏,许祯莹,李娟,苏志鹏,刘瀚扬

导读:本文包含了梯度凝胶电泳论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:梯度,电泳,凝胶,微生物,金丝猴,胃肠道,肠道。

梯度凝胶电泳论文文献综述

李峪鹏,许祯莹,李娟,苏志鹏,刘瀚扬[1](2019)在《变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术在分析动物肠道菌群多样性中的应用》一文中研究指出变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术在16S rRNA分析技术的基础上进一步对微生物多样性进行分析,具有重复性好,快速高效检测突变DNA片段的优点。PCR-DGGE技术对于动物肠道菌群引导转化、细菌性疾病的防治和肠道菌群结构的研究等具有重要的意义。本文主要介绍了PCR-DGGE技术的基本分析方法与应用。(本文来源于《四川畜牧兽医》期刊2019年11期)

王新,汤江武,吴逸飞,姚晓红,孙宏[2](2019)在《基于混合培养和PCR-变性梯度凝胶电泳的复合净水功能菌群构建》一文中研究指出以11株具有不同净水功能的菌株为出发菌株,采用液体共培养的方法,应用PCR-变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析混合培养物中的菌群变化,确定这些菌株的共存能力和生长特性。以混合培养中的优势菌株为核心形成不同菌群组合,确定复配菌株组合,并通过净水实验确定其净水功能。结果显示,菌株AOZ1或BSK9、W14或BSK3在混合培养条件下可以有效生长,是混合培养的优势功能菌。以菌株AOZ1或BSK9为核心菌株,与其他功能菌组合可构建形成复合净水功能菌。其中,由AOZ1、BSK9、W14和BSK3组成的复合菌对河道污水中的化学需氧量(COD)和氨氮具有较高的去除率,分别达到48.0%和76.8%。结果表明,采用PCR-DGGE监测下的液体共培养方法,可有效构建净水复合菌群。(本文来源于《浙江农业学报》期刊2019年11期)

胡芹宝,张荟,吕铭,张新创[3](2019)在《变性梯度凝胶电泳在实验小鼠细菌检测中的应用》一文中研究指出目的研究变性梯度凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis, DGGE)在实验小鼠细菌检测中的应用。方法根据16S rDNA V3区引物,PCR扩增3种实验小鼠(KM小鼠、NIH小鼠和BALB/c小鼠)呼吸道和盲肠段的细菌基因组DNA;扩增产物运用DGGE进行电泳检测,并分析条带数量间差异的统计学意义。结果 KM小鼠盲肠段条带12~18条,呼吸道条带5~10条;NIH小鼠盲肠段条带15~20条,呼吸道条带4~10条;BALB/c小鼠盲肠段条带10~15条,呼吸道条带0~7条。统计分析结果显示,KM小鼠和NIH小鼠在盲肠和呼吸道电泳条带数量上的差异无统计学意义(P>0.05);BALB/c小鼠与KM小鼠、NIH小鼠间的差异均有统计学意义(P<0.05)。结论 DGGE在实验小鼠盲肠和呼吸道细菌检测中能较好地反映菌群的物种多样性。(本文来源于《微生物学免疫学进展》期刊2019年05期)

曾燕,牛李丽,邓家波,王强,余建秋[4](2018)在《聚合酶链式反应——变性梯度凝胶电泳技术分析1只死亡野生川金丝猴胃肠道菌群多样性》一文中研究指出引言川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)是我国特有的国家一级保护动物,群栖于高山密林中,以植物性食物为主~([3])。随着人类活动的增多,川金丝猴的栖息地受到严重破坏,加上环境因素以及少量天敌的影响,其数量不断减少。胃肠道微生物的研究和利用也是目前野生动物繁殖及种群保护的重要措施。本文旨在运用PCR-DGGE技术研究1只死亡野生川金丝猴胃肠道菌群的多样性,以(本文来源于《中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第五届第十叁次全国学术研讨会论文集》期刊2018-11-16)

董蕴,王玉荣,王尧,廖华,赵慧君[5](2018)在《基于变性梯度凝胶电泳和MiSeq高通量测序技术分析恩施地区腊肉的细菌多样性》一文中研究指出以采集自湖北省恩施地区的5个腊肉样品为研究对象,采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(polymerase?chain?reaction-denatured?gradient?gel?electrophoresis,PCR-DGGE)与MiSeq高通量测序技术相结合的方法对其中所含微生物的多样性进行解析。PCR-DGGE结果表明,腊肉样品中的细菌主要为葡萄球菌属(Staphylococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)和假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas);MiSeq高通量测序结果表明,腊肉中的细菌门主要为硬壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria),其平均相对含量分别为54.05%和44.28%,细菌属主要为葡萄球菌属(Staphylococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)、假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)、环丝菌属(Brochothrix)、科贝特氏菌属(Cobetia)和不动细菌属(Acinetobacter),其平均相对含量分别为40.18%、24.02%、9.37%、8.53%、4.71%和2.31%;在分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)水平上,发现252个核心OTU,累计平均相对含量高达74.22%。由此可见,PCR-DGGE和MiSeq高通量测序的结果综合分析得出恩施地区腊肉中的细菌主要为葡萄球菌属(Staphylococcus)、嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas)。(本文来源于《肉类研究》期刊2018年10期)

