论文摘要
为了获得锤胁跷蝽(Yemma signatus Hsiao)触角基因信息,本研究使用Illumina HiSeq TM 4 000高通量测序技术对锤胁跷蝽成虫触角进行转录组测序和生物学信息分析。共获得61 080 938条clean reads,包括9.16 G (GenBank登录号:SRR3348966)。拼接115 491条unigenes,平均长度为578 bp,N50为863 bp。在7大数据库中注释到46 224条unigenes,其中在NR数据库中注释的基因最多,为32 842 (28.43%)条,与内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)相似度最高(9.0%)。转录组数据分析鉴定出125个与嗅觉相关的基因,其中66个嗅觉受体、11个味觉受体、1个离子型受体、3个感觉神经元膜蛋白、30个气味结合蛋白和14个化学感受蛋白基因。本研究首次获得锤胁跷蝽触角转录组数据,并鉴定出嗅觉相关基因,本研究为今后利用嗅觉基因靶标防治害虫提供了分子生物学信息数据。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 宋月芹,孙会忠
关键词: 锤胁跷蝽,触角转录组,高通量测序,基因注释,嗅觉相关基因
来源: 基因组学与应用生物学 2019年02期
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学
单位: 河南科技大学林学院
基金: 国家自然科学基金项目(31701788),河南科技大学博士启动基金(13480047)共同资助
分类号: Q963
DOI: 10.13417/j.gab.038.000545
页码: 545-550
总页数: 6
文件大小: 326K
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