16S rRNA基因测序分析技术在食品污染菌监测中的应用

16S rRNA基因测序分析技术在食品污染菌监测中的应用

论文摘要

目的将16S rRNA基因测序分析技术应用于食品安全风险监测中非目标(相似、少见或非典型)致病菌的鉴定,为食源性疾病防控提供更多病原学证据。方法采集18份畜类、18份禽类和9份鱼类共45份生鲜样品,目标致病菌按照GB4789标准检测,非目标菌进行16S rRNA基因测序,将全长序列在GenBank中比对确定细菌种属,通过MEGA6构建细菌16S rRNA基因进化树,判定细菌种属间的亲缘关系。结果 45份生鲜样品中检出19株目标致病菌,包括沙门氏菌、空肠弯曲菌、单增李斯特菌和副溶血弧菌,而34株非目标菌16S rRNA基因全长序列能分别比对出13种细菌,其中8种19株菌属于致病或条件致病菌,包括霍乱弧菌、溶藻弧菌、结肠弯曲菌、奇异变形杆菌、粪肠球菌和铜绿假单胞菌,以及在深圳乃至省内首次报道的布氏弓形菌和海藻希瓦氏菌。结论深圳市售生鲜食品受到多种食源性致病菌污染,特别是非目标检出的致病菌,对此认为16S rRNA基因测序分析技术是一套有效的细菌监测适宜技术,能提高食源性疾病和食物中毒的防控水平。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 样品种类与来源
  •     1.1.2 样品采集与运送
  •     1.1.3 主要仪器及试剂
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 目标致病菌检测方法和结果评价
  •     1.2.2 细菌16S rRNA基因PCR扩增
  •     1.2.3 扩增产物电泳分析
  •     1.2.4 测序与序列比对
  •     1.2.5 构建系统发育树
  • 2 结 果
  •   2.1 非目标菌的16S rRNA基因测序分析
  •   2.2 生鲜食品中目标与非目标致病菌污染情况
  • 3 讨 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 胡鹏威,刘楚云,何娇明,张祥,袁月明,袁梦,段永翔

    关键词: 食品监测,食源性致病菌,基因测序,分子鉴定

    来源: 现代预防医学 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,工程科技Ⅰ辑

    专业: 轻工业手工业,预防医学与卫生学

    单位: 深圳市南山区疾病预防控制中心微生物检验科

    基金: 深圳市",医疗卫生三名工程",细菌感染性疾病检测及监测项目(SZSM201803081)

    分类号: R155.5

    页码: 2028-2031+2101

    总页数: 5

    文件大小: 1963K

    下载量: 303

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