杨向莹,高静,畅晓晖,石嵩,张惠媛[6](2018)在《变性梯度凝胶电泳技术在食源性沙门氏菌分子分型中的应用研究》一文中研究指出目的建立基于变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术的沙门氏菌分型方法。方法以5株代表性沙门氏菌为供试菌,用引物对GC-rpoB1/ropB3R扩增获得目的片段后,经变性凝胶电泳分离获得谱图,量化分析谱带多样性及均一性,依据菌株谱图量化相似性构建聚类分析图,分析该技术用于沙门氏菌分型的可行性。结果 5个供试菌的PCR-DGGE谱图差异大,其中以标准菌株肠炎沙门氏菌(ATCC9184)的多样性及丰富度最高,标准菌株鼠伤寒沙门氏菌的最低;就谱带相似性而言,分离自鸭腿样品的2株沙门氏菌的相似性最高,戴斯系数高达85.7%,而分属于不同血清型的两个标准菌株则相似度指数为0%;基于谱带相似性建立的聚类树可将供试菌株很好地分为不同簇。结论本研究所建立的基于PCR-DGGE技术的沙门氏菌分型方法准确度和分辨力均较理想,具有一定的理论及实际意义。(本文来源于《食品安全质量检测学报》期刊2018年19期)

冯敏,吴红艳,王志学,郭玲玲,李赞[7](2018)在《用于分析土壤微生物结构变化规律的变性梯度凝胶电泳条件研究》一文中研究指出研究确定土壤微生物基因组DNA提取方法、PCR扩增条件、DGGE电泳条件,为进一步研究分析土壤中微生物结构变化规律提供理论依据。土壤微生物基因组DNA提取采用直接法和间接法进行比较; PCR扩增条件调整扩增体系、DGGE电泳条件调整变性剂范围,并对其结果进行比较分析。通过对DGGE电泳相关条件的研究,结果显示,土壤中粗基因组DNA采用直接法提取,然后进行纯化; PCR扩增体系中加入BSA,DGGE电泳系统组成中变性剂浓度范围为35%~55%。确定了土壤微生物基因组DNA提取方法、PCR扩增条件、DGGE电泳条件,为后续的相关研究提供理论依据。(本文来源于《微生物学杂志》期刊2018年05期)

唐欢,范文奇,周理坤,王春[8](2018)在《基于聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳法的博物馆展厅空气细菌群落动态监测》一文中研究指出目的了解博物馆展厅内空气中细菌数量和种类的动态变化。方法于2015年6月至2017年5月连续24个月在博物馆同一展厅同一位置进行空气微生物采样,采用培养法对空气微生物菌落总数进行检测,并进一步采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳法(PCR-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)对空气中细菌的组成种类进行分析。结果监测的两年间展厅空气中细菌数量有波动,菌落总数为78~616 CFU/m~3之间,主要种类有5~15种,种类变化存在季节性差异。马胃葡萄球菌(Staphylococcus equorum)、铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)、溶血性葡萄球菌(Staphylococcus hominis)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)在24个月内均有检出,且未随季节和人员的不同而变化。结论持续两年的监测显示博物馆展厅空气中细菌在种类和数量上呈现季节性变化,但已在一定程度上形成稳态。(本文来源于《环境与健康杂志》期刊2018年06期)

张柏岳,瞿慧琴,田维毅[9](2018)在《变性梯度凝胶电泳法分析黄柏对大鼠胃肠道菌群的影响》一文中研究指出目的:应用DGGE技术分析黄柏对大鼠胃、十二指肠、空肠、回肠、结肠部位菌群数量的影响,为探索黄柏的肠菌群调节作用积累数据。方法:饲养大鼠共72只,黄柏水煎液分高、中、低剂量进行灌胃,其中空白对照组18只。分别在第一、二、叁周时采集大鼠胃、十二指肠、空肠、回肠、结肠各段(含内容物),提取细菌基因组DNA,应用DGGE技术分析各样本不同给药时间下菌群数量的变化。结果:在黄柏作用的影响下,胃部低剂量组一周,中剂量组叁周及高剂量组二周叁周与空白组差异较明显(P<0.05);十二指肠低剂量组一周,低、中、高剂量组第叁周较空白组有明显差异(P<0.05);空肠部位低、中、高剂量组第叁周较空白组有明显差异(P<0.05);回肠部位低剂量组二、叁周,中剂量组一、二、叁周及高剂量组一周较空白组有明显差异(P<0.05);结肠部位中剂量组一、二、叁周较空白组有明显差异(P<0.05)。结论:黄柏长期给药对大鼠十二指肠部位菌群多样性起抑制作用,对胃、空肠、回肠及结肠部位的菌群多样性起到一定促进作用。(本文来源于《贵阳中医学院学报》期刊2018年03期)

