黑腹果蝇头部响应高盐摄入的基因可变剪接分析

黑腹果蝇头部响应高盐摄入的基因可变剪接分析

论文摘要

高盐摄入不仅会带来高血压、糖尿病、自身免疫病等风险,而且会对大脑产生负面影响。可变剪接(Alternative Splicing,AS)作为基因表达调控的重要方式,其导致单个基因编码多种蛋白质,大大增加基因组编码的蛋白质的多样性,参与几乎所有的生物学过程。但是,关于高盐摄入是否改变神经系统中基因的可变剪接事件目前还未报道。本文以黑腹果蝇作为材料,利用RNA测序分析其头部响应高盐摄入的基因可变剪接变化。结果发现高盐摄入改变黑腹果蝇头部信号转导、离子稳态、离子通道活性、离子转运和钙调蛋白结合等重要信号相关基因的可变剪接。进一步分析具体发生变化的基因的功能,发现它们在多个层面对神经系统功能的调控起着重要的作用。该研究证明高盐摄入改变神经系统重要基因的可变剪接,为理解高盐摄入对神经系统的影响提供更多的依据和线索。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 果蝇培养及处理
  •   1.2 测序样品准备及测序分析
  •   1.3 测序数据的质量控制分析
  •   1.4 测序结果比对分析
  •   1.5 差异可变剪切的识别分析
  •   1.6 差异可变剪切的qPCR鉴定
  •   1.7 差异可变剪切的GO功能富集分析
  •   1.8 数据统计分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 测序数据质量评价与分析
  •   2.2 测序结果比对分析
  •   2.3 高盐摄入后果蝇头部可变剪接事件鉴定
  •   2.4 高盐摄入后果蝇头部AS基因的GO功能富集分析
  • 3 结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 谢甲钰,王丹凤,陈文锋

    关键词: 高盐摄入,黑腹果蝇,头部,可变剪接

    来源: 环境昆虫学报 2019年06期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学,预防医学与卫生学

    单位: 福州大学生物科学与工程学院,福建农林大学应用生态研究所

    基金: 国家自然科学基金(31970461,31601894),福建省自然科学基金(2017J0106)

    分类号: Q78;R151.41

    页码: 1329-1338

    总页数: 10

    文件大小: 1131K

    下载量: 66

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