论文摘要
[目的]比较不同DNA提取前处理方法对太岁表层组织细菌结构的影响。[方法]设水浸提(SO1)、浸提后热溶解(SO2)、直接热溶解(SO3)与微孔过滤结合的3种处理法,高通量测序。[结果]SO1、SO2、SO3的Shannon指数均接近4. 44,OTU数目均接近1 677个,共有OTU 807个,序列占比95. 65%。所含细菌在各分类水平上数目相近,各涉及约20个门、200多个属,优势类群集中在未分类属(unclassified)、假单胞菌属(Pseudomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)和Povalibacter 4个属,占比之和超过了60%。除未分类属外的三个属,均各有一种超高占比OTU支撑。假单菌属占比最高,各处理均为21%左右。[结论]3种前处理方法测得的细菌菌群结构,均表明太岁表层组织中细菌种类多,分布不平衡,假单胞菌属是占比21%的最优势属。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 王朝江,李慧,王世清,高春燕,李聪
关键词: 太岁,表层组织,提取前处理,细菌菌群结构
来源: 生物技术 2019年05期
年度: 2019
分类: 基础科学
专业: 生物学
单位: 河北省农林科学院遗传生理研究所
基金: 河北省农林科学院农业科技创新工程项目(No.2019-2-5-3)
分类号: Q938
DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2019.05.0077
页码: 463-469
总页数: 7
文件大小: 230K
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