曾燕,牛李丽,邓家波,王强,余建秋[10](2018)在《聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术分析1只死亡野生川金丝猴胃肠道菌群多样性》一文中研究指出本试验旨在对1只死亡野生川金丝猴的胃肠道菌群多样性及其克隆测序条带的系统进化树进行分析。取死亡野生川金丝猴胃肠道内容物,进行聚合酶链式反应(PCR)-变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析,结合条带的克隆测序、聚类分析和主成分分析(PCA)检测菌群多样性并构建系统进化树。结果显示:1)野生川金丝猴整个胃肠道栖息着大量细菌,且来自胃、小肠的样品聚为一大簇,来自大肠的样品聚为一簇,而来自粪便的样品单独聚为一簇。2)从DGGE图谱上共回收18个条带,细菌种类鉴定主要是5个菌门,分别为变形菌门(Proteobacteria,38.89%)、厚壁菌门(Firmicutes,22.22%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,5.56%)、放线菌门(Actinobacteria,5.56%)、疣微菌门(Verrucomicrobia,5.56%)和不可培养菌(uncultured bacterium,22.22%)。其中,变形菌门和厚壁菌门分布于整个胃肠道。3)菌群的系统进化树分析表明,仅有1种不可培养菌与已鉴定的粪肠球菌进化分类相似,而其他不可培养菌与已知的菌种进化分支差异较大,说明在野生川金丝猴的胃肠道中仍有大量的菌群信息未被鉴定。结果提示,本试验测定的1只死亡野生川金丝猴的胃肠道优势菌群为变形菌门,菌群多样性随着胃肠道由前至后的顺序呈现高—低—高的趋势。(本文来源于《动物营养学报》期刊2018年02期)

梯度凝胶电泳论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

以11株具有不同净水功能的菌株为出发菌株,采用液体共培养的方法,应用PCR-变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析混合培养物中的菌群变化,确定这些菌株的共存能力和生长特性。以混合培养中的优势菌株为核心形成不同菌群组合,确定复配菌株组合,并通过净水实验确定其净水功能。结果显示,菌株AOZ1或BSK9、W14或BSK3在混合培养条件下可以有效生长,是混合培养的优势功能菌。以菌株AOZ1或BSK9为核心菌株,与其他功能菌组合可构建形成复合净水功能菌。其中,由AOZ1、BSK9、W14和BSK3组成的复合菌对河道污水中的化学需氧量(COD)和氨氮具有较高的去除率,分别达到48.0%和76.8%。结果表明,采用PCR-DGGE监测下的液体共培养方法,可有效构建净水复合菌群。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

梯度凝胶电泳论文参考文献

[1].李峪鹏,许祯莹,李娟,苏志鹏,刘瀚扬.变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术在分析动物肠道菌群多样性中的应用[J].四川畜牧兽医.2019

[2].王新,汤江武,吴逸飞,姚晓红,孙宏.基于混合培养和PCR-变性梯度凝胶电泳的复合净水功能菌群构建[J].浙江农业学报.2019

[3].胡芹宝,张荟,吕铭,张新创.变性梯度凝胶电泳在实验小鼠细菌检测中的应用[J].微生物学免疫学进展.2019

[4].曾燕,牛李丽,邓家波,王强,余建秋.聚合酶链式反应——变性梯度凝胶电泳技术分析1只死亡野生川金丝猴胃肠道菌群多样性[C].中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第五届第十叁次全国学术研讨会论文集.2018

[5].董蕴,王玉荣,王尧,廖华,赵慧君.基于变性梯度凝胶电泳和MiSeq高通量测序技术分析恩施地区腊肉的细菌多样性[J].肉类研究.2018

[6].杨向莹,高静,畅晓晖,石嵩,张惠媛.变性梯度凝胶电泳技术在食源性沙门氏菌分子分型中的应用研究[J].食品安全质量检测学报.2018

[7].冯敏,吴红艳,王志学,郭玲玲,李赞.用于分析土壤微生物结构变化规律的变性梯度凝胶电泳条件研究[J].微生物学杂志.2018

[8].唐欢,范文奇,周理坤,王春.基于聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳法的博物馆展厅空气细菌群落动态监测[J].环境与健康杂志.2018

[9].张柏岳,瞿慧琴,田维毅.变性梯度凝胶电泳法分析黄柏对大鼠胃肠道菌群的影响[J].贵阳中医学院学报.2018

[10].曾燕,牛李丽,邓家波,王强,余建秋.聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术分析1只死亡野生川金丝猴胃肠道菌群多样性[J].动物营养学报.2018

论文知识图

样品取样点平面图堆肥过程中NH4+-N与NO3--N的变化部分堆肥样品总DNA提取效果操作流程1 各处理组的乳酸杆菌梯度凝胶电泳不同时间堆肥PCR扩增产物的变性梯度

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