DNA条形码在热带龙脑香科树种鉴定中的应用

论文摘要

龙脑香科植物是东南亚地区重要的热带木材来源树种,对其开展DNA条形码评估在林业监管及森林资源保护等方面具有非常重要的实际应用价值。通过对龙脑香科植物样品进行rbcL、matK、trnL-trnF和ITS2四个片段的扩增和测序,结合GenBank下载的数据,共获得龙脑香科树种14属244种共计899条序列。通过比较4个片段的通用性、序列特征、种内和种间的遗传变异,基于Best Match （BM）、Best Close Match （BCM）、相似性搜索算法（BLAST）和邻接树（NJ） 4种方法评估DNA条形码对于龙脑香科树种的鉴定能力。结果表明,ITS2在龙脑香科树种中鉴定效率最高,通过优化的扩增体系能够从该科植物叶片中获得较高质量的ITS2片段;叶绿体matK片段扩增和测序效率为100%,且种内及种间遗传变异明显,鉴定成功率高于其它叶绿体片段,并据此提出ITS2和matK适合作为龙脑香科树种的DNA条形码。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 胡建霖,刘志芳,慈秀芹,李捷

关键词: 龙脑香科,条形码,热带地区

来源: 植物学报 2019年03期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心植物系统发育与保护生物学实验室,中国科学院大学

基金: 中国科学院战略生物资源服务网络计划生物多样性保护策略(No.ZSSD-013),中国科学院东南亚生物多样性中心资助(No.Y4ZK111B01)

分类号: Q949.758.6

页码: 350-359

总页数: 10

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标签：龙脑香科论文;  条形码论文;  热带地区论